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Metavirus

Los metavirus son un género de virus de la familia Metaviridae . [1] Son retrotransposones que invaden el genoma de un huésped eucariota y solo pueden replicarse una vez que el virus ha infectado al huésped. [2] Estos elementos genéticos existen para infectar y replicarse en su genoma huésped y se derivan de elementos ancestrales no relacionados con su huésped. Los metavirus pueden utilizar varios huéspedes diferentes para la transmisión y se ha descubierto que son transmisibles a través del óvulo y el polen de algunas plantas. [3]

El metavirus contiene cinco familias del elemento Ty3/Gypsy con uno o dos marcos de lectura abiertos ; estas familias son mdg1, mdg3, blastopia, 412 y micropia . [4] Cada una de las cinco familias contiene uno o dos marcos de lectura abiertos, gag3 y/o pol3 . [5] Hay evidencia que apoya que la privación de aminoácidos en el genoma huésped de los elementos ha causado con frecuencia un cambio de marco hacia el elemento Ty3 . [6] El metavirus se corresponde con el linaje del gen Ogre/Tat . [7]

Morfología

Las especies de Metavirus son retrotransposones de ARN monocatenario. Tienen una conformación icosaédrica y lineal y no están encerrados en una envoltura. [8] Su diámetro es de aproximadamente 50 nm y suelen tener entre 42 y 52 nm de longitud. [8] Estos elementos genéticos contienen un núcleo y una cápside. [ cita requerida ]

Especies

Se reconocen las siguientes especies: [1]

Evolución

Debido a su alta tasa de mutación y recombinación y su capacidad para realizar transferencia horizontal de genes , la historia evolutiva de muchos retroelementos puede ser difícil de rastrear (Benachenhou et al., 2013). [9] Los científicos a menudo observan los genomas de Metavirus para comparar secuencias de ácidos nucleicos con las secuencias de otros virus, construyendo linajes y proponiendo ancestros comunes. [ cita requerida ]

Existen múltiples taxones de Metavirus que tienen una secuencia genómica homóloga a la de otros géneros de Metaviridae y que sugieren un ancestro común y/o coevolución. [10] Los científicos a menudo observan las proteínas de la cápside en busca de evidencia de la evolución de los Metavirus . [11] Gran parte del linaje de los Metavirus sigue sin resolverse y actualmente se está investigando. [ cita requerida ]

Estudios

Mascagni et al. (2017) realizaron una investigación para encontrar homólogos e identificar hebras en especies de girasol. En el experimento, se extrajo ADN de varias especies de helianthus y se identificaron los genomas de los retrotransposones utilizando el análisis BLASTX. Se construyeron árboles filogenéticos utilizando el método de agrupamiento por unión de vecinos y se construyó una tubería bioinformática para permitir el análisis genómico. Se identificaron dos elementos, SURE y Helicopia, y se colocaron en las superfamilias Gypsy y Copia , respectivamente. [12] Por lo tanto, el elemento SURE pertenece al grupo Gypsy , del linaje Ogre/Tat , del género Metavirus . [12] Un análisis posterior llevó a Mascagni et al. (2017) a identificar mutaciones y concluir que el linaje Metavirus evolucionó antes que Sirevirus. Mascagni et al. (2017) también encontraron evidencia de que los elementos SURE y los elementos Helicopia se habían hibridado, lo que tiene potencial para nuevos linajes.

Nefedova y Kim (2009) realizaron un estudio sobre Drosophila melanogaster para identificar más linajes de Metavirus . Se identificaron homólogos a partir de ADN extraído previamente de retrotransposones y Drosophila melanogaster y se construyeron árboles filogenéticos. [13] Los metavirus poseen el gen env, lo que les permite ser infecciosos, que Nefedova y Kim (2009) concluyeron que se obtuvo a partir de la transferencia horizontal de genes de baculovirus. [13] Metavirus contiene el elemento roo que se cree que se obtuvo a partir de la transferencia de genes de Errantivirus, o más probablemente, los dos géneros comparten un ancestro común . [13]

Referencias

  1. ^ ab "Informe ICTV Metaviridae".
  2. ^ Siebert, C (2006). "Diseño no inteligente" (PDF) . Descubrir .
  3. ^ Singh, R; Finnie, R (septiembre de 1973). "Transmisión de semillas del metavirus del tubérculo fusiforme de la papa a través del óvulo de Scopolia sinensis". Revista Canadiense de Enfermedades de las Plantas . 53 : 153–154.
  4. ^ Nefedova, Lidia; Kim, Alexander. "Mecanismos de transposición de retroelementos LTR: lecciones de Drosophilia melanogaster". Viruses . 9 : 1–10.
  5. ^ Levy, Camille; et al. (2013). "La vacuna de partículas similares a virus induce protección cruzada contra infecciones por metapneumovirus humano en ratones". Vaccine . 31 (25): 2778–2785. doi :10.1016/j.vaccine.2013.03.051. PMID  23583815.
  6. ^ Turkel, Sezai (junio de 2016). "La inanición de aminoácidos mejora el cambio de marco ribosómico programado en el metavirus Ty3 de Saccharomyces cerevisiae". Advances in Biology . 2016 : 1–6. doi : 10.1155/2016/1840782 .
  7. ^ Neumann, P; Pozarkova, D; Macas, J (2003). "El retrotransposón LTR Ogre, altamente abundante en el guisante, se transcribe de forma constitutiva y se empalma parcialmente". Biología molecular de plantas . 53 (3): 399–410. doi :10.1023/B:PLAN.0000006945.77043.ce. PMID  14750527. S2CID  13412101.
  8. ^ ab Menees, Thomas (2018). Índice Springer de virus . Springer Nature. págs. 843–849.
  9. ^ Benachenhou, Farid; Sperber, Göran O.; Bongcam-Rudloff, Erik; Andersson, Göran; Boeke, Jef D.; Blomberg, Jonas (2013). "Estructura conservada e historia evolutiva inferida de repeticiones terminales largas (LTR)". ADN móvil . 4 (1): 5. doi : 10.1186/1759-8753-4-5 . PMC 3601003 . PMID  23369192. 
  10. ^ Koonin, M; Dolja, V; Krupovic, M (2015). "Orígenes y evolución de los virus de eucariotas: la modularidad definitiva". Virología . 479–480: 2–25. doi : 10.1016/j.virol.2015.02.039 . PMC 5898234 . PMID  25771806. 
  11. ^ Gong, Z; Han, G (2018). "Los retroelementos de los insectos proporcionan nuevos conocimientos sobre el origen de los virus de la hepatitis B". Biología molecular y evolución . 35 (9): 2254–2259. doi : 10.1093/molbev/msy129 . PMID  29924338.
  12. ^ ab Mascagni, Farid (2017). "Diferentes historias de dos retrotransposones LTR altamente variables en especies de girasol" (PDF) . Gene . 634 : 5–14. doi :10.1016/j.gene.2017.08.014. hdl : 11568/885451 . PMID  28867564.
  13. ^ abc Nefedove, L (2009). "Filogenia molecular y sistemática de retrotransposones y retrovirus de Drosophila". Biología molecular . 43 (5): 747–756. doi :10.1134/S0026893309050069. S2CID  6078688.

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