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Tabla de potenciales de reducción estándar para semirreacciones importantes en bioquímica

Los valores siguientes son potenciales de reducción aparentes estándar (E°') para semirreacciones electrobioquímicas medidas a 25 °C, 1 atmósfera y un pH de 7 en solución acuosa. [1] [2]

El potencial fisiológico real depende de la relación entre las formas reducida ( Red ) y oxidada ( Ox ) según la ecuación de Nernst y del voltaje térmico .

Cuando un oxidante ( Ox ) acepta un número z de electrones ( e ) para ser convertidos en su forma reducida ( Red ), la semireacción se expresa como:

Ox + z e Rojo

El cociente de reacción ( Q r ) es la relación entre la actividad química ( a i ) de la forma reducida (el reductor, a Red ) y la actividad de la forma oxidada (el oxidante, a ox ). Es igual a la relación de sus concentraciones ( C i ) solo si el sistema está suficientemente diluido y los coeficientes de actividad ( γ i ) son cercanos a la unidad ( a i = γ i C i ):

La ecuación de Nernst es una función de Q r y se puede escribir de la siguiente manera:

En el equilibrio químico , el cociente de reacción Q r de la actividad del producto ( a Red ) por la actividad del reactivo ( a Ox ) es igual a la constante de equilibrio ( K ​​) de la semirreacción y en ausencia de fuerza impulsora ( ΔG = 0 ) el potencial ( E red ) también se vuelve nulo.

La forma numéricamente simplificada de la ecuación de Nernst se expresa como:

Donde es el potencial de reducción estándar de la semirreacción expresado en función del potencial de reducción estándar del hidrógeno. Para las condiciones estándar en electroquímica (T = 25 °C, P = 1 atm y todas las concentraciones fijadas en 1 mol/L, o 1 M), el potencial de reducción estándar del hidrógeno se fija en cero por convención, ya que sirve de referencia. El electrodo de hidrógeno estándar (SHE), con [ H + ] = 1 M, funciona así a un pH = 0.

A pH = 7, cuando [ H + ] = 10 −7 M, el potencial de reducción de H + difiere de cero porque depende del pH.

Resolviendo la ecuación de Nernst para la semireacción de reducción de dos protones en gas hidrógeno se obtiene:

2H + + 2e ⇌H2

En bioquímica y en fluidos biológicos, a pH = 7, es importante tener en cuenta que el potencial de reducción de los protones ( H + ) en gas hidrógeno H
2
ya no es cero como con el electrodo de hidrógeno estándar (SHE) a 1 M H + (pH = 0) en la electroquímica clásica, sino que versus el electrodo de hidrógeno estándar (SHE). [2]

Lo mismo se aplica al potencial de reducción del oxígeno:

O 2 + 4 H + + 4 mi ⇌ 2 H 2 O

Para O 2 , = 1,229 V, entonces, aplicando la ecuación de Nernst para pH = 7 se obtiene:

Para obtener los valores del potencial de reducción a pH = 7 para las reacciones redox relevantes para los sistemas biológicos, se realiza el mismo tipo de ejercicio de conversión utilizando la ecuación de Nernst correspondiente expresada en función del pH.

La conversión es sencilla, pero se debe tener cuidado de no mezclar inadvertidamente el potencial de reducción convertido a pH = 7 con otros datos tomados directamente de tablas que hacen referencia a SHE (pH = 0).

Expresión de la ecuación de Nernst en función del pH

El pH de una solución está relacionado con la ecuación de Nernst , que se representa comúnmente mediante un diagrama de Pourbaix ( gráfico de pH ) . Para una ecuación de media celda , escrita convencionalmente como una reacción de reducción ( es decir , electrones aceptados por un oxidante en el lado izquierdo):

El potencial de reducción estándar de semicelda se da por

donde es el cambio de energía libre de Gibbs estándar , z es el número de electrones involucrados y F es la constante de Faraday . La ecuación de Nernst relaciona el pH y :

 [ cita requerida ]

donde las llaves { } indican actividades y los exponentes se muestran de la manera convencional.
Esta ecuación es la ecuación de una línea recta para en función del pH con una pendiente de voltios (el pH no tiene unidades).

Esta ecuación predice valores de pH más bajos a valores de pH más altos. Esto se observa para la reducción de O 2 en H 2 O, u OH , y para la reducción de H + en H 2 .

Potencial de reducción estándar formal combinado con la dependencia del pH

Para obtener el potencial de reducción en función de las concentraciones medidas de las especies redox-activas en solución, es necesario expresar las actividades en función de las concentraciones.

