BPSL

Gen codificador de proteínas en humanos

La proteína de unión a la horquilla de ARN de histona o proteína de unión a tallo-bucle (SLBP) es una proteína que en los humanos está codificada por el gen SLBP . ^{[5] [6] [7]}

Distribución de especies

SLBP ha sido clonada a partir de humanos, C. elegans , D. melanogaster , X. laevis y erizos de mar . La proteína humana de longitud completa tiene 270 aminoácidos (31 kDa) con un dominio de unión al ARN (RBD) ubicado centralmente. El RBD de 75 aminoácidos está bien conservado en todas las especies, sin embargo, el resto de SLBP es altamente divergente en la mayoría de los organismos y no es homólogo a ninguna otra proteína en los genomas eucariotas.

Función

Este gen codifica una proteína que se une a la estructura de tallo-bucle del UTR 3' de la histona en los ARNm de histonas dependientes de la replicación . Los ARNm de histonas no contienen intrones ni señales de poliadenilación , y se procesan mediante un único evento de escisión endonucleolítica aguas abajo del tallo-bucle. La estructura de tallo-bucle es esencial para el procesamiento eficiente del pre-ARNm de histona, pero esta estructura también controla el transporte, la traducción y la estabilidad de los ARNm de histonas. La expresión de SLBP se regula durante la fase S del ciclo celular , aumentando más de 10 veces durante la última parte de G1 .

Todas las proteínas SLBP son capaces de formar un complejo altamente estable con el ARN de tallo-bucle de histona. La formación del complejo con el ARN de tallo-bucle de histona se logra mediante un nuevo pliegue de haz de tres hélices. Las proteínas SLBP también reconocen la estructura de tetrabucle de la horquilla de histona, la base del tallo y la región flanqueante 5'. La estructura cristalina de la SLBP humana en complejo con el ARN de tallo-bucle, así como con la exonucleasa Eri1, revela que el residuo Arg181 de la SLBP interactúa específicamente con la segunda base de guanina en el tallo del ARN. ^[8] El resto de la proteína está intrínsecamente desordenado en las moscas de la fruta, así como en los humanos. Una característica única del RBD de SLBP es que está fosforilado en su dominio de unión al ARN en el residuo Thr171. El RBD de SLBP también sufre isomerización de prolina alrededor de esta secuencia y es un sustrato para la prolil isomerasa Pin1. El dominio N-terminal de SLBP humano es necesario para la activación de la traducción de los ARNm de las histonas a través de su interacción con SLIP1. SLBP también interactúa con la proteína CTIF asociada a CBP80 para facilitar la degradación rápida de los ARNm de las histonas. SLBP es una fosfoproteína y, además de T171, también está fosforilada en Ser7, Ser20, Ser23, Thr60, Thr61 en células de mamíferos. La fosforilación en Thr60 está mediada por CK2 y Thr61 por Ciclina A / Cdk1 . ^[7]

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000163950 – Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000004642 – Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
5. Martin F, Schaller A, Eglite S, Schumperli D, Muller B (marzo de 1997). "El gen de la proteína de unión de la horquilla de ARN de histona se encuentra en el cromosoma humano 4 y codifica un nuevo tipo de proteína de unión de ARN". EMBO J . 16 (4): 769–78. doi :10.1093/emboj/16.4.769. PMC 1169678 . PMID  9049306. 
6. McCombie WR, Martin-Gallardo A, Gocayne JD, FitzGerald M, Dubnick M, Kelley JM, Castilla L, Liu LI, Wallace S, Trapp S (agosto de 1992). "Genes expresados, repeticiones Alu y polimorfismos en cósmidos secuenciados del cromosoma 4p16.3". Nature Genetics . 1 (5): 348–53. doi :10.1038/ng0892-348. PMID  1338771. S2CID  6716635.
7. "Gen Entrez: proteína de unión al tallo-bucle (histona) SLBP".
8. Dazhi Tan; William F. Marzluff; Zbigniew Dominski; Liang Tong (enero de 2013). "Estructura del tallo-bucle del ARNm de histona, proteína de unión al tallo-bucle humano y complejo ternario 3'hExo". Science . 339 (6117): 318–321. doi :10.1126/science.1228705. PMC 3552377 . PMID  23329046. 

Lectura adicional

• Choe J, Mi Kim K, Park S, Kyung Lee Y, Song OK, Kim MK, Lee BG, Song HK, Kim YK (2013). "La degradación rápida de los ARNm de histonas dependientes de la replicación se produce principalmente en los ARNm unidos por las proteínas de unión a la tapa nuclear 80 y 20". Nucleic Acids Research . 41 (2): 1307–1318. doi :10.1093/nar/gks1196. PMC  3553978 . PMID  23234701.
• Bansal N, Zhang M, Bhaskar A, Itotia P, Lee E, Shlyakhtenko LS, Lam TT, Fritz A, Berezney R, Lyubchenko YL, Stafford WF, Thapar R (enero de 2013). "El ensamblaje del complejo SLIP1-SLBP en el ARNm de histonas requiere heterodimerización y unión secuencial de SLBP seguida de SLIP1". Biochemistry . 52 (3): 520–536. doi :10.1021/bi301074r. PMC  3580866 . PMID  23286197.
• Martin L, Meier M, Lyons SM, Sit RV, Marzluff WF, Quake SR, Chang HY (diciembre de 2012). "Reconstrucción sistemática de motivos funcionales de ARN con microfluídica de alto rendimiento". Nature Methods . 9 (12): 1192–4. doi :10.1038/nmeth.2225. PMC  3863600 . PMID  23142872.
• Krishnan N, Lam TT, Fritz A, Rempinski D, O'Loughlin K, Minderman H, Berezney R, Marzluff WF, Thapar R (noviembre de 2012). "La prolil isomerasa Pin1 se dirige a la proteína de unión a tallo-bucle (SLBP) para disociar el complejo de ARNm de histona-SLBP que vincula la degradación del ARNm de histona con la ubiquitinación de SLBP". Mol. Cell. Biol . 32 (21): 4306–22. doi :10.1128/MCB.00382-12. PMC 3486140.  PMID 22907757  .
• Zhang M, Lam TT, Tonelli M, Marzluff WF, Thapar R (abril de 2012). "Interacción de la horquilla de ARNm de histona con la proteína de unión a tallo-bucle (SLBP) y regulación del complejo SLBP-ARN por fosforilación e isomerización de prolina". Biochemistry . 51 (15): 3215–31. doi :10.1021/bi2018255. PMC  3328597 . PMID  22439849.
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