stringtranslate.com

Mutación sin sentido

En genética , una mutación sin sentido es una mutación puntual en una secuencia de ADN que da como resultado un codón sin sentido , o un codón de parada prematuro en el ARNm transcrito , y conduce a un producto proteico truncado, incompleto y posiblemente no funcional . [1] Las mutaciones sin sentido no siempre son dañinas; [2] el efecto funcional de una mutación sin sentido depende de muchos aspectos, como la ubicación del codón de parada dentro del ADN codificante . [2] Por ejemplo, el efecto de una mutación sin sentido depende de la proximidad de la mutación sin sentido al codón de parada original y del grado en que se ven afectados los subdominios funcionales de la proteína. [3] Como mutaciones sin sentido conducen a la terminación prematura de las cadenas polipeptídicas ; también se les llama mutaciones de terminación de cadena. [4]

Las mutaciones sin sentido se diferencian de las mutaciones sin sentido porque son mutaciones puntuales que exhiben un único cambio de nucleótido para provocar la sustitución de un aminoácido diferente . Una mutación sin sentido también se diferencia de una mutación continua , que es una mutación puntual que elimina un codón de parada. Alrededor del 10% de los pacientes que enfrentan enfermedades genéticas tienen mutaciones sin sentido. [5] Algunas de las enfermedades que estas mutaciones pueden causar son distrofia muscular de Duchenne (DMD), fibrosis quística (FQ), [6] atrofia muscular espinal (AME), cánceres , enfermedades metabólicas y trastornos neurológicos. [5] [7] La ​​tasa de mutaciones sin sentido varía de un gen a otro y de un tejido a otro, pero el silenciamiento genético ocurre en todos los pacientes con una mutación sin sentido. [5]

Ejemplo sencillo

 ADN : 5' - ATG ACT CAC CGA GCG CGA AGC TGA - 3' 3' - TAC TGA GTG GCT CGC GCT TCG ACT - 5' ARNm : 5' - AUG ACU CAC CGA GCG CGA AGC UGA - 3'Proteína: Met Thr His Arg Ala Arg Ser Stop

El ejemplo anterior comienza con una secuencia de ADN 5' con 24 nucleótidos (8 codones tripletes) y su cadena complementaria que se muestra a continuación. La siguiente fila resalta la cadena de ARNm 5' , que se genera mediante transcripción . Por último, la fila final muestra cuáles son los aminoácidos que se traducen de cada codón respectivo , y el octavo y último codón representa el codón de parada . Los codones correspondientes al cuarto aminoácido, Arginina , están resaltados porque sufrirán una mutación sin sentido en la siguiente figura de este ejemplo.

 ADN : 5' - ATG ACT CAC TGA GCG CGA AGC TGA - 3' 3' - TAC TGA GTG ACT CGC GCT TCG ACT - 5' ARNm : 5' - AUG ACU CAC UGA GCG CGU AGC UGA - 3'Proteína: cumplió  con su parada

Ahora, supongamos que se introdujo una mutación sin sentido en el cuarto codón de la secuencia de ADN 5' (CGA), lo que provocó que la citosina fuera reemplazada por timina , produciendo TGA en la secuencia de ADN 5' y ACT en la cadena complementaria. Debido a que ACT se transcribe como UGA, se traduce como un codón de parada. Esto hace que los codones restantes del ARNm no se traduzcan en proteína porque el codón de parada se alcanza prematuramente durante la traducción. Esto puede producir un producto proteico truncado (es decir, abreviado), que muy a menudo carece de la funcionalidad de la proteína normal no mutante. [1]

Posibles resultados

Perjudicial

Los resultados nocivos representan la mayoría de las mutaciones sin sentido y son el resultado más común que se observa de forma natural. Las mutaciones perjudiciales y sin sentido disminuyen la aptitud general y el éxito reproductivo del organismo . [8] Por ejemplo, una mutación sin sentido que ocurre en un gen que codifica una proteína puede causar defectos estructurales o funcionales en la proteína que alteran la biología celular. Dependiendo de la importancia de las funciones de esta proteína, esta alteración ahora podría ser perjudicial para la aptitud y la supervivencia de ese organismo. [8]

