Métodos de ácidos nucleicos

Técnicas utilizadas para estudiar los ácidos nucleicos

Los métodos de ácidos nucleicos son las técnicas utilizadas para estudiar los ácidos nucleicos : ADN y ARN .

Purificación

• Extracción de ADN
• Extracción con fenol-cloroformo
• Purificación por minicolumna
• Extracción de ARN
• Método de auge
• Purificación de ADN mediante coeficiente de alteración de arrastre sincrónico (SCODA)

Cuantificación

• Abundancia en peso: cuantificación espectroscópica de ácidos nucleicos
• Abundancia absoluta en número: reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (PCR cuantitativa)
• Abundancia relativa de alto rendimiento: microarreglo de ADN
• Abundancia absoluta de alto rendimiento: análisis serial de expresión genética (SAGE)
• Tamaño: electroforesis en gel

Síntesis

• De novo : síntesis de oligonucleótidos
• Amplificación: reacción en cadena de la polimerasa (PCR), amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP), amplificación mediada por transcripción (TMA)

Cinética

• Resonancia plasmónica de superficie multiparamétrica ^{[1] [2]}
• Interferometría de polarización dual ^[3]
• Microbalanza de cristal de cuarzo con monitorización de disipación (QCM-D) ^[4]

Función genética

• Interferencia de ARN ^[5]

Otro

• Secuenciación por bisulfito
• Secuenciación de ADN
• Clonación de expresión
• Hibridación in situ con fluorescencia
• Laboratorio en un chip
• Comparación de software de simulación de ácidos nucleicos
• Mancha Northern
• Ensayo de run-on nuclear
• La radiactividad en las ciencias de la vida
• Transferencia Southern
• Centrifugación diferencial (gradiente de sacarosa)
• Ensayo de impronta de dedos del pie
• Varios métodos bioinformáticos , como se ve en la lista de software de predicción de la estructura del ARN

Véase también

• Protocolos CSH
• Protocolos actuales

Referencias

1. Tang, Wei; Hu, Shichao; Wang, Huaming; Zhao, Yan; Li, Na; Liu, Feng (23 de septiembre de 2014). "Un traductor molecular universal para dianas no basadas en ácidos nucleicos que permite ensamblajes dinámicos de ADN y operaciones lógicas". Chem. Commun . 50 (92): 14352–14355. doi :10.1039/C4CC07041K. PMID  25295484.
2. Ihalainen, Petri; Pettersson, Fredrik; Pesonen, Markus; Viitala, Tapani; Määttänen, Anni; Österbacka, Ronald; Peltonen, Jouko (7 de marzo de 2014). "Un estudio impedimétrico de la hibridación de ADN en electrodos de oro impresos por inyección de tinta sobre papel". Nanotecnología . 25 (9): 094009. Código bibliográfico : 2014Nanot..25i4009I. doi :10.1088/0957-4484/25/9/094009. PMID  24522116. S2CID  206070778.
3. Berney, H.; Oliver, K. (2005). "Caracterización del tamaño y la densidad de la inmovilización e hibridación del ADN mediante interferometría de polarización dual". Biosensores y bioelectrónica . 21 (4): 618–626. doi :10.1016/j.bios.2004.12.024. PMID  16202875.
4. Dixon, Matthew C. (julio de 2008). "Microbalanza de cristal de cuarzo con monitorización de disipación: permite la caracterización en tiempo real de materiales biológicos y sus interacciones". Journal of Biomolecular Techniques . 19 (3): 151–158. PMC 2563918 . PMID  19137101. 
5. Hannon, Gregory J. (julio de 2002). "Interferencia de ARN". Nature . 418 (6894): 244–251. Bibcode :2002Natur.418..244H. doi :10.1038/418244a. ISSN  1476-4687. PMID  12110901. S2CID  4426281.

Enlaces externos

• Protocolos para el aislamiento, clonación y secuenciación de ADN recombinante