La numeración de los "Papas Juan" no se realiza en estricto orden numérico. Aunque ha habido veintiún papas legítimos llamados Juan, la numeración ha llegado al XXIII debido a dos errores administrativos que se introdujeron en la Edad Media: primero, el antipapa Juan XVI se mantuvo en la secuencia de numeración en lugar de eliminarlo; luego, se omitió el número XX porque el Papa Juan XXI contó a Juan XIV dos veces.
El número XX fue omitido debido a una confusión sobre Juan XIV (983-984), que resultó de un error en la transmisión textual de su entrada en el Liber Pontificalis . Esta entrada originalmente especificaba no solo la duración de su pontificado ("VIII mens." = ocho meses), sino también la duración de su posterior encarcelamiento por el antipapa Bonifacio VII , "per IV menses" ("durante cuatro meses"). En el siglo XI, algún tiempo después del pontificado de Juan XIX , esta entrada sobre Juan XIV fue malinterpretada como si se refiriera a dos "Papas Juan" diferentes, el primero que reinó durante ocho meses y fue sucedido directamente por otro Juan que reinó durante cuatro meses:
Al distinguir a estos dos Juanes, el segundo pasó a ser denominado "Iohannes XIV. bis" ("Juan XIV el segundo") y fue confundido con un personaje histórico, el cardenal diácono Juan hijo de Roberto, que se opuso a Bonifacio VII después de la muerte de Juan XIV. Como Juan XV a XIX parecía haber descuidado la existencia de Juan XIV "bis", Pedro Julião "corrigió" este "error" adoptando el nombre de Juan XXI.
Dado que estos cálculos se descubrieron en el siglo XIX, ahora los papas se enumeran utilizando los números que utilizaron durante sus reinados. No existe un Juan XX real. Sin embargo, los "Papas Juan XV" a "XIX" tienen numeración dual "XVI" a "XX" porque algunas fuentes ya habían utilizado la secuencia de numeración alterada. Juan XXI también tiene numeración dual XX en obras más antiguas.
Durante el Cisma de Occidente , hubo dos aspirantes al papado. El Concilio de Pisa (1409) intentó poner fin al cisma eligiendo a Alejandro V como papa. Sin embargo, ni el antipapa de Aviñón ni el papa romano estaban dispuestos a abdicar, por lo que ahora había tres aspirantes al papado. El antipapa de Pisa, Alejandro V, fue sucedido por Juan XXIII , quien abdicó en 1415 como parte de un acuerdo para poner fin al cisma.
Hasta mediados del siglo XX, el Anuario Pontificio consideraba legítima la línea romana hasta 1409, seguida por la línea pisana hasta 1415. Los últimos tres papas del cisma fueron enumerados como Gregorio XII (1406-1409), Alejandro V (1409-1410) y Juan XXIII (1410-1415). [7] Sin embargo, el Cisma de Occidente fue reinterpretado cuando el papa Juan XXIII (1958-1963) decidió reutilizar el ordinal XXIII, citando "veintidós [sic] Juanes de legitimidad indiscutible". [8] Esto se refleja en las ediciones modernas del Anuario Pontificio , que extienden el reinado de Gregorio XII hasta 1415. Los papas pisanos Alejandro V y Juan XXIII ahora son considerados antipapas.