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Región intergénica

Una región intergénica es un tramo de secuencias de ADN ubicadas entre genes . [1] Las regiones intergénicas pueden contener elementos funcionales y ADN basura .

Propiedades y funciones

Las regiones intergénicas pueden contener una serie de secuencias de ADN funcionales, como promotores y elementos reguladores , potenciadores , espaciadores y (en eucariotas) centrómeros . [2] También pueden contener orígenes de replicación , regiones de unión de andamiaje y transposones y virus . [2]

Los elementos de ADN no funcionales, como los pseudogenes y el ADN repetitivo , ambos tipos de ADN basura , también se pueden encontrar en regiones intergénicas, aunque también pueden estar ubicados dentro de los genes en los intrones. [2] Es posible que estas regiones contengan elementos funcionales aún no identificados, como genes no codificantes o secuencias reguladoras. [3] Esto ocurre de hecho ocasionalmente, pero la cantidad de ADN funcional descubierto generalmente constituye solo una pequeña fracción de la cantidad total de ADN intergénico o intrónico. [3]

Regiones intergénicas en diferentes organismos

En los humanos, las regiones intergénicas comprenden aproximadamente el 50% del genoma , mientras que este número es mucho menor en las bacterias (15%) y las levaduras (30%). [4]

Al igual que ocurre con la mayoría de los demás ADN no codificantes, el contenido de GC de las regiones intergénicas varía considerablemente entre especies. Por ejemplo, en Plasmodium falciparum , muchas regiones intergénicas tienen un contenido de AT del 90 %. [5]

Evolución molecular de regiones intergénicas

Los elementos funcionales en las regiones intergénicas evolucionarán lentamente porque su secuencia se mantiene mediante selección negativa . En especies con genomas muy grandes, un gran porcentaje de regiones intergénicas es probablemente ADN basura y evolucionará a una tasa neutra de evolución. [6] [7] [ verificación necesaria ] Las secuencias de ADN basura no se mantienen mediante selección purificadora, pero pueden ocurrir mutaciones de ganancia de función con efectos perjudiciales para la aptitud. [8]

Los métodos de inferencia filoestratigráfica y bioinformática han demostrado que las regiones intergénicas pueden, en escalas de tiempo geológicas, evolucionar transitoriamente hacia secuencias de marco de lectura abierto que imitan las de los genes codificadores de proteínas y, por lo tanto, pueden conducir a la evolución de nuevos genes codificadores de proteínas en un proceso conocido como nacimiento de genes de novo . [9]

Véase también

Referencias

  1. ^ Tropp BE (2008). Biología molecular: de los genes a las proteínas . Jones & Bartlett Learning. ISBN 9780763709167.
  2. ^ abc Alberts, Bruce (2014). Biología celular esencial (4.ª ed.). Garland Pub., págs. 172-209. ISBN 978-0815345251.
  3. ^ ab Palazzo AF, Lee ES (enero de 2015). "ARN no codificante: ¿qué es funcional y qué es basura?". Frontiers in Genetics . 60 (2): e1004351. doi : 10.3389/fgene.2015.00002 . PMC 4306305 . PMID  25674102. 
  4. ^ Francis WR, Wörheide G (junio de 2017). "Relaciones similares de intrones con secuencias intergénicas en los genomas animales". Genome Biology and Evolution . 9 (6): 1582–1598. doi :10.1093/gbe/evx103. PMC 5534336 . PMID  28633296. 
  5. ^ Gardner MJ, Hall N, Fung E, White O, Berriman M, Hyman RW, et al. (octubre de 2002). "Secuencia del genoma del parásito de la malaria humana Plasmodium falciparum". Nature . 419 (6906): 498–511. doi : 10.1093/molbev/msj050 . PMID  16280547.
  6. ^ Lynch, Michael (1 de febrero de 2006). "Los orígenes de la estructura génica eucariota". Biología molecular y evolución . 23 (2): 450–468. doi : 10.1093/molbev/msj050 . ISSN  1537-1719. PMID  16280547.
  7. ^ Papadopoulos, Chris; Callebaut, Isabelle; Gelly, Jean-Christophe; Hatin, Isabelle; Namy, Olivier; Renard, Maxime; Lespinet, Olivier; Lopes, Anne (2021). "ORFs intergénicos como módulos estructurales elementales del nacimiento de genes de novo y la evolución de proteínas". Genome Research . 31 (12): 2303–2315. doi :10.1101/gr.275638.121. ISSN  1088-9051. PMC 8647833 . PMID  34810219. 
  8. ^ Palazzo AF, Gregory TR (mayo de 2014). "El caso del ADN basura". PLOS Genetics . 10 (5): e1004351. doi : 10.1371/journal.pgen.1004351 . PMC 4014423 . PMID  24809441. 
  9. ^ Papadopoulos C, Callebaut I, Gelly JC, Hatin I, Namy O, Renard M, Lespinet O, Lopes A (diciembre de 2021). "ORFs intergénicos como módulos estructurales elementales del nacimiento de genes de novo y la evolución de proteínas". Genome Research . 31 (12): 2303–2315. doi :10.1101/gr.275638.121. PMC 8647833 . PMID  34810219. 

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