Clase de enzimas
En enzimología , una fitanoil-CoA dioxigenasa ( EC 1.14.11.18) es una enzima que cataliza la reacción química
- fitanoil-CoA + 2-oxoglutarato + O 2 2-hidroxifitanoil-CoA + succinato + CO 2
Los tres sustratos de esta enzima son fitanoil-CoA , 2-oxoglutarato (2OG) y O 2 , mientras que sus tres productos son 2-hidroxifitanoil-CoA, succinato y CO 2 .
Esta enzima pertenece a la familia de las oxigenasas dependientes del hierro(II) , que normalmente incorporan un átomo de dioxígeno en el sustrato y un átomo en el grupo carboxilato succinato. El mecanismo es complejo, pero se cree que implica la unión ordenada de 2-oxoglutarato a la enzima que contiene hierro(II) seguida del sustrato. La unión del sustrato provoca el desplazamiento de una molécula de agua del cofactor hierro(II), dejando una posición de coordinación vacante a la que se une el dioxígeno. Se produce un reordenamiento para formar una especie de hierro-oxígeno de alta energía (que generalmente se cree que es una especie de hierro(IV)=O) que realiza la reacción de oxidación real. [2] [3]
Nomenclatura
El nombre sistemático de esta clase de enzimas es fitanoil-CoA, 2-oxoglutarato:oxidorreductasa (2-hidroxilante) . Estas enzimas también se denominan fitanoil-CoA hidroxilasas y fitanoil-CoA alfa-hidroxilasas . [4]
Ejemplos
En los seres humanos, la fitanoil-CoA hidroxilasa está codificada por el gen PHYH ( también conocido como PAHX ) y es necesaria para la alfa-oxidación de los ácidos grasos de cadena ramificada (por ejemplo, el ácido fitánico ) en los peroxisomas . La deficiencia de PHYH da como resultado la acumulación de grandes reservas tisulares de ácido fitánico y es la principal causa de la enfermedad de Refsum . [5]
Enzimas relacionadas
Las oxigenasas dependientes de hierro (II) y 2OG son comunes en microorganismos , plantas y animales; se predice que el genoma humano contiene alrededor de 80 ejemplos, y la planta modelo Arabidopsis thaliana probablemente contiene más. [2] En plantas y microorganismos, esta familia de enzimas está asociada con una gran diversidad de reacciones oxidativas. [6]
Referencias
- ^ McDonough MA, Kavanagh KL, Butler D, Searls T, Oppermann U, Schofield CJ (diciembre de 2005). "La estructura de la fitanoil-CoA 2-hidroxilasa humana identifica los mecanismos moleculares de la enfermedad de Refsum". The Journal of Biological Chemistry . 280 (49): 41101–10. doi : 10.1074/jbc.M507528200 . PMID 16186124.
- ^ ab Hausinger RP (2015). "CAPÍTULO 1. Diversidad bioquímica de oxigenasas dependientes de 2-oxoglutarato". Oxigenasas dependientes de 2-oxoglutarato . Metalobiología. págs. 1–58. doi :10.1039/9781782621959-00001. ISBN 978-1-84973-950-4.S2CID85596364 .
- ^ Martinez S, Hausinger RP (agosto de 2015). "Mecanismos catalíticos de oxigenasas dependientes de Fe(II) y 2-oxoglutarato". The Journal of Biological Chemistry . 290 (34): 20702–11. doi : 10.1074/jbc.R115.648691 . PMC 4543632 . PMID 26152721.
- ^ "PHYH fitanoil-CoA 2-hidroxilasa [ Homo sapiens (humano) ]". Centro Nacional de Información Biotecnológica .
- ^ Mihalik SJ, Morrell JC, Kim D, Sacksteder KA, Watkins PA, Gould SJ (octubre de 1997). "Identificación de PAHX, un gen de la enfermedad de Refsum". Genética de la Naturaleza . 17 (2): 185–9. doi :10.1038/ng1097-185. PMID 9326939. S2CID 39214017.
- ^ McDonough MA, Loenarz C, Chowdhury R, Clifton IJ, Schofield CJ (diciembre de 2010). "Estudios estructurales sobre oxigenasas dependientes de 2-oxoglutarato humano". Current Opinion in Structural Biology . 20 (6): 659–72. doi :10.1016/j.sbi.2010.08.006. PMID 20888218.
Lectura adicional
- Jansen GA, Mihalik SJ, Watkins PA, Jakobs C, Moser HW, Wanders RJ (marzo de 1998). "Caracterización de la fitanoil-coenzima A hidroxilasa en el hígado humano y mediciones de la actividad en pacientes con trastornos peroxisomales". Clinica Chimica Acta; Revista internacional de química clínica . 271 (2): 203–11. doi : 10.1016/S0009-8981(97)00259-3 . PMID 9565335.
- Jansen GA, Mihalik SJ, Watkins PA, Moser HW, Jakobs C, Denis S, Wanders RJ (diciembre de 1996). "La fitanoil-CoA hidroxilasa está presente en el hígado humano, se encuentra en los peroxisomas y es deficiente en el síndrome de Zellweger: evidencia directa e inequívoca de la nueva vía revisada de la alfa-oxidación del ácido fitánico en humanos". Biochemical and Biophysical Research Communications . 229 (1): 205–10. doi : 10.1006/bbrc.1996.1781 . PMID 8954107.
- Jansen GA, Ofman R, Ferdinandusse S, Ijlst L, Muijsers AO, Skjeldal OH, Stokke O, Jakobs C, Besley GT, Wraith JE, Wanders RJ (octubre de 1997). "La enfermedad de Refsum es causada por mutaciones en el gen de la fitanoil-CoA hidroxilasa". Genética de la Naturaleza . 17 (2): 190–3. doi :10.1038/ng1097-190. PMID 9326940. S2CID 5856245.
- Mihalik SJ, Rainville AM, Watkins PA (septiembre de 1995). "Alfa-oxidación del ácido fitánico en peroxisomas de hígado de rata. La producción de alfa-hidroxifitanoil-CoA y formato se ve potenciada por cofactores de la dioxigenasa". Revista Europea de Bioquímica . 232 (2): 545–51. doi : 10.1111/j.1432-1033.1995.545zz.x . PMID 7556205.
Enlaces externos
- Entrada en GeneReviews/NCBI/NIH/UW sobre la enfermedad de Refsum