Neutral

Cuando una mutación sin sentido es neutral, no proporciona beneficios ni daños. Estos ocurren cuando los efectos de la mutación pasan desapercibidos. En otras palabras, esto significa que la mutación no afecta positiva ni negativamente al organismo. Como este efecto pasa desapercibido, faltan artículos que describan tales mutaciones. Un ejemplo de este tipo de mutación sin sentido es aquella que ocurre directamente antes del codón de parada original para esa proteína determinada. [8] Debido a que esta mutación ocurrió tan cerca del final de la cadena de proteínas, el impacto de este cambio podría no ser tan significativo. Esto sugeriría que este aminoácido que fue mutado no tuvo un gran impacto en la estructura o función general de la proteína o del organismo en su conjunto. Este escenario es raro, pero posible. [8]

Beneficioso

Las mutaciones beneficiosas sin sentido se consideran los resultados más raros de las mutaciones sin sentido posibles. Las mutaciones beneficiosas sin sentido aumentan la aptitud general y el éxito reproductivo de un organismo, lo contrario de los efectos de una mutación perjudicial. [2] [8] Debido a que una mutación sin sentido introduce un codón de parada prematuro dentro de una secuencia de ADN, es extremadamente improbable que este escenario realmente pueda beneficiar al organismo. [1] Un ejemplo de esto ocurriría con una mutación sin sentido que impacta una proteína disfuncional que libera toxinas . El codón de parada que trae esta mutación impediría que esta proteína disfuncional realice correctamente su función. Impedir que esta proteína funcione con toda su fuerza provoca que se liberen menos toxinas y se mejore la condición física del organismo. Este tipo de situaciones con mutaciones sin sentido ocurren con mucha menos frecuencia que los resultados nocivos. [8]

Suprimir mutaciones sin sentido

En la foto de la izquierda se muestra un diagrama de la traducción normal que ocurre sin mutación. Los círculos azules son los péptidos que ya se han traducido, mientras que los círculos grises son los péptidos que se traducirán a continuación. En el centro hay un diagrama de una mutación sin sentido donde el codón UUG se traduce al codón de parada UAG. El codón de parada recluta un factor de liberación, poniendo fin a la traducción. A la derecha hay un diagrama del mecanismo de supresión del ARNt donde tanto el codón como el ARNt están mutados, lo que da como resultado la supresión del ARNt. El ARNt Tyr mutado tiene el anticodón AUC que reconoce el codón de parada UAG y continúa la traducción de proteínas. [9]

Desintegración del ARNm mediada por tonterías

A pesar de la tendencia esperada de que los codones de terminación prematura produzcan productos polipeptídicos acortados, de hecho, la formación de proteínas truncadas no ocurre con frecuencia in vivo . Muchos organismos (incluidos los humanos y especies inferiores, como la levadura ) emplean una vía de desintegración del ARNm mediada sin sentido , que degrada los ARNm que contienen mutaciones sin sentido antes de que puedan traducirse en polipéptidos no funcionales.

Supresión de ARNt

Debido a que las mutaciones sin sentido dan como resultado un ARNm alterado con un codón de parada prematuro, una forma de suprimir el daño causado a la función de la proteína final es alterar el ARNt que lee el ARNm. Estos ARNt se denominan ARNt supresores . Si el codón de terminación es UAG, cualquier otro aminoácido tRNA podría alterarse de su anticodón original a AUC para que reconozca el codón UAG. Esto dará como resultado que la proteína no se trunca, pero aún puede tener un aminoácido alterado. Estas mutaciones supresoras de ARNt solo son posibles si la célula tiene más de un ARNt que lee un codón particular; de lo contrario, la mutación mataría a la célula. Los únicos codones de parada son UAG, UAA y UGA. Los supresores UAG y UAA leen sus respectivos codones de parada en lugar de su codón original, pero los supresores UAA también leen UAG debido al emparejamiento de bases oscilantes . Los supresores de UGA son muy raros. Otro obstáculo que superar en esta técnica es el hecho de que los codones de parada también son reconocidos por los factores de liberación , por lo que el ARNt aún necesita competir con los factores de liberación para mantener la traducción. Debido a esto, la supresión suele tener sólo entre un 10 y un 40% de éxito. Estas mutaciones supresoras del ARNt también se dirigen a codones de terminación que no son mutaciones, lo que hace que algunas proteínas sean mucho más largas de lo que deberían ser. Sólo las bacterias y los eucariotas inferiores pueden sobrevivir con estas mutaciones; las células de mamíferos y de insectos mueren como resultado de una mutación supresora. [4]

