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Glicerol-3-fosfato deshidrogenasa

La glicerol-3-fosfato deshidrogenasa ( GPDH ) es una enzima que cataliza la conversión redox reversible de dihidroxiacetona fosfato (también conocido como glicerol fosfato, obsoleto) en sn- glicerol 3-fosfato . [2]

La glicerol-3-fosfato deshidrogenasa sirve como vínculo importante entre el metabolismo de los carbohidratos y el metabolismo de los lípidos . También es un importante contribuyente de electrones a la cadena de transporte de electrones en las mitocondrias .

Los términos más antiguos para la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa incluyen alfa glicerol-3-fosfato deshidrogenasa (alfaGPDH) y glicerolfosfato deshidrogenasa (GPDH). Sin embargo, no es lo mismo la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa que la gliceraldehído 3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH), cuyo sustrato es un aldehído y no un alcohol .

función metabólica

GPDH juega un papel importante en la biosíntesis de lípidos . A través de la reducción del fosfato de dihidroxiacetona en glicerol 3-fosfato , la GPDH permite la rápida desfosforilación del glicerol 3-fosfato en glicerol . [3] Además, GPDH es una de las enzimas involucradas en el mantenimiento del potencial redox a través de la membrana mitocondrial interna . [3]

Fig. 1. Descripción esquemática del metabolismo fermentativo y oxidativo de la glucosa de Saccharomyces cerevisiae . (A) parte superior de la glucólisis , que incluye dos reacciones de fosforilación de azúcares . