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Peroxidasa de manganeso

En enzimología , una peroxidasa de manganeso ( EC 1.11.1.13) es una enzima que cataliza la reacción química

2 Mn(II) + 2 H + + H 2 O 2 2 Mn(III) + 2 H 2 O

Los 3 sustratos de esta enzima son Mn(II), H + y H 2 O 2 , mientras que sus dos productos son Mn(III) y H 2 O .

Esta enzima pertenece a la familia de las oxidorreductasas , en concreto a aquellas que actúan sobre un peróxido como aceptor (peroxidasas). El nombre sistemático de esta clase de enzimas es Mn(II):oxidorreductasa de peróxido de hidrógeno . Otros nombres de uso común son peroxidasa-M2 y peroxidasa dependiente de Mn (oxidante de NADH) . Emplea un cofactor , el hemo . Esta enzima necesita Ca 2+ para su actividad.

Los hongos de podredumbre blanca secretan esta enzima para ayudar a la degradación de la lignina .

Descubrimiento y caracterización

La peroxidasa de manganeso (comúnmente conocida como MnP) fue descubierta en 1985 simultáneamente por los grupos de investigación de Michael H. Gold [1] y Ronald Crawford [2] en el hongo Phanerochaete chrysosporium . La proteína fue secuenciada genéticamente en P. chrysoporium en 1989. [3] Se cree que la enzima es exclusiva de Basidiomycota , ya que aún no se ha encontrado ninguna especie de bacteria , levadura o moho que la produzca de forma natural.

Mecanismo de reacción

Esquema del mecanismo de la peroxidasa de manganeso que muestra el estado inicial, el complejo de peróxido de hierro y los compuestos I y II. Aquí, el cofactor del hemo está representado por un complejo de hierro y nitrógeno. El radical oxoporfirina Fe(IV) resuena en todo el hemo.

La catálisis de MnP ocurre en una serie de reacciones irreversibles de oxidación-reducción ( redox ) que siguen un mecanismo de ping-pong con cinética de segundo orden . [4] En el primer paso del ciclo catalítico, H 2 O 2 , o un peróxido orgánico , ingresa al sitio activo de MnP. Allí, el oxígeno en H 2 O 2 se une a un ion Fe (III) en el cofactor hemo para formar un complejo de peróxido de hierro. Se transfieren dos electrones de Fe 3+ al peróxido, rompiendo el enlace oxígeno-peróxido para formar H 2 O y un complejo radical oxo-porfirina Fe (IV) . Este intermedio oxidado se conoce como MnP Compuesto I. MnP Compuesto I luego se une a un ion Mn (II) monoquelado , que dona un electrón para extinguir el radical y formar Mn (III) y MnP Compuesto II, un complejo oxo-porfirina Fe (IV). El compuesto MnP II oxida otro ion Mn(II) a Mn(III) y se reduce mediante la reacción de dos iones H+ y el oxígeno unido al hierro. Esto reforma el ion Fe(III) en el hemo y libera una segunda molécula de agua. [5] Existen muchas desviaciones de este ciclo catalítico tradicional. El compuesto MnP I se puede utilizar para oxidar Mn(II) libre, ferrocianuro , así como fenólicos y otros compuestos aromáticos . [6]

Quelantes

El Mn(III) es inestable en medios acuosos , por lo tanto, el MnP lo libera como un quelato de ácido carboxílico Mn(III) . Hay una variedad de quelantes de ácido carboxílico, incluidos oxalato , malonato , tartrato y lactato , sin embargo, el oxalato es el más común. La estructura de la peroxidasa favorece a los quelatos de Mn(III) sobre los iones Mn(III) libres. El quelato de Mn(III) interactúa con el sitio activo para facilitar la liberación del producto de la enzima. [7] El quelante puede tener un efecto sobre la velocidad cinética e incluso sobre la reacción catalizada. Si el sustrato Mn(II) está quelado con lactato, el MnP en cambio cataliza la evolución de O 2 . Sin embargo, esta reacción secundaria tiene poco impacto en la actividad enzimática porque sigue una cinética de tercer orden más lenta. [4]

Estudios estructurales

Estructura de la peroxidasa de manganeso. Los iones de manganeso y calcio unidos se destacan en violeta y rosa, respectivamente.

