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Subtilasa

Las subtilasas son una familia de serina proteasas similares a la subtilisina . Parecen haber desarrollado de forma independiente y convergente una tríada catalítica Asp / Ser / His , como en las serina proteasas tripsina . La estructura de las proteínas de esta familia muestra que tienen un pliegue alfa/beta que contiene una lámina beta paralela de siete cadenas .

La familia de las subtilisinas es la segunda familia de serina proteasas más grande caracterizada hasta la fecha. Actualmente se conocen más de 200 subtilasas, más de 170 de las cuales con su secuencia de aminoácidos completa. [2] La subtilasa está muy extendida y se encuentra en eubacterias, arqueobacterias, eucariotas y virus. [3] La gran mayoría de la familia son endopeptidasas , aunque existe una exopeptidasa , la tripeptidil peptidasa . [3] [4] Se han determinado las estructuras de varios miembros de la familia de las subtilisinas, lo que demuestra que las subtilisinas explotan la misma tríada catalítica que las quimotripsinas, aunque los residuos aparecen en un orden diferente (His/Asp/Ser en la quimotripsina y Asp/His/Ser en la subtilisina); por lo demás, las estructuras no muestran similitud con ninguna otra proteína. [3] [4] Algunas subtilisinas son proteínas en mosaico , mientras que otras contienen extensiones N- y C-terminales que no muestran similitud de secuencia con ninguna otra proteína conocida. [3] Basándose en la homología de secuencia , se ha propuesto una subdivisión en seis familias. [2]

Las endopeptidasas procesadoras de proproteínas kexina , furina y enzimas relacionadas forman una subfamilia distinta conocida como la subfamilia kexina (S8B). Estas escinden preferentemente el extremo C a aminoácidos básicos apareados. Los miembros de esta subfamilia pueden identificarse por motivos sutilmente diferentes alrededor del sitio activo. [3] [4] Los miembros de la familia kexina, junto con las endopeptidasas R, T y K de la levadura Tritirachium y la peptidasa degradadora de cutícula de Metarhizium, requieren activación de tiol. Esto puede atribuirse a la presencia de Cys-173 cerca de la histidina activa. [4] Solo se conoce un miembro viral de la familia subtilisina, una proteasa de 56 kDa del virus del herpes 1, que infecta al bagre de canal. [3]

Las sedolisinas (serina-carboxil peptidasas) son enzimas proteolíticas cuyo plegamiento se asemeja al de la subtilisina; sin embargo, son considerablemente más grandes, y los dominios catalíticos maduros contienen aproximadamente 375 aminoácidos. Las características definitorias de estas enzimas son una tríada catalítica única, Ser/Glu/Asp, así como la presencia de un residuo de ácido aspártico en el agujero del oxianión. Se han resuelto estructuras cristalinas de alta resolución para la sedolisina de Pseudomonas sp. 101, así como para la kumamolisina de una bacteria termófila, Bacillus novo sp. MN-32. Las mutaciones en el gen humano conducen a una enfermedad neurodegenerativa fatal. [5]

Proteínas humanas que contienen este dominio

FURINA ; MBTPS1 ; PCSK1 ; PCSK2 ; PCSK4 ; PCSK5 ; PCSK6 ; PCSK7 ; PCSK9 ; TPP2 ;

Referencias

  1. ^ Bode W, Papamokos E, Musil D (agosto de 1987). "La estructura cristalina de rayos X de alta resolución del complejo formado entre la subtilisina Carlsberg y la eglina c, un inhibidor de la elastasa de la sanguijuela Hirudo medicinalis. Análisis estructural, estructura de la subtilisina y geometría de la interfaz". Eur. J. Biochem . 166 (3): 673–92. doi : 10.1111/j.1432-1033.1987.tb13566.x . PMID  3301348.
  2. ^ ab Siezen RJ, Leunissen JA (1997). "Subtilasas: la superfamilia de serina proteasas similares a la subtilisina". Protein Sci . 6 (3): 501–523. doi :10.1002/pro.5560060301. PMC 2143677 . PMID  9070434. 
  3. ^ abcdef Rawlings ND, Barrett AJ (1994). "Familias de serina peptidasas". Enzimas proteolíticas: serina y cisteína peptidasas . Métodos en enzimología. Vol. 244. págs. 19–61. doi :10.1016/0076-6879(94)44004-2. ISBN 9780121821456. PMC  7133253 . PMID  7845208.
  4. ^ abcd Rawlings ND, Barrett AJ (1993). "Familias evolutivas de peptidasas". Biochem. J . 290 (Pt 1): 205–218. doi :10.1042/bj2900205. PMC 1132403 . PMID  8439290. 
  5. ^ Wlodawer A, Oda K, Li M, Gustchina A, Dunn BM, Oyama H (2003). "Propiedades estructurales y enzimáticas de la familia sedolisina de las serina-carboxil peptidasas". Acta Biochim. Pol . 50 (1): 81–102. doi : 10.18388/abp.2003_3716 . PMID  12673349.

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