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Proteína de unión a acil-CoA

En biología molecular, la proteína de unión a acil-CoA (ACBP) es una proteína pequeña (10 kDa) que se une a ésteres de acil-CoA de cadena media y larga con una afinidad muy alta y puede funcionar como un transportador intracelular de ésteres de acil-CoA . [1] La ACBP también se conoce como inhibidor de la unión al diazepam (DBI) o endozepina (EP) debido a su capacidad para desplazar al diazepam del sitio de reconocimiento de la benzodiazepina (BZD) ubicado en el receptor GABA tipo A. Por lo tanto, es posible que esta proteína también actúe como un neuropéptido para modular la acción del receptor GABA . [2]

La ACBP es una proteína altamente conservada de aproximadamente 90 aminoácidos que se encuentra en los cuatro reinos eucariotas , Animalia, Plantae, Fungi y Protista, y en algunas especies eubacterianas . [3]

Aunque la ACBP se presenta como una proteína completamente independiente, se han identificado dominios ACB intactos en varias proteínas grandes y multifuncionales en una variedad de especies eucariotas . Estas incluyen proteínas grandes asociadas a la membrana con dominios ACB N-terminales, enzimas multifuncionales con ACB y dominios de enoil-CoA peroxisomal Delta(3), Delta(2)-enoil-CoA isomerasa y proteínas con un dominio ACB y repeticiones de anquirina . [3]

El dominio ACB consta de cuatro hélices alfa dispuestas en forma de cuenco con un sitio de unión de acil-CoA altamente expuesto. El ligando se une a través de interacciones específicas con residuos de la proteína, en particular varias cargas positivas conservadas que interactúan con el grupo fosfato en la fracción de adenosina-3'fosfato, y la cadena de acilo está intercalada entre las superficies hidrofóbicas de CoA y la proteína. [4]

Otras proteínas que contienen un dominio ACB incluyen:

Referencias

  1. ^ Rose TM, Schultz ER, Todaro GJ (diciembre de 1992). "Clonación molecular del gen del homólogo de levadura (ACB) de la proteína inhibidora de unión a diazepam/endozepina/acil-CoA". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 89 (23): 11287–91. doi : 10.1073/pnas.89.23.11287 . PMC  50535 . PMID  1454809.
  2. ^ Costa E, Guidotti A (1991). "Inhibidor de unión al diazepam (DBI): un péptido con múltiples acciones biológicas". Life Sci . 49 (5): 325–44. doi : 10.1016/0024-3205(91)90440-M . PMID  1649940.
  3. ^ ab Burton M, Rose TM, Faergeman NJ, Knudsen J (diciembre de 2005). "Evolución de la proteína de unión a acil-CoA (ACBP)". Biochem. J . 392 (Pt 2): 299–307. doi :10.1042/BJ20050664. PMC 1316265 . PMID  16018771. 
  4. ^ van Aalten DM, Milne KG, Zou JY, Kleywegt GJ, Bergfors T, Ferguson MA, Knudsen J, Jones TA (mayo de 2001). "Diferencias en los sitios de unión reveladas por las estructuras cristalinas de Plasmodium falciparum y la proteína de unión a acil-CoA bovina". J. Mol. Biol . 309 (1): 181–92. doi :10.1006/jmbi.2001.4749. PMID  11491287.
  5. ^ Pusch W, Balvers M, Hunt N, Ivell R (agosto de 1996). "Un nuevo péptido similar a la endozepina (ELP) se expresa exclusivamente en células germinales masculinas". Mol. Cell. Endocrinol . 122 (1): 69–80. doi :10.1016/0303-7207(96)03874-9. PMID  8898349. S2CID  36504570.
  6. ^ Suk K, Kim YH, Hwang DY, Ihm SH, Yoo HJ, Lee MS (mayo de 1999). "Clonación molecular y expresión de un nuevo ADNc humano relacionado con el inhibidor de la unión del diazepam". Biochim. Biophys. Acta . 1454 (1): 126–31. doi : 10.1016/s0925-4439(99)00033-2 . PMID  10354522.
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