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Familia de proteínas del centro de reacción fotosintética

Las proteínas del centro de reacción fotosintética son los principales componentes proteicos de los centros de reacción fotosintética (CR) de bacterias y plantas. Son proteínas transmembrana incrustadas en el tilacoide del cloroplasto o en la membrana celular bacteriana.

Las plantas, las algas y las cianobacterias tienen un tipo de PRC para cada uno de sus dos fotosistemas. Las bacterias no oxigenadas, por otro lado, tienen un RC que se asemeja al centro del fotosistema I (Tipo I) o al centro del fotosistema II (Tipo II). En cualquier caso, las PRC tienen dos proteínas relacionadas (L/M; D1/D2; PsaA/PsaB) que forman un complejo central de 5 hélices cuasi-simétrico con bolsillos para la unión de pigmentos. Los dos tipos están estructuralmente relacionados y comparten un ancestro común. [1] [2] Cada tipo tiene diferentes bolsillos para ligandos para acomodar sus reacciones específicas : mientras que las RC de Tipo I usan grupos de azufre de hierro para aceptar electrones, las RC de Tipo II usan quinonas. Las unidades centrales de las RC de Tipo I también tienen seis hélices transmembrana adicionales para recolectar energía. [2]

En bacterias

El aparato fotosintético de tipo II en bacterias no oxigenadas consiste en complejos de proteína-pigmento que captan luz, LH1 y LH2, que utilizan carotenoides y bacterioclorofila como donantes primarios. [3] LH1 actúa como centro de recolección de energía, almacenándola temporalmente antes de su transferencia al centro de reacción fotosintética (CR). [4] Los electrones se transfieren desde el donante primario a través de un aceptor intermedio (bacteriofeofitina) al aceptor primario (quinina Qa), y finalmente al aceptor secundario (quinona Qb), lo que resulta en la formación de ubiquinol QbH2. El CR usa la energía de excitación para barajar electrones a través de la membrana, transfiriéndolos a través de ubiquinol al complejo citocromo bc1 para establecer un gradiente de protones a través de la membrana, que es utilizado por la ATP sintetasa para formar ATP. [5] [6] [7]

El complejo central está anclado en la membrana celular y consiste en una unidad de RC rodeada por LH1; en algunas especies puede haber subunidades adicionales. [8] Un RC tipo II consta de tres subunidades: L (ligero), M (medio) y H (pesado; InterProIPR005652 ). Las subunidades L y M proporcionan el andamiaje para el cromóforo, mientras que la subunidad H contiene un dominio citoplasmático. [9] En Rhodopseudomonas viridis , también hay una subunidad de citocromo tetrahemo no membranoso (4Hcyt) en la superficie periplásmica.

La estructura de un sistema de tipo I en el anaerobio Heliobacterium modesticaldum se resolvió en 2017 ( PDB : 5V8K ). Como homodímero que consta de un solo tipo de proteína en el complejo central, se considera un ejemplo más cercano a cómo es una unidad ancestral antes de la división de tipo I/II en comparación con todos los sistemas heterodímeros. [2]

Sistemas oxigenados

Las proteínas del centro de reacción del fotosistema II (PSII) D1 (PsbA) y D2 (PsbD) de las cianobacterias, las algas y las plantas solo muestran una homología de secuencia de aproximadamente el 15 % con las subunidades L y M, sin embargo, los aminoácidos conservados corresponden a los sitios de unión de los cofactores fotoquímicamente activos. Como resultado, los centros de reacción (CR) de las bacterias fotosintéticas purpúreas y el PSII muestran una similitud estructural considerable en términos de organización de los cofactores.