Por razones históricas, los tres codones de parada recibieron nombres (ver Codones de parada ): UAG se llama codón ámbar, UAA se llama codón ocre y UGA se llama codón ópalo.

Mutaciones sin sentido asociadas a enfermedades comunes

Selección de mutaciones destacables, ordenadas en una tabla estándar del código genético de aminoácidos . [10] las mutaciones sin sentido están marcadas con flechas rojas.

Las mutaciones sin sentido comprenden alrededor del 20% de las sustituciones de un solo nucleótido dentro de secuencias codificantes de proteínas que provocan enfermedades humanas. [11] La patología mediada por mutaciones sin sentido a menudo se atribuye a cantidades reducidas de proteína de longitud completa, porque sólo entre el 5% y el 25% de las transcripciones que poseen mutaciones sin sentido no sufren desintegración mediada por sin sentido (NMD). [12] [11] La traducción del resto del ARNm sin sentido puede generar variantes proteicas abreviadas con efectos tóxicos. [13]

Veintitrés sustituciones diferentes de nucleótidos de un solo punto son capaces de convertir un codón continuo en un codón de terminación, siendo las mutaciones CGA TGA y CAG TAG las sustituciones relacionadas con enfermedades más comunes caracterizadas en la Base de datos de mutaciones genéticas humanas (HGMD). . [11] Como resultado de diferentes frecuencias de sustitución para cada nucleótido, las proporciones de los tres codones de parada generados por mutaciones sin sentido que inducen enfermedades difieren de las distribuciones de codones de parada en variantes genéticas no enfermas. [11] En particular, el codón TAG está sobrerrepresentado, mientras que los codones TGA y TAA están subrepresentados en mutaciones sin sentido relacionadas con enfermedades. [11]

La eficacia de la terminación de la traducción está influenciada por la secuencia del codón de parada específico en el ARNm, siendo la secuencia UAA la que produce la terminación más alta. [14] Las secuencias que rodean el codón de parada también afectan la eficiencia de la terminación. [14] En consecuencia, la patología subyacente de las enfermedades causadas por mutaciones sin sentido depende en última instancia de la identidad del gen mutado y de la ubicación específica de la mutación.

Ejemplos de enfermedades inducidas por mutaciones sin sentido incluyen:

Mutaciones sin sentido en otros genes también pueden provocar disfunción de varios tejidos u sistemas de órganos:

SMAD8

SMAD8 es el octavo homólogo de la familia de genes ENDOGLIN y participa en la señalización entre TGF-b/BMP . Se ha identificado que nuevas mutaciones sin sentido en SMAD8 están asociadas con la hipertensión arterial pulmonar. [15] El sistema pulmonar depende de SMAD1, SMAD5 y SMAD 8 para regular la función vascular pulmonar. La regulación negativa y la pérdida de señales que normalmente opera SMAD8 contribuyeron a la patogénesis de la hipertensión arterial pulmonar. [15] Se descubrió que el gen ALK1 , parte de la familia de señalización TGF-B, había sido mutado y al mismo tiempo regulaba negativamente el gen SMAD8 en pacientes con hipertensión arterial pulmonar. [15] Los mutantes SMAD8 no fueron fosforilados por ALK1, lo que interrumpió las interacciones con SMAD4 que normalmente permitirían la señalización en organismos de tipo salvaje . [15]