A finales de 2007, se han resuelto 6 estructuras para esta clase de enzimas, con códigos de acceso PDB 1MN1, 1MN2, 1YYD, 1YYG, 1YZP y 1YZR.

Aunque la MnP, al igual que otras peroxidasas de lignina , es una peroxidasa de clase II , tiene una estructura terciaria similar a las peroxidasas de clase I procariotas , pero contiene puentes disulfuro como las peroxidasas de clase III en las plantas. [8] La MnP tiene una estructura globular que contiene 11-12 hélices α, dependiendo de la especie en la que se produce. Está estabilizada por 10 residuos de aminoácidos de cistina que forman 5 puentes disulfuro, uno de los cuales está cerca del área C-terminal . El sitio activo contiene un cofactor hemo que está unido por dos iones Ca 2+ , uno por encima y otro por debajo del hemo. Cerca del propionato de hemo interno hay tres residuos ácidos que se utilizan para estabilizar Mn (II) o Mn (III) cuando está unido a la enzima. Los residuos específicos varían entre especies, pero su número y ubicación relativa en la proteína plegada se conserva. Hay un total de 357 residuos de aminoácidos en el MnP de P. chrysosoporium , y un número similar en las enzimas producidas por otros basidiomicetos. [9]

Importancia bioquímica

La función principal de los iones Mn(III) producidos por MnP es la oxidación y degradación de la lignina. [10] Para este propósito, los basidiomicetos secretan MnP, en lugar de Mn(III), y la enzima funciona fuera de la célula fúngica. Los iones Mn(III) de MnP pueden oxidar los compuestos fenólicos en la lignina directamente, pero también pueden oxidar algunos compuestos orgánicos de azufre y ácidos grasos insaturados . Esta oxidación forma radicales tiilo y peroxilo, que en presencia de O 2 , pueden oxidar la lignina o reaccionar con agua para formar H 2 O 2 . [11] [12] El propio ion Mn 3+ puede degradar la lignina al catalizar las escisiones alquil - arilo y la oxidación del carbono α en fenoles. [13]

Regulación

La actividad de MnP se controla mediante la regulación transcripcional . La MnP se regula positivamente mediante el aumento de las concentraciones extracelulares de Mn(II) [14] y H 2 O 2 . Se ha descubierto que el aumento de la concentración de O 2 y el estrés térmico también activan la MnP. [15]

