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Puromicina

La puromicina es un antibiótico inhibidor de la síntesis de proteínas que provoca la terminación prematura de la cadena durante la traducción .

Inhibición de la traducción

La puromicina es un antibiótico aminonucleósido , derivado de la bacteria Streptomyces alboniger , [1] que causa la terminación prematura de la cadena durante la traducción que tiene lugar en el ribosoma . Parte de la molécula se asemeja al extremo 3' del ARNt aminoacilado . Entra en el sitio A y se transfiere a la cadena en crecimiento, lo que provoca la formación de una cadena naciente puromicilada y la liberación prematura de la cadena. [2] El mecanismo de acción exacto se desconoce en este momento, pero la posición 3' contiene un enlace amida en lugar del enlace éster normal del ARNt . Eso hace que la molécula sea mucho más resistente a la hidrólisis y detiene el ribosoma .

La puromicina es selectiva tanto para procariotas como para eucariotas .

También cabe destacar que la puromicina es fundamental en la expresión del ARNm . En esta reacción, una molécula de puromicina se une químicamente al extremo de una plantilla de ARNm , que luego se traduce en proteína. La puromicina puede entonces formar un enlace covalente con la cadena peptídica en crecimiento, lo que permite que el ARNm se una físicamente a su producto de traducción.

Los anticuerpos que reconocen cadenas nacientes puromiciladas también se pueden utilizar para purificar polipéptidos recién sintetizados [3] y para visualizar la distribución de ribosomas que traducen activamente mediante inmunofluorescencia . [4]

Inhibidor de la peptidasa

La puromicina es un inhibidor reversible de la dipeptidil-peptidasa II ( serina peptidasa ) y de la alanil aminopeptidasa del citosol ( metalolopeptidasa ). [5] [6] El mecanismo de inhibición no se entiende bien, sin embargo, la puromicina se puede utilizar para distinguir entre la aminopeptidasa M (activa) y la alanil aminopeptidasa del citosol (inhibida por la puromicina).

Cultivo celular

La puromicina se utiliza en biología celular como agente selectivo en sistemas de cultivo celular. Es tóxica para las células procariotas y eucariotas. La resistencia a la puromicina es conferida por el gen pac que codifica una puromicina N -acetil-transferasa (PAC) que se encontró en una cepa productora de Streptomyces. La puromicina es soluble en agua (50 mg/ml) como solución incolora a 10 mg/ml. La puromicina es estable durante un año como solución cuando se almacena a -20 °C. La dosis recomendada como agente de selección en cultivos celulares está dentro de un rango de 1-10 μg/ml, aunque puede ser tóxica para las células eucariotas en concentraciones tan bajas como 1 μg/ml. La puromicina actúa rápidamente y puede matar más del 99% de las células no resistentes en un día. [ cita requerida ]

Selección deEscherichia coli

La puromicina es poco activa en E. coli . Los transformantes resistentes a la puromicina se seleccionan en un medio de agar LB suplementado con 125 μg/mL de puromicina. Pero el uso de puromicina para la selección de E. coli requiere un ajuste preciso del pH y también depende de la cepa seleccionada. Para una selección sin problemas y resultados óptimos, es posible utilizar puromicina especialmente modificada. Las placas que contienen puromicina son estables durante 1 mes cuando se almacenan a 4  [7] °C. [ cita requerida ]

Selección de levadura

La resistencia a la puromicina en levaduras también puede ser conferida a través de la expresión del gen de la N-acetiltransferasa de puromicina ( pac ). [8] Las concentraciones letales de puromicina son mucho más altas para las cepas de Saccharomyces cerevisiae que para las líneas celulares de mamíferos. La eliminación del gen que codifica la bomba de eflujo de múltiples fármacos Pdr5 sensibiliza a las células a la puromicina. [ cita requerida ]

Pérdida de memoria en ratones

La plasticidad sináptica a largo plazo , como la que se requiere para los procesos de memoria , requiere cambios morfológicos a nivel proteico. Como la puromicina inhibe la síntesis proteica en las células eucariotas, los investigadores pudieron demostrar que las inyecciones de este fármaco provocarán pérdida de memoria tanto a corto como a largo plazo en ratones. [9]

Referencias

  1. ^ Puromicina de PubChem
  2. ^ Pestka, S. (1971). "Inhibidores de las funciones de los ribosomas". Annu. Rev. Microbiol . 25 : 487–562. doi :10.1146/annurev.mi.25.100171.002415. PMID  4949424.
  3. ^ Eggers DK, Welch WJ, Hansen WJ (1997). "Complejos entre polipéptidos nacientes y sus chaperonas moleculares en el citosol de células de mamíferos". Mol Biol Cell . 8 (8): 1559–1573. doi :10.1091/mbc.8.8.1559. PMC 276176 . PMID  9285825. 
  4. ^ Starck SR, Green HM, Alberola-Ila J, Roberts RW (2004). "Un enfoque general para detectar la expresión de proteínas in vivo utilizando conjugados fluorescentes de puromicina". Chem. Biol . 11 (7): 999–1008. doi : 10.1016/j.chembiol.2004.05.011 . PMID  15271358.
  5. ^ Dando, Pam M.; Young, Nina E.; Barrett, Alan J. (1997). "Aminopeptidasa PS: una peptidasa citosólica ampliamente distribuida". En Hopsu-Havu, Väinö K.; Järvinen, Mikko; Kirschke, Heidrun (eds.). Proteólisis en funciones celulares . IOS Press. págs. 88–95. ISBN 978-90-5199-322-6.
  6. ^ McDonald JK, Reilly TJ, Zeitman BB, Ellis S (1968). "Dipeptidil arilamidasa II de la pituitaria. Propiedades de la hidrólisis de lisilalanil-beta-naftilamida: inhibición por cationes, distribución en tejidos y localización subcelular". The Journal of Biological Chemistry . 243 (8): 2028–37. doi : 10.1016/S0021-9258(18)93545-3 . PMID  5646493.
  7. ^ "Puromycin.com - Concentraciones de trabajo (Protocolos)". Archivado desde el original el 10 de octubre de 2014. Consultado el 11 de mayo de 2014 .
  8. ^ MacDonald C, Piper RC (2015). "Casetes de resistencia a puromicina y metotrexato y plásmidos de expresión de recombinasa Cre optimizados para su uso en levadura". Levadura . 32 (5): 423–38. doi :10.1002/yea.3069. PMC 4454448 . PMID  25688547. 
  9. ^ Flexner, JB; Flexner, LB; Stellar, E. (5 de julio de 1963). "Memoria en ratones afectada por puromicina intracerebral". Science . 141 (3575): 57–59. Bibcode :1963Sci...141...57F. doi :10.1126/science.141.3575.57. ISSN  0036-8075. PMID  13945541. S2CID  29071662.