Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
La proteína N asociada a la ribonucleoproteína nuclear pequeña es una proteína que en los humanos está codificada por el gen SNRPN . [4] [5]
La proteína codificada por este gen es un polipéptido de un complejo de ribonucleoproteína nuclear pequeña y pertenece a la familia snRNP SMB/SMN. La proteína desempeña un papel en el procesamiento del pre-ARNm, posiblemente eventos de empalme alternativo específicos de tejido . Aunque se cree que los snRNP individuales reconocen secuencias de ácidos nucleicos específicas a través del apareamiento de bases ARN-ARN, se desconoce el papel específico de este miembro de la familia. La proteína surge de una transcripción bicistrónica que también codifica una proteína identificada como el marco de lectura ascendente de SNRPN (SNURF). Se han identificado múltiples sitios de inicio de la transcripción y se produce un empalme alternativo extenso en la región no traducida 5'. Se han descrito variantes de empalme adicionales, pero no se han determinado las secuencias para las transcripciones completas. El 5' UTR de este gen se ha identificado como un centro de impronta. El empalme alternativo o la deleción causados por un evento de translocación en esta región expresada por el padre es responsable del síndrome de Prader-Willi debido a la falla del cambio de impronta parental. [5]
La metilación de SNRPN se utiliza para detectar la disomía uniparental del cromosoma 15. [6] Después de que la hibridación in situ con fluorescencia haya confirmado la presencia de SNRPN o UBE3A (un gen vecino que también está impreso), la prueba de metilación (de SNRPN) puede revelar si el paciente tiene disomía uniparental. SNRPN está metilado (silenciado) por vía materna. [7] UBE3A parece estar metilado (silenciado) por vía paterna. [ cita requerida ]
Referencias
- ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000128739 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Schmauss C, Brines ML, Lerner MR (mayo de 1992). "El gen que codifica la proteína N asociada a la ribonucleoproteína nuclear pequeña se expresa en niveles elevados en las neuronas". J Biol Chem . 267 (12): 8521–9. doi : 10.1016/S0021-9258(18)42475-1 . PMID 1533223.
- ^ ab "Entrez Gene: SNRPN polipéptido N de ribonucleoproteína nuclear pequeña".
- ^ White HE, Durston VJ, Harvey JF, Cross NC (2006). "Análisis cuantitativo de la metilación del gen SNRPN (corrección de SRNPN) mediante pirosecuenciación como prueba diagnóstica para el síndrome de Prader-Willi y el síndrome de Angelman". Clin. Chem . 52 (6): 1005–13. doi : 10.1373/clinchem.2005.065086 . PMID 16574761.
- ^ Zeschnigk M, Schmitz B, Dittrich B, Buiting K, Horsthemke B, Doerfler W (1997). "Segmentos impresos en el genoma humano: diferentes patrones de metilación del ADN en la región del síndrome de Prader-Willi/Angelman determinados por el método de secuenciación genómica". Hum. Mol. Genet . 6 (3): 387–95. doi : 10.1093/hmg/6.3.387 . PMID 9147641.
Lectura adicional
- Ozçelik T, Leff S, Robinson W, et al. (1993). "Polipéptido N de ribonucleoproteína nuclear pequeña (SNRPN), un gen expresado en la región crítica del síndrome de Prader-Willi". Nat. Genet . 2 (4): 265–9. doi :10.1038/ng1292-265. PMID 1303277. S2CID 32755927.
- Schmauss C, McAllister G, Ohosone Y, et al. (1989). "Una comparación de autoantígenos Sm asociados a snRNP: N humano, N de rata y B/B humano". Nucleic Acids Res . 17 (4): 1733–43. doi :10.1093/nar/17.4.1733. PMC 331831. PMID 2522186 .
- Rokeach LA, Jannatipour M, Haselby JA, Hoch SO (1989). "Estructura primaria de un polipéptido de ribonucleoproteína nuclear pequeña humana deducida mediante análisis de ADNc". J. Biol. Chem . 264 (9): 5024–30. doi : 10.1016/S0021-9258(18)83693-6 . PMID 2522449.
- Renz M, Heim C, Bräunling O, et al. (1989). "Expresión de los principales autoantígenos de ribonucleoproteína humana (RNP) en Escherichia coli y su uso en un ensayo de inmunoensayo para la detección de sueros de pacientes con enfermedades autoinmunes". Clin. Chem . 35 (9): 1861–3. doi : 10.1093/clinchem/35.9.1861 . PMID 2528429.