Referencias

  1. ^ Glenn JK, Gold MH (noviembre de 1985). "Purificación y caracterización de una peroxidasa extracelular dependiente de Mn(II) del basidiomiceto degradador de lignina, Phanerochaete chrysosporium". Arch. Biochem. Biophys . 242 (2): 329–41. doi :10.1016/0003-9861(85)90217-6. PMID  4062285.
  2. ^ Paszcynski A, Huynh VB, Crawford R (agosto de 1985). "Actividades enzimáticas de una peroxidasa extracelular dependiente del manganeso de Phanerochaete chrysosporium". FEMS Microbiol. Lett . 29 (1–2): 37–41. doi : 10.1111/j.1574-6968.1985.tb00831.x .
  3. ^ Pribnow D, Mayfield MB, Nipper VJ, Brown JA, Gold MH (marzo de 1989). "Caracterización de un ADNc que codifica una peroxidasa de manganeso, del basidiomiceto degradador de lignina Phanerochaete chrysosporium". J. Biol. Chem . 264 (9): 5036–40. doi : 10.1016/S0021-9258(18)83695-X . PMID  2925681.
  4. ^ ab Wariishi H, Valli K, Gold MH (noviembre de 1992). "Oxidación de manganeso(II) por peroxidasa de manganeso del basidiomiceto Phanerochaete chrysosporium. Mecanismo cinético y función de los quelantes". J. Biol. Chem . 267 (33): 23688–95. doi : 10.1016/S0021-9258(18)35893-9 . PMID  1429709.
  5. ^ Hofrichter M (abril de 2002). " Revisión: conversión de lignina por peroxidasa de manganeso (MnP). ". Tecnología enzimática y microbiana . 30 (4): 454–66. doi :10.1016/S0141-0229(01)00528-2.
  6. ^ Heinfling A, Ruiz-Dueñas FJ, Martínez MJ, Bergbauer M, Szewzyk U, Martínez AT (mayo de 1998). "Un estudio sobre sustratos reductores de peroxidasas oxidantes de manganeso de Pleurotus eryngii y Bjerkandera adusta". FEBS Lett . 428 (3): 141–6. Bibcode :1998FEBSL.428..141H. doi : 10.1016/s0014-5793(98)00512-2 . PMID  9654123. S2CID  39842460.
  7. ^ Banci L, Bertini I, Dal Pozzo L, Del Conte R, Tien M (junio de 1998). "Seguimiento del papel del oxalato en la manganeso peroxidasa". Bioquímica . 37 (25): 9009–15. doi :10.1021/bi972879+. PMID  9636044.
  8. ^ Welinder KG (junio de 1992). " Superfamilia de peroxidasas vegetales, fúngicas y bacterianas ". Current Opinion in Structural Biology . 2 (3): 388–93. doi :10.1016/0959-440X(92)90230-5.
  9. ^ Martinez A (abril de 2002). " Biología molecular y estructura-función de las hemo peroxidasas degradadoras de lignina ". Enzyme and Microbial Technology . 30 (4): 425–444. doi :10.1016/S0141-0229(01)00521-X.
  10. ^ Forrester IT, Grabski AC, Burgess RR, Leatham GF (diciembre de 1988). "Manganeso, peroxidasas dependientes de Mn y biodegradación de la lignina". Biochem. Biophys. Res. Commun . 157 (3): 992–9. doi :10.1016/S0006-291X(88)80972-0. PMID  3207431.
  11. ^ Wariishi H, Valli K, Renganathan V, Gold MH (agosto de 1989). "Oxidación mediada por tiol de compuestos modelo de lignina no fenólica por peroxidasa de manganeso de Phanerochaete chrysosporium". J. Biol. Chem . 264 (24): 14185–91. doi : 10.1016/S0021-9258(18)71660-8 . PMID  2760063.
  12. ^ Kapich AN, Jensen KA, Hammel KE (noviembre de 1999). "Los radicales peroxilo son agentes potenciales de biodegradación de la lignina". FEBS Lett . 461 (1–2): 115–9. Bibcode :1999FEBSL.461..115K. doi : 10.1016/s0014-5793(99)01432-5 . PMID  10561507. S2CID  25335594.
  13. ^ Tuor U, Wariishi H, Schoemaker HE, Gold MH (junio de 1992). "Oxidación de compuestos modelo de lignina de éter beta-arílico de arilglicerol fenólico por peroxidasa de manganeso de Phanerochaete chrysosporium : escisión oxidativa de un compuesto modelo de alfa-carbonilo". Bioquímica . 31 (21): 4986–95. doi :10.1021/bi00136a011. PMID  1599925.
  14. ^ Brown JA, Alic M, Gold MH (julio de 1991). "Transcripción del gen de la peroxidasa de manganeso en Phanerochaete chrysosporium: activación por manganeso". J. Bacteriol . 173 (13): 4101–6. doi :10.1128/jb.173.13.4101-4106.1991. PMC 208059 . PMID  2061289. 
  15. ^ Li D, Alic M, Brown JA, Gold MH (enero de 1995). "Regulación de la transcripción del gen de la peroxidasa de manganeso por peróxido de hidrógeno, estrés químico y oxígeno molecular". Appl. Environ. Microbiol . 61 (1): 341–5. Bibcode :1995ApEnM..61..341L. doi :10.1128/AEM.61.1.341-345.1995. PMC 167287 . PMID  7887613. 

Lectura adicional