Dado que la actividad química denotada aquí por { } es el producto del coeficiente de actividad γ por la concentración denotada por [ ]: a i = γ i ·C i , aquí expresado como {X} = γ x [X] y {X} x = ( γ x ) x [X] x y reemplazando el logaritmo de un producto por la suma de los logaritmos ( es decir , log (a·b) = log a + log b), el logaritmo del cociente de reacción ( ) (sin {H + } ya aislado aparte en el último término como h pH) expresado aquí arriba con actividades { } se convierte en:

Permite reorganizar la ecuación de Nernst como:

¿Dónde está el potencial estándar formal independiente del pH, incluidos los coeficientes de actividad?

Combinando directamente con el último término dependiendo del pH se obtiene:

Para un pH = 7:

Entonces,

Por lo tanto, es importante saber a qué definición exacta se refiere el valor de un potencial de reducción para un proceso bioquímico redox dado informado a pH = 7, y comprender correctamente la relación utilizada.

¿Es simplemente:

Por tanto, es necesario disponer de una definición clara del potencial de reducción considerado y de una descripción suficientemente detallada de las condiciones en las que es válido, junto con una expresión completa de la ecuación de Nernst correspondiente. Además, ¿los valores informados se derivaron únicamente de cálculos termodinámicos o se determinaron a partir de mediciones experimentales y en qué condiciones específicas? Sin poder responder correctamente a estas preguntas, mezclar datos de diferentes fuentes sin una conversión adecuada puede dar lugar a errores y confusión.

Determinación del potencial de reducción estándar formal cuando.mw-parser-output .sfrac{white-space:nowrap}.mw-parser-output .sfrac.tion,.mw-parser-output .sfrac .tion{display:inline-block;vertical-align:-0.5em;font-size:85%;text-align:center}.mw-parser-output .sfrac .num{display:block;line-height:1em;margin:0.0em 0.1em;border-bottom:1px solid}.mw-parser-output .sfrac .den{display:block;line-height:1em;margin:0.1em 0.1em}.mw-parser-output .sr-only{border:0;clip:rect(0,0,0,0);clip-path:polygon(0px 0px,0px 0px,0px 0px);height:1px;margin:-1px;overflow:hidden;padding:0;position:absolute;width:1px}⁠C rojo/buey de co⁠= 1

El potencial de reducción estándar formal se puede definir como el potencial de reducción medido de la semireacción en una relación de concentración unitaria de las especies oxidadas y reducidas ( es decir , cuandoC rojo/buey de co = 1) en determinadas condiciones. [3]

En efecto:

como , cuando ,

, cuando ,

porque , y que el término está incluido en .

El potencial de reducción formal permite trabajar de manera más sencilla con concentraciones molares o molares en lugar de actividades . Debido a que las concentraciones molares y molares antes se denominaban concentraciones formales , esto podría explicar el origen del adjetivo formal en la expresión potencial formal . [ cita requerida ]

El potencial formal es entonces el potencial reversible de un electrodo en equilibrio inmerso en una solución donde los reactivos y productos están en concentración unitaria. [4] Si cualquier pequeño cambio incremental de potencial causa un cambio en la dirección de la reacción, es decir , de reducción a oxidación o viceversa , el sistema está cerca del equilibrio, es reversible y está en su potencial formal. Cuando el potencial formal se mide en condiciones estándar ( es decir , la actividad de cada especie disuelta es 1 mol/L, T = 298,15 K = 25 °C = 77 °F, P gas = 1 bar) se convierte de facto en un potencial estándar. [5] Según Brown y Swift (1949), "Un potencial formal se define como el potencial de una semicelda, medido contra el electrodo de hidrógeno estándar , cuando la concentración total de cada estado de oxidación es un formal". [6]

Los coeficientes de actividad y están incluidos en el potencial formal y, dado que dependen de condiciones experimentales como la temperatura, la fuerza iónica y el pH , no pueden considerarse un potencial estándar inmutable, sino que deben determinarse sistemáticamente para cada conjunto específico de condiciones experimentales. [5]

Los potenciales de reducción formales se aplican para simplificar la interpretación de los resultados y los cálculos de un sistema considerado. Su relación con los potenciales de reducción estándar debe expresarse claramente para evitar confusiones.

Principales factores que afectan a los potenciales de reducción estándar formales (o aparentes)

El factor principal que afecta a los potenciales de reducción formales (o aparentes) en los procesos bioquímicos o biológicos es el pH. Para determinar valores aproximados de potenciales de reducción formales, despreciando en una primera aproximación los cambios en los coeficientes de actividad debidos a la fuerza iónica, se debe aplicar la ecuación de Nernst teniendo cuidado de expresar primero la relación como una función del pH. El segundo factor a considerar son los valores de las concentraciones tomadas en cuenta en la ecuación de Nernst. Para definir un potencial de reducción formal para una reacción bioquímica, el valor del pH, los valores de las concentraciones y las hipótesis realizadas sobre los coeficientes de actividad deben indicarse siempre claramente. Al utilizar o comparar varios potenciales de reducción formales (o aparentes), también deben ser coherentes internamente.

