La Serie de Japón de 2006 , la 57.ª edición de la serie de campeonato de la Liga Profesional de Béisbol de Japón , comenzó el 21 de octubre y finalizó el 26 de octubre, y enfrentó al campeón de la Liga Central , Chunichi Dragons, contra el campeón de la Liga del Pacífico , Hokkaido Nippon Ham Fighters . Los Fighters ganaron la Serie en cinco juegos, llevándose los Juegos 2, 3, 4 y 5.
En el primer juego, ambos ases lanzaron para sus respectivos equipos: Darvish para los Fighters y Kawakami para los Dragons. Ambos lanzadores comenzaron bien, pero Darvish, que había tenido episodios de locura en la temporada regular, vio cómo su control se desmoronaba en la segunda entrada, y perdió la ventaja de 2-0 de los Fighters que había conseguido en la parte superior de la entrada. Chunichi anotó uno más en la tercera y uno en la octava para poner a los Dragons locales en la cima, 4-2. El veterano cerrador de los Dragons, Iwase, cerró a los Fighters en la novena para poner a los Dragons en la cima 1 juego a 0.
El súper novato Tomoya Yagi subió al montículo para Nippon Ham en el Juego 2, todavía en alto después de superar en duelo al as de los SoftBank Hawks Kazumi Saitoh . Superó en duelo a otro veterano, esta vez al lanzador de bolas sueltas Masahiro Yamamoto. En la batalla de los zurdos, los únicos dos errores que cometió Yagi fueron ante Hirokazu Ibata y Kosuke Fukudome, ambos tiros solitarios.
El quinto partido también sería el último de Tsuyoshi Shinjo , ya que anunció su retiro a principios de la temporada 2006. Con la victoria, Shinjo terminó su carrera de manera inolvidable, ganando finalmente su primer título de la Serie de Japón en su última temporada. El mánager Trey Hillman se convirtió entonces en el segundo mánager extranjero en ganar un título de la Serie de Japón, después de Bobby Valentine , que lo hizo el año anterior .