LGR4

"LGR4 se une a R-espondinas para activar la vía de señalización Wnt" . [16] La señalización Wnt regula la masa ósea y la diferenciación de osteoblastos y es importante para el desarrollo de los huesos, el corazón y los músculos. [16] Una mutación sin sentido de LGR4 en una población sana se ha relacionado con una baja densidad de masa ósea y síntomas de osteoporosis . Los ratones mutantes LGR4 mostraron que la baja masa ósea observada no se debe a la pérdida ósea relacionada con la edad. [16] Las mutaciones en LGR4 se han asociado con linajes familiares con antecedentes médicos de trastornos óseos raros. [16] Los ratones de tipo salvaje que carecen de LGR4 también mostraron un retraso en la diferenciación de osteoblastos durante el desarrollo, lo que demuestra el importante papel de LGR4 en la regulación y el desarrollo de la masa ósea. [dieciséis]

Terapéuticas dirigidas a enfermedades por mutaciones sin sentido

Las terapias para enfermedades causadas por mutaciones sin sentido intentan recapitular la función de tipo salvaje disminuyendo la eficacia de NMD, facilitando la lectura del codón de parada prematuro durante la traducción o editando la mutación genómica sin sentido. [17]

Se están explorando oligonucleótidos antisentido para suprimir la expresión de NMD y proteínas de terminación de la traducción en modelos animales de enfermedades inducidas por mutaciones sin sentido. [17] [18] Otras terapias de ARN que se están investigando incluyen ARNt supresores sintéticos que permiten a los ribosomas insertar un aminoácido, en lugar de iniciar la terminación de la cadena, al encontrar codones de parada prematuros. [17]

Se han utilizado sustituciones de un solo nucleótido basadas en CRISPR-Cas9 para generar codones de aminoácidos a partir de codones de terminación, logrando una tasa de éxito en la edición del 10 % en cultivos celulares. [19]

La lectura completa se ha logrado utilizando fármacos de moléculas pequeñas como aminoglucósidos y negamicina. [17] Un oxadiazol , el ataluren (anteriormente PTC124), facilita la lectura selectiva de codones de terminación aberrantes, lo que lo convierte en un tratamiento potencial contra enfermedades inducidas por mutaciones sin sentido. [20] Ataluren, vendido bajo el nombre comercial Translarna, es actualmente un tratamiento aprobado para la distrofia muscular de Duchenne en el espacio económico europeo y Brasil . [21] [22] Sin embargo, los ensayos de fase III de Ataluren como tratamiento terapéutico para la fibrosis quística no han logrado cumplir sus criterios de valoración principales. [23] [24]