Pueden surgir problemas al mezclar diferentes fuentes de datos utilizando diferentes convenciones o aproximaciones ( es decir , con diferentes hipótesis subyacentes). Cuando se trabaja en la frontera entre procesos inorgánicos y biológicos (por ejemplo, al comparar procesos abióticos y bióticos en geoquímica cuando la actividad microbiana también podría estar en funcionamiento en el sistema), se debe tener cuidado de no mezclar directamente inadvertidamente los potenciales de reducción estándar ( versus SHE, pH = 0) con los potenciales de reducción formales (o aparentes) ( a pH = 7). Las definiciones deben expresarse claramente y controlarse cuidadosamente, especialmente si las fuentes de datos son diferentes y surgen de diferentes campos (por ejemplo, seleccionar y mezclar directamente datos de libros de texto de electroquímica clásica ( versus SHE, pH = 0) y libros de texto de microbiología ( a pH = 7) sin prestar atención a las convenciones en las que se basan).

Ejemplo en bioquímica

Por ejemplo, en una pareja de dos electrones como el NAD+
: NADH el potencial de reducción se vuelve ~ 30 mV (o más exactamente, 59,16 mV/2 = 29,6 mV) más positivo por cada aumento de potencia de diez en la relación entre la forma oxidada y la forma reducida.

Algunos potenciales aparentes importantes utilizados en bioquímica

Véase también

Referencias

  1. ^ Berg, JM; Tymoczko, JL; Stryer, L (2001). Bioquímica (5ª ed.). WH Freeman. ISBN 9780716746843.
  2. ^ ab Voet, Donald; Voet, Judith G.; Pratt, Charlotte W. (2016). "Tabla 14-4 Potenciales de reducción estándar para algunas semirreacciones de importancia bioquímica". Fundamentos de bioquímica: la vida a nivel molecular (5.ª ed.). Wiley. pág. 466. ISBN 978-1-118-91840-1.
  3. ^ Kano, Kenji (2002). "Potenciales redox de proteínas y otros compuestos de interés bioelectroquímico en soluciones acuosas". Review of Polarography . 48 (1): 29–46. doi : 10.5189/revpolarography.48.29 . eISSN  1884-7692. ISSN  0034-6691 . Consultado el 2 de diciembre de 2021 .
  4. ^ "Potencial formal". TheFreeDictionary.com . Consultado el 6 de diciembre de 2021 .
  5. ^ de PalmSens (2021). «Orígenes de los potenciales electroquímicos — PalmSens». PalmSens . Consultado el 6 de diciembre de 2021 .
  6. ^ Brown, Raymond A.; Swift, Ernest H. (1949). "El potencial formal de la semicelda antimonosa-antimónica en soluciones de ácido clorhídrico". Journal of the American Chemical Society . 71 (8): 2719–2723. doi :10.1021/ja01176a035. ISSN  0002-7863. Cita : Un potencial formal se define como el potencial de una semicelda, medido contra el electrodo de hidrógeno estándar, cuando la concentración total de cada estado de oxidación es un formal.
  7. ^ ab Huang, Haiyan; Wang, Shuning; Moll, Johanna; Thauer, Rudolf K. (15 de julio de 2012). "Bifurcación electrónica implicada en el metabolismo energético de la bacteria acetogénica Moorella thermoacetica que crece en glucosa o H2 más CO2". Journal of Bacteriology . 194 (14): 3689–99. doi :10.1128/JB.00385-12. PMC 3393501 . PMID  22582275. 
  8. ^ Buckel, W.; Thauer, RK (2013). "Conservación de energía mediante reducción de ferredoxina por bifurcación de electrones y oxidación de ferredoxina por translocación de protones/Na+". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics . 1827 (2): 94–113. doi : 10.1016/j.bbabio.2012.07.002 . PMID  22800682.
  9. ^ ab Unden G, Bongaerts J (julio de 1997). "Vías respiratorias alternativas de Escherichia coli: regulación energética y transcripcional en respuesta a aceptores de electrones". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics . 1320 (3): 217–34. doi :10.1016/s0005-2728(97)00034-0. PMID  9230919.
  10. ^ Huang, Li-Shar; Shen, John T.; Wang, Andy C.; Berry, Edward A. (2006). "Estudios cristalográficos de la unión de ligandos al sitio dicarboxilato del complejo II y la identidad del ligando en el estado "inhibido por oxaloacetato"". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics . 1757 (9–10): 1073–1083. doi : 10.1016/j.bbabio.2006.06.015 . ISSN  0005-2728. PMC 1586218 . PMID  16935256. 

Bibliografía

Electroquímica
Bioelectroquímica
Microbiología