Familia de motivos tripartitos

La familia de motivos tripartitos ( TRIM ) es una familia de proteínas . ^[1]

Función

Muchas proteínas TRIM son inducidas por interferones , que son un componente importante de la resistencia a los patógenos y se sabe que varias proteínas TRIM son necesarias para restringir la infección por lentivirus . Las proteínas TRIM participan en el reconocimiento de patógenos y en la regulación de vías transcripcionales en la defensa del huésped. ^[2]

Estructura

El motivo tripartito siempre está presente en el extremo N de las proteínas TRIM. El motivo TRIM incluye los siguientes tres dominios: ^[1]

• (1) un dominio de dedo RING
• (2) uno o dos dominios de dedos de zinc B-box
  • cuando solo hay una caja B presente, siempre es una caja B de tipo 2
  • cuando hay dos cajas B presentes, la caja B de tipo 1 siempre precede a la caja B de tipo 2
• (3) región de bobina enrollada

El extremo C de las proteínas TRIM contiene:

• Proteínas del grupo 1 : un dominio C-terminal seleccionado de la siguiente lista:
  • Dominios NHL e IGFLMN, ya sea en asociación o solos
  • Dominio PHD asociado con un bromodominio.
  • Dominio MATH (por ejemplo, TRIM37 )
  • Dominio ARF (por ejemplo, TRIM23 )
  • Dominio EXOIII (por ejemplo, TRIM19 ) o
• Proteínas del grupo 2 : un dominio SPRY C-terminal
  • por ejemplo, TRIM21

Miembros de la familia

La familia TRIM se divide en dos grupos que difieren en la estructura de dominio y la organización genómica: ^[3]

• Los miembros del grupo 1 poseen una variedad de dominios C-terminales y están representados tanto en vertebrados como en invertebrados.
• El grupo 2 está ausente en los invertebrados y posee un dominio SPRY C-terminal ^[4]

Los miembros de la familia incluyen:

• Grupo 1
  • Dominio PHD-BROMO que contiene: TRIM24 (TIF1α), TRIM28 (TIF1β), TRIM33 (TIF1γ): actúan como correpresores
  • 1-10: RECORTAR1 , RECORTAR2, RECORTAR3 , RECORTAR8, RECORTAR9
  • 11-20: RECORTAR12, RECORTAR13, RECORTAR14 , RECORTAR16 , RECORTAR18 , RECORTAR19
  • 21-30: RECORTAR23 , RECORTAR25 , RECORTAR29 , RECORTAR30
  • 31-40: RECORTAR32 , RECORTAR36, RECORTAR37
  • 41-50: TRIM42, TRIM44, TRIM45 , TRIM46, TRIM47
  • 51-60: TRIM51, TRIM53, TRIM54, TRIM55 , TRIM56, TRIM57, TRIM59
  • 61-70: TRIM62 , TRIM63 , TRIM65, TRIM66, TRIM67, TRIM69 , TRIM70
  • 71-75: RECORTAR71
• Grupo 2
  • 1-10: TRIM4, TRIM5 , TRIM6 , TRIM7, TRIM10
  • 11-20: RECORTAR11 , RECORTAR12, RECORTAR15 , RECORTAR17, RECORTAR20
  • 21-30: RECORTAR21 , RECORTAR22 , RECORTAR26, RECORTAR27 , RECORTAR30
  • 31-40: TRIM31 , TRIM34, TRIM35, TRIM38 , TRIM39, TRIM40
  • 41-50: TRIM41 , TRIM43, TRIM48, TRIM49, TRIM50
  • 51-60: TRIM51, TRIM52 , TRIM53, TRIM57, TRIM58, TRIM60
  • 61-70: TRIM61, TRIM64, TRIM68 , TRIM69 , TRIM70
  • 71-75: TRIM72, TRIM73, TRIM74, TRIM75

Referencias

1. Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (mayo de 2001). "La familia de motivos tripartitos identifica compartimentos celulares". EMBO J. 20 (9): 2140–51. doi :10.1093/emboj/20.9.2140. PMC  125245 . PMID  11331580.
2. Ozato K, Shin DM, Chang TH, Morse HC (noviembre de 2008). "Proteínas de la familia TRIM y sus funciones emergentes en la inmunidad innata". Nat. Rev. Inmunol . 8 (11): 849–60. doi :10.1038/nri2413. PMC 3433745 . PMID  18836477. 
3. Sardiello M, Cairo S, Fontanella B, Ballabio A, Meroni G (2008). "El análisis genómico de la familia TRIM revela dos grupos de genes con distintas propiedades evolutivas". BMC evolución. Biol . 8 (1): 225. Código bibliográfico : 2008BMCEE...8..225S. doi : 10.1186/1471-2148-8-225 . PMC 2533329 . PMID  18673550. 
4. Ponting C, Schultz J, Bork P (junio de 1997). "Dominios SPRY en receptores de rianodina (canales de liberación de Ca (2+))". Tendencias Bioquímica. Ciencia . 22 (6): 193–4. doi :10.1016/S0968-0004(97)01049-9. PID  9204703.