Las proteínas D1 y D2 se presentan como un heterodímero que forma el núcleo de reacción del PSII, un complejo de proteína-pigmento de múltiples subunidades que contiene más de cuarenta cofactores diferentes, que están anclados en la membrana celular en las cianobacterias y en la membrana tilacoide en las algas y plantas. Al absorber la energía de la luz, el heterodímero D1/D2 sufre una separación de carga y los electrones se transfieren desde el donante primario (clorofila a) a través de la feofitina al aceptor primario quinona Qa, luego al aceptor secundario Qb, que al igual que el sistema bacteriano, culmina en la producción de ATP. Sin embargo, el PSII tiene una función adicional sobre el sistema bacteriano. En el lado oxidante del PSII, un residuo redox-activo en la proteína D1 reduce P680, la tirosina oxidada retira entonces electrones de un grupo de manganeso, que a su vez retira electrones del agua, lo que lleva a la división del agua y la formación de oxígeno molecular. De esta forma, el PSII proporciona una fuente de electrones que el fotosistema I puede utilizar para producir el poder reductor (NADPH) necesario para convertir el CO2 en glucosa. [10] [11]

En lugar de asignar funciones especializadas a las quinonas, el centro del fotosistema I PsaA-PsaB evolucionó para inmovilizar ambas quinonas y reclutó también la subunidad de hierro-azufre PsaC para mitigar aún más el riesgo de estrés oxidativo. [2]

En los virus

Se han descubierto genes del centro de reacción fotosintética del PSII (PsbA, PsbD) dentro de bacteriófagos marinos . [12] [13] [14] Aunque es un dogma ampliamente aceptado que fragmentos arbitrarios de ADN pueden ser transportados por fagos entre hospedadores ( transducción ), difícilmente esperaríamos encontrar ADN transducido dentro de una gran cantidad de virus. Se presume que la transducción es común en general, pero que un solo fragmento de ADN se transduzca de manera rutinaria sería altamente inesperado. En cambio, conceptualmente, un gen que se encuentre de manera rutinaria en estudios de ADN viral tendría que ser un elemento funcional del propio virus (esto no implica que el gen no se transfiera entre hospedadores -que es lo que hace el fotosistema dentro de los virus [15] - sino que existe una función viral para el gen, que no está simplemente haciendo autostop con el virus). Sin embargo, los virus libres carecen de la maquinaria necesaria para sustentar el metabolismo, y mucho menos la fotosíntesis. Como resultado, no es probable que los genes del fotosistema sean un componente funcional del virus como una proteína de la cápside o una fibra de la cola. En cambio, se expresan dentro de una célula huésped infectada. [16] [17] La ​​mayoría de los genes del virus que se expresan en el contexto del huésped son útiles para secuestrar la maquinaria del huésped para producir virus o para la replicación del genoma viral. Estos pueden incluir transcriptasas inversas, integrasas, nucleasas u otras enzimas. Los componentes del fotosistema tampoco encajan en este molde.

La producción de un fotosistema activo durante la infección viral proporciona fotosíntesis activa a las células moribundas. Sin embargo, esto no es altruismo viral hacia el huésped. El problema con las infecciones virales tiende a ser que incapacitan al huésped con relativa rapidez. Como la expresión de proteínas se desvía del genoma del huésped al genoma viral, el fotosistema se degrada con relativa rapidez (debido en parte a la interacción con la luz, que es altamente corrosiva), cortando el suministro de nutrientes al virus en replicación. [18] Una solución a este problema es agregar genes del fotosistema rápidamente degradados al virus, de modo que el flujo de nutrientes no se inhiba y se produzcan más virus. Sería de esperar que este descubrimiento conduzca a otros descubrimientos de naturaleza similar; que los elementos del metabolismo del huésped clave para la producción viral y que se dañan fácilmente durante la infección son reemplazados o apoyados activamente por el virus durante la infección. De hecho, recientemente, también se informó de la existencia de casetes de genes PSI que contienen conjuntos completos de genes [(psaJF, C, A, B, K, E y D) y (psaD, C, A y B)] en cianófagos marinos de los océanos Pacífico e Índico [19] [20] [21]