Ver también

Enlaces externos y referencias

  1. ^ abc Sharma, Jyoti; Keeling, Kim M.; Rowe, Steven M. (15 de agosto de 2020). "Enfoques farmacológicos para atacar mutaciones sin sentido en la fibrosis quística". Revista europea de química medicinal . 200 : 112436. doi : 10.1016/j.ejmech.2020.112436. ISSN  0223-5234. PMC  7384597 . PMID  32512483.
  2. ^ abc Potapova, Nadezhda A. (1 de mayo de 2022). "Mutaciones sin sentido en eucariotas". Bioquímica (Moscú) . 87 (5): 400–412. doi :10.1134/S0006297922050029. ISSN  1608-3040. PMID  35790376. S2CID  248793651.
  3. ^ Balasubramanian, Suganthi; Fu, Yao; Pawashé, Mayur; McGillivray, Patrick; Jin, Mike; Liu, Jeremy; Karczewski, Konrad J.; MacArthur, Daniel G.; Gerstein, Mark (29 de agosto de 2017). "Uso de ALoFT para determinar el impacto de supuestas variantes de pérdida de función en genes codificadores de proteínas". Comunicaciones de la naturaleza . 8 (1): 382. Código bibliográfico : 2017NatCo...8..382B. doi :10.1038/s41467-017-00443-5. ISSN  2041-1723. PMC 5575292 . PMID  28851873. 
  4. ^ ab Clark, David P.; Pazdernik, Nanette J.; McGehee, Michelle R. (2019), "Mutaciones y reparación", Biología molecular , Elsevier, págs. 832–879, doi :10.1016/b978-0-12-813288-3.00026-4, ISBN 9780128132883, S2CID  239340633 , consultado el 2 de diciembre de 2022
  5. ^ abc "Corrección de mutaciones sin sentido en enfermedades humanas: un enfoque para la medicina dirigida | WorldCat.org". www.worldcat.org . Consultado el 2 de diciembre de 2022 .
  6. ^ Guimbellot, Jennifer; Sharma, Jyoti; Rowe, Steven M. (noviembre de 2017). "Hacia una terapia inclusiva con moduladores de CFTR: avances y desafíos". Neumología Pediátrica . 52 (Suplemento 48): T4 – S14. doi :10.1002/ppul.23773. ISSN  8755-6863. PMC 6208153 . PMID  28881097. 
  7. ^ Benhábiles, Hana; Jia, Jieshuang; Lejeune, Fabrice (1 de enero de 2016), Benhabiles, Hana; Jia, Jieshuang; Lejeune, Fabrice (eds.), "Capítulo 2: Patologías susceptibles de ser objeto de terapias de mutaciones sin sentido", Corrección de mutaciones sin sentido en enfermedades humanas , Boston: Academic Press, págs. 77-105, ISBN 978-0-12-804468-1, consultado el 2 de diciembre de 2022
  8. ^ Editores de abcdef, BD (26 de agosto de 2018). "Mutación sin sentido: definición, ejemplo, resultados". Diccionario de biología . Consultado el 2 de diciembre de 2022 . {{cite web}}: |last=tiene nombre genérico ( ayuda )
  9. ^ Murgola, Emanuel J. (diciembre de 1985). "ARNt, SUPRESIÓN Y EL CÓDIGO". Revista Anual de Genética . 19 (1): 57–80. doi : 10.1146/annurev.ge.19.120185.000421. ISSN  0066-4197. PMID  2417544.
  10. ^ Las referencias de la imagen se encuentran en la página de Wikimedia Commons en: Commons:Archivo:Notable mutaciones.svg#Referencias.
  11. ^ abcde Mort, Mateo; Ivanov, Dobril; Cooper, David N.; Chuzhanova, Nadia A. (agosto de 2008). "Un metanálisis de mutaciones sin sentido que causan enfermedades genéticas humanas". Mutación humana . 29 (8): 1037–1047. doi :10.1002/humu.20763. PMID  18454449. S2CID  205918343.
  12. ^ Isken, Olaf; Maquat, Lynne E. (1 de agosto de 2007). "Control de calidad del ARNm eucariota: proteger a las células de la función anormal del ARNm". Genes y desarrollo . 21 (15): 1833–1856. doi : 10.1101/gad.1566807 . ISSN  0890-9369. PMID  17671086.
  13. ^ Khajavi, Mehrdad; Inoue, Ken; Lupski, James R. (octubre de 2006). "La descomposición del ARNm mediada por tonterías modula el resultado clínico de una enfermedad genética". Revista europea de genética humana . 14 (10): 1074–1081. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201649 . ISSN  1476-5438. PMID  16757948. S2CID  3450423.
  14. ^ ab Keeling, Kim M.; Du, Ming; Bedwell, David M. (2013). Terapias de enfermedades asociadas a tonterías. Biociencia de las Landas.
