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Proteasa glutámica

Las proteasas glutámicas son un grupo de enzimas proteolíticas que contienen un residuo de ácido glutámico en el sitio activo. Este tipo de proteasa se describió por primera vez en 2004 y se convirtió en el sexto tipo catalítico de proteasa. [1] Anteriormente se había asumido que los miembros de este grupo de proteasas eran una proteasa aspartato , pero la determinación estructural mostró que pertenecía a una nueva familia de proteasas. La primera estructura de este grupo de proteasas fue la peptidasa escitalidoglutámica , cuyo sitio activo contiene una díada catalítica, ácido glutámico (E) y glutamina (Q), que dan lugar al nombre eqolisina . Este grupo de proteasas se encuentra principalmente en hongos patógenos que afectan a las plantas y a los humanos. [2]

Distribución y tipos

Dímero de peptidasa aspergiloglutámica

Existen dos familias independientes de proteasas glutámicas (G1 y G2), y tienen una distribución limitada. Originalmente se pensaba que se limitaban a los hongos filamentosos, principalmente del filo Ascomycota . [3] Sin embargo, posteriormente se han identificado proteasas glutámicas en bacterias y arqueas . [4] También se ha identificado una proteasa glutámica de un virus vegetal ( virus del moteado de la fresa ). [5]

La primera superfamilia de proteasas glutámicas se identificó en los hongos Scytalidium lignicola y Aspergillus niger var. macrosporus , de los cuales se derivan la peptidasa escitalidoglutámica (eqolisina) y la peptidasa aspergilologlutámica respectivamente. Estas dos proteasas contienen residuos Glu y Gln en el sitio activo y se agrupan en la familia G1 de MEROPS. [6] [7]

Una peptidasa glutámica evolucionada de manera convergente, la proteína del apéndice precuello (bacteriófago phi-29), utiliza una díada Glu y Asp en el sitio activo y está clasificada como familia G2 de MEROPS. [8]

Propiedades

Estas enzimas son proteasas ácidas; la eqolisina, por ejemplo, es más activa a pH 2,0 cuando se utiliza caseína como sustrato. [2] Las eqolosinas prefieren residuos de aminoácidos voluminosos en el sitio P1 y residuos de aminoácidos pequeños en el sitio P1′. Una característica de la proteasa es su insensibilidad a la pepstatina y S-PI (acetil pepstatina) y anteriormente se la clasificó como "proteasas carboxil insensibles a la pepstatina". [9] Las otras "proteasas carboxil insensibles a la pepstatina" pertenecen a la subfamilia de las serina proteasas , la serina-carboxil proteasa (sedolisina), que se descubrió en 2001. [2] Estas proteasas tampoco son inhibidas por DAN (metiléster de diazoacetil-DL-norleucina) (7), pero pueden ser inhibidas por EPNP (1,2-epoxi-3-( p -nitrofenoxi) propano). [10] [11]

Sitio activo y mecanismo de catálisis

El sitio activo de la eqolosina contiene una diada catalítica distintiva de ácido glutámico y glutamina que están involucradas en la unión del sustrato y la catálisis. Estos residuos actúan como un nucleófilo, y el ácido glutámico sirve como un ácido general en la primera fase de la reacción, donando un protón al oxígeno carbonílico en el enlace peptídico del sustrato. Una o dos moléculas de agua pueden estar involucradas en la reacción suministrando un grupo hidroxilo, y el ácido glutámico dona además un protón al nitrógeno amida, lo que da como resultado la ruptura del enlace peptídico. Luego, la glutamina devuelve el ácido glutámico a su estado inicial. [12]

Véase también

Referencias

  1. ^ Fujinaga M, Cherney MM, Oyama H, Oda K, James MN (marzo de 2004). "La estructura molecular y el mecanismo catalítico de una nueva carboxil peptidasa de Scytalidium lignicolum". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (10): 3364–9. Bibcode :2004PNAS..101.3364F. doi : 10.1073/pnas.0400246101 . PMC  373467 . PMID  14993599.
  2. ^ abc Oda K (enero de 2012). "Nuevas familias de carboxil peptidasas: serina-carboxil peptidasas y glutámicas". Journal of Biochemistry . 151 (1): 13–25. doi : 10.1093/jb/mvr129 . PMID  22016395.
  3. ^ Sims AH, Dunn-Coleman NS, Robson GD, Oliver SG (octubre de 2004). "La distribución de la proteasa glutámica se limita a los hongos filamentosos". FEMS Microbiology Letters . 239 (1): 95–101. doi : 10.1016/j.femsle.2004.08.023 . PMID  15451106.
  4. ^ Jensen K, Østergaard PR, Wilting R, Lassen SF (2010). "Identificación y caracterización de una peptidasa glutámica bacteriana". BMC Biochemistry . 11 (47): 47. doi : 10.1186/1471-2091-11-47 . PMC 3009609 . PMID  21122090. 
  5. ^ Mann KS, Chisholm J y Sanfaçon H (2019). "El virus del moteado de la fresa (familia Secoviridae, orden Picornavirales) codifica una nueva proteasa glutámica para procesar la poliproteína ARN2 en dos sitios de escisión". J Virol . 93 (5): e01679-18. doi :10.1128/JVI.01679-18. PMC 6384087 . PMID  30541838. 
  6. ^ Sasaki H, Kubota K, Lee WC, Ohtsuka J, Kojima M, Iwata S, Nakagawa A, Takahashi K, Tanokura M (julio de 2012). "La estructura cristalina de un dímero intermedio de la peptidasa aspergiloglutámica que imita el complejo de producto de activación de la enzima producido tras la autoproteólisis". Journal of Biochemistry . 152 (1): 45–52. doi :10.1093/jb/mvs050. PMID  22569035.
  7. ^ Takahashi K (2013). "Estudios de estructura y función de enzimas con uno o más grupos carboxilo catalíticos: de la ribonucleasa T1 a las carboxilpeptidasas". Actas de la Academia Japonesa , Serie B. 89 (6): 201–25. Bibcode :2013PJAB...89..201T. doi :10.2183/pjab.89.201. PMC 3749792 . PMID  23759941. 
  8. ^ "Familia G2". MEROPS .[ enlace muerto permanente ]
  9. ^ "Familia G1". MEROPS .[ enlace muerto permanente ]
  10. ^ Murao S, Oda K, Matsushita Y (1973). "Aislamiento e identificación de un microorganismo que produce proteasas ácidas sensibles al inhibidor de la pepsina y al éster metílico de N-diazoacetil-DL-norleucina no Streptomyces". Agric. Biol. Chem . 37 (6): 1417–1421. doi : 10.1271/bbb1961.37.1417 .
  11. ^ Morihara K, Tsuzuki H, Murao S, Oda K (marzo de 1979). "Proteasas ácidas insensibles a la pepstatina de Scytalidium lignicolum. Estudio cinético con péptidos sintéticos". Journal of Biochemistry . 85 (3): 661–8. PMID  34596.
  12. ^ Moselio Schaechter, ed. (2009). Enciclopedia de microbiología (3.ª ed.). Academic Press. pág. 499. ISBN 978-0123739391.