Subfamilias

Véase también

Notas

  1. ^ Sadekar S, Raymond J, Blankenship RE (noviembre de 2006). "Conservación de proteínas de membrana distantemente relacionadas: los centros de reacción fotosintética comparten un núcleo estructural común". Biología molecular y evolución . 23 (11): 2001–7. doi : 10.1093/molbev/msl079 . PMID  16887904.
  2. ^ abcd Orf GS, Gisriel C, Redding KE (octubre de 2018). "Evolución de los centros de reacción fotosintéticos: perspectivas a partir de la estructura del centro de reacción heliobacteriano". Photosynthesis Research . 138 (1): 11–37. Bibcode :2018PhoRe.138...11O. doi :10.1007/s11120-018-0503-2. OSTI  1494566. PMID  29603081. S2CID  4473759.
  3. ^ Lancaster CR, Bibikova MV, Sabatino P, Oesterhelt D, Michel H (diciembre de 2000). "Base estructural de la tasa de transferencia de electrones inicial drásticamente aumentada en el centro de reacción de un mutante de Rhodopseudomonas viridis descrito con una resolución de 2,00 A". The Journal of Biological Chemistry . 275 (50): 39364–8. doi : 10.1074/jbc.M008225200 . PMID  11005826.
  4. ^ Bahatyrova S, Frese RN, Siebert CA, Olsen JD, Van Der Werf KO, Van Grondelle R, Niederman RA, Bullough PA, Otto C, Hunter CN (agosto de 2004). "La arquitectura nativa de una membrana fotosintética" (PDF) . Naturaleza . 430 (7003): 1058–62. Código Bib : 2004Natur.430.1058B. doi : 10.1038/naturaleza02823. PMID  15329728. S2CID  486505.
  5. ^ Scheuring S (octubre de 2006). "Estudios AFM del ensamblaje supramolecular de complejos centrales fotosintéticos bacterianos". Current Opinion in Chemical Biology . 10 (5): 387–93. doi :10.1016/j.cbpa.2006.08.007. PMID  16931113.
  6. ^ Remy A, Gerwert K (agosto de 2003). "Acoplamiento de la transferencia de electrones inducida por la luz a la captación de protones en la fotosíntesis". Nature Structural Biology . 10 (8): 637–44. doi :10.1038/nsb954. PMID  12872158. S2CID  20008703.
  7. ^ Deisenhofer J, Michel H (agosto de 1989). "Conferencia Nobel. El centro de reacción fotosintética de la bacteria púrpura Rhodopseudomonas viridis". The EMBO Journal . 8 (8): 2149–70. doi :10.1002/j.1460-2075.1989.tb08338.x. PMC 401143 . PMID  2676514. 
  8. ^ Miki K, Kobayashi M, Nogi T, Fathir I, Nozawa T (2000). "Estructuras cristalinas del centro de reacción fotosintético y proteína de hierro-azufre de alto potencial de Thermochromatium tepidum: termoestabilidad y transferencia de electrones". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 97 (25): 13561–13566. Bibcode :2000PNAS...9713561N. doi : 10.1073/pnas.240224997 . PMC 17615 . PMID  11095707. 
  9. ^ Michel H, Ermler U, Schiffer M (1994). "Estructura y función del centro de reacción fotosintético de Rhodobacter sphaeroides". J. Bioenerg. Biomembr . 26 (1): 5–15. doi :10.1007/BF00763216. PMID  8027023. S2CID  84295064.
  10. ^ Kamiya N, Shen JR (2003). "Estructura cristalina del fotosistema II que desprende oxígeno de Thermosynechococcus vulcanus a una resolución de 3,7 A". Proc. Natl. Sci. USA . 100 (1): 98–103. Bibcode :2003PNAS..100...98K. doi : 10.1073/pnas.0135651100 . PMC 140893 . PMID  12518057. 