  15. ^ abcd Shintani, M; Yagi, H; Nakayama, T; Saji, T; Matsuoka, R (1 de mayo de 2009). "Una nueva mutación sin sentido de SMAD8 asociada con hipertensión arterial pulmonar". Revista de genética médica . 46 (5): 331–337. doi :10.1136/jmg.2008.062703. ISSN  0022-2593. PMID  19211612. S2CID  44932041.
  16. ^ abcde Styrkarsdottir, Unnur; Thorleifsson, Gudmar; Sulem, Patricio; Gudbjartsson, Daniel F.; Sigurdsson, Asgeir; Jonasdottir, Aslaug; Jonasdottir, Adalbjorg; Oddsson, Asmundur; Helgason, Agnar; Magnusson, Olafur T.; Walters, G. Bragi; Frigge, Michael L.; Helgadottir, Hafdis T.; Johannsdóttir, Hrefna; Bergsteinsdottir, Kristin (23 de mayo de 2013). "La mutación sin sentido en el gen LGR4 está asociada con varias enfermedades humanas y otros rasgos". Naturaleza . 497 (7450): 517–520. Código Bib :2013Natur.497..517S. doi : 10.1038/naturaleza12124. ISSN  0028-0836. PMID  23644456. S2CID  205233843.
  17. ^ abcd Morais, Pedro; Adachi, Hironori; Yu, Yi-Tao (20 de junio de 2020). "Supresión de mutaciones sin sentido mediante nuevas tecnologías emergentes". Revista Internacional de Ciencias Moleculares . 21 (12): 4394. doi : 10.3390/ijms21124394 . ISSN  1422-0067. PMC 7352488 . PMID  32575694. 
  18. ^ Huang, Lulú; Aghajan, Mariam; Quesenberry, Tianna; Bajo, Audrey; Murray, Susan F.; Monia, Brett P.; Guo, Shuling (agosto de 2019). "Apuntar a la maquinaria de terminación de traducción con oligonucleótidos antisentido para enfermedades causadas por mutaciones sin sentido". Terapéutica con ácidos nucleicos . 29 (4): 175–186. doi :10.1089/nat.2019.0779. ISSN  2159-3345. PMC 6686700 . PMID  31070517. 
  19. ^ Lee, Choongil; Hyun Jo, Dong; Hwang, Gue-Ho; Yu, Jihyeon; Kim, Jin Hyoung; Park, Se-eun; Kim, Jin-Soo; Kim, Jeong Hun; Bae, Sangsu (7 de agosto de 2019). "CRISPR-Pass: rescate genético de mutaciones sin sentido utilizando editores de base de adenina". Terapia Molecular . 27 (8): 1364-1371. doi :10.1016/j.ymthe.2019.05.013. ISSN  1525-0016. PMC 6698196 . PMID  31164261. 
  20. ^ Welch, Ellen M.; Barton, Elisabeth R.; Zhuo, Jin; Tomizawa, Yuki; Friesen, Westley J.; Trifillis, Panayiota; Paushkin, Sergey; Patel, Meenal; Trotta, Christopher R.; Hwang, Seongwoo; Wilde, Richard G.; Karp, Gary; Takasugi, James; Chen, Guangming; Jones, Stephen (3 de mayo de 2007). "PTC124 se dirige a trastornos genéticos causados ​​por mutaciones sin sentido". Naturaleza . 447 (7140): 87–91. Código Bib :2007Natur.447...87W. doi : 10.1038/naturaleza05756. ISSN  1476-4687. PMID  17450125. S2CID  4423529.
  21. ^ "Terapéutica PTC". Terapéutica PTC | Medido por Momentos . Consultado el 1 de diciembre de 2022 .
  22. ^ "ANVISA aprueba la ampliación de la indicación de PTC Translarna a niños ambulatorios". Tecnología Farmacéutica . 2021-10-26 . Consultado el 1 de diciembre de 2022 .
  23. ^ Kerem, Eitan; Konstan, Michael W; De Boeck, Kris; Acurso, Frank J; Sermet-Gaudelus, Isabelle; Wilschanski, Michael; Elborn, J. Stuart; Melotti, Paola; Bronsveld, Inez (1 de julio de 2014). "Ataluren para el tratamiento de la fibrosis quística con mutaciones sin sentido: un ensayo de fase 3 aleatorizado, doble ciego y controlado con placebo". Medicina respiratoria de The Lancet . 2 (7): 539–547. doi :10.1016/S2213-2600(14)70100-6. PMC 4154311 . PMID  24836205. 
  24. ^ Konstan, MW; Van Devanter, DR; Rowe, SM; Wilschanski, M.; Kerem, E.; Sermet-Gaudelus, I.; DiMango, E.; Melotti, P.; McIntosh, J.; De Boeck, K.; Grupo de estudio ACT CF (julio de 2020). "Eficacia y seguridad de ataluren en pacientes con fibrosis quística con mutaciones sin sentido que no reciben aminoglucósidos inhalados de forma crónica: el ensayo confirmatorio internacional, aleatorizado, doble ciego y controlado con placebo de Ataluren en fibrosis quística (ACT CF)". Revista de fibrosis quística . 19 (4): 595–601. doi :10.1016/j.jcf.2020.01.007. ISSN  1873-5010. PMC 9167581 . PMID  31983658. 

enlaces externos