- Sharpe NG, Williams DG, Howarth DN, et al. (1989). "Aislamiento de clones de ADNc que codifican el antígeno autoinmune humano Sm B/B' y que reaccionan específicamente con sueros autoinmunes humanos anti-Sm". FEBS Lett . 250 (2): 585–90. Bibcode :1989FEBSL.250..585S. doi : 10.1016/0014-5793(89)80801-4 . PMID 2753153.
- Reed ML, Leff SE (1994). "Impresión materna de SNRPN humano, un gen eliminado en el síndrome de Prader-Willi". Nat. Genet . 6 (2): 163–7. doi :10.1038/ng0294-163. PMID 7512861. S2CID 39792921.
- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Esposito F, Fiore F, Cimino F, Russo T (1993). "Aislamiento y caracterización estructural del gen de rata que codifica el polipéptido "N" asociado a snRNP específico del cerebro"". Biochem. Biophys. Res. Commun . 195 (1): 317–26. doi :10.1006/bbrc.1993.2047. PMID 8363612.
- Glenn CC, Saitoh S, Jong MT, et al. (1996). "Estructura genética, metilación del ADN y expresión impresa del gen SNRPN humano". Am. J. Hum. Genet . 58 (2): 335–46. PMC 1914536. PMID 8571960 .
- Dittrich B, Buiting K, Korn B, et al. (1996). "El cambio de impronta en el cromosoma humano 15 puede implicar transcripciones alternativas del gen SNRPN". Nat. Genet . 14 (2): 163–70. doi :10.1038/ng1096-163. PMID 8841186. S2CID 20943659.
- Sun Y, Nicholls RD, Butler MG, et al. (1996). "Rotura en el locus SNRPN en un paciente con síndrome de Prader-Willi 46,XY,t(15;19) equilibrado". Hum. Mol. Genet . 5 (4): 517–24. doi :10.1093/hmg/5.4.517. PMC 6057871 . PMID 8845846.
- Buiting K, Dittrich B, Endele S, Horsthemke B (1997). "Identificación de nuevos exones 3' del gen SNRPN humano". Genomics . 40 (1): 132–7. doi :10.1006/geno.1996.4571. PMID 9070929.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5'". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Fury MG, Zhang W, Christodoulopoulos I, Zieve GW (1998). "Proteínas múltiples: interacciones proteicas entre las proteínas del núcleo común snRNP". Exp. Cell Res . 237 (1): 63–9. doi :10.1006/excr.1997.3750. PMID 9417867.
- Yang T, Adamson TE, Resnick JL, et al. (1998). "Un modelo de ratón para las mutaciones del centro de impronta del síndrome de Prader-Willi". Nat. Genet . 19 (1): 25–31. doi :10.1038/ng0598-25. PMID 9590284. S2CID 20124015.
- Kuslich CD, Kobori JA, Mohapatra G, et al. (1999). "El síndrome de Prader-Willi es causado por la alteración del gen SNRPN". Am. J. Hum. Genet . 64 (1): 70–6. doi :10.1086/302177. PMC 1377704 . PMID 9915945.
- Färber C, Dittrich B, Buiting K, Horsthemke B (1999). "La región del centro de impronta (IC) del cromosoma 15 ha sufrido múltiples eventos de duplicación y contiene un exón anterior de SNRPN que se elimina en todos los pacientes con síndrome de Angelman con una microdeleción IC". Hum. Mol. Genet . 8 (2): 337–43. doi : 10.1093/hmg/8.2.337 . PMID 9931342.
- Gray TA, Saitoh S, Nicholls RD (1999). "Una transcripción bicistrónica de mamíferos impresa codifica dos proteínas independientes". Proc. Natl. Sci. USA . 96 (10): 5616–21. Bibcode :1999PNAS...96.5616G. doi : 10.1073/pnas.96.10.5616 . PMC 21909 . PMID 10318933.
- Gray TA, Smithwick MJ, Schaldach MA, et al. (2000). "Regulación concertada y evolución molecular de los loci SNRPB'/B y SNRPN duplicados". Nucleic Acids Res . 27 (23): 4577–84. doi :10.1093/nar/27.23.4577. PMC 148745 . PMID 10556313.
- Albuquerque D, Manco L, González L, et al. (2017). "Polimorfismos en el gen SRNPN se asocian con la susceptibilidad a la obesidad en la población española". J. Gene Med . 19 (5): e2956. doi :10.1002/jgm.2956. hdl : 10230/60864 . PMID 28387446. S2CID 1860814.