  11. ^ Schroder WP, Shi LX (2004). "Las subunidades de baja masa molecular del supracomplejo fotosintético, fotosistema II". Biochim. Biophys. Acta . 1608 (2–3): 75–96. doi : 10.1016/j.bbabio.2003.12.004 . PMID  14871485.
  12. ^ Sharon I, Tzahor S, Williamson S, Shmoish M, Man-Aharonovich D, Rusch DB, Yooseph S, Zeidner G, Golden SS, Mackey SR, Adir N, Weingart U, Horn D, Venter JC, Mandel-Gutfreund Y, Béjà O (2007). "Genes y transcripciones del centro de reacción fotosintética viral en el entorno marino". ISME J . 1 (6): 492–501. Bibcode :2007ISMEJ...1..492S. doi : 10.1038/ismej.2007.67 . PMID  18043651.
  13. ^ Millard A, Clokie MR, Shub DA, Mann NH (2004). "Organización genética de la región psbAD en fagos que infectan cepas marinas de Synechococcus". Proc. Natl. Sci. USA 101 (30): 11007–12. Bibcode :2004PNAS..10111007M. doi : 10.1073/pnas.0401478101 . PMC 503734 . PMID  15263091.  
  14. ^ Sullivan MB, Lindell D , Lee JA, Thompson LR, Bielawski JP, Chisholm SW (2006). "Prevalencia y evolución de los genes centrales del fotosistema II en virus cianobacterianos marinos y sus hospedadores". PLoS Biol. 4 (8): e234. doi : 10.1371/journal.pbio.0040234 . PMC 1484495. PMID  16802857 .   Icono de acceso abierto
  15. ^ Lindell D, Sullivan MB, Johnson ZI, Tolonen AC, Rohwer F, Chisholm SW (2004). "Transferencia de genes de fotosíntesis hacia y desde virus Prochlorococcus". Proc. Natl. Sci. USA 101 (30): 11013–8. Bibcode :2004PNAS..10111013L. doi : 10.1073/pnas.0401526101 . PMC 503735 . PMID  15256601.  
  16. ^ Lindell D, Jaffe JD, Johnson ZI, Church GM, Chisholm SW (2005). "Los genes de la fotosíntesis en virus marinos producen proteínas durante la infección del huésped". Nature . 438 (7064): 86–9. Bibcode :2005Natur.438...86L. doi :10.1038/nature04111. PMID  16222247. S2CID  4347406.
  17. ^ Clokie MR, Shan J, Bailey S, Jia Y, Krisch HM, West S, Mann NH (2006). "Transcripción de un fago de tipo T4 'fotosintético' durante la infección de una cianobacteria marina". Environ. Microbiol. 8 (5): 827–35. doi :10.1111/j.1462-2920.2005.00969.x. PMID  16623740.
  18. ^ Bailey S, Clokie MR, Millard A, Mann NH (2004). "Infección por cianófagos y fotoinhibición en cianobacterias marinas". Res. Microbiol. 155 (9): 720–5. doi : 10.1016/j.resmic.2004.06.002 . PMID  15501648.
  19. ^ Sharon I, Alperovitch A, Rohwer F, Haynes M, Glaser F, Atamna-Ismaeel N, Pinter RY, Partensky F, Koonin EV, Wolf YI, Nelson N, Béjà O (2009). "Los casetes de genes del fotosistema I están presentes en los genomas de virus marinos". Nature . 461 (7261): 258–262. Bibcode :2009Natur.461..258S. doi :10.1038/nature08284. PMC 4605144 . PMID  19710652. 
  20. ^ Alperovitch-Lavy A, Sharon I, Rohwer F, Aro EM, Glaser F, Milo R, Nelson N, Béjà O (2011). "Reconstrucción de un rompecabezas: existencia de cianófagos que contienen conjuntos de genes del fotosistema I y del fotosistema II inferidos a partir de conjuntos de datos metagenómicos oceánicos". Environ. Microbiol . 13 (1): 24–32. doi :10.1111/j.1462-2920.2010.02304.x. PMID  20649642.
  21. ^ Béjà O, Fridman S, Glaser F (2012). "Clones virales de la expedición GOS con una organización inusual de casetes de genes del fotosistema I". ISME J . 6 (8): 1617–20. Bibcode :2012ISMEJ...6.1617B. doi :10.1038/ismej.2012.23. PMC 3400403 . PMID  22456446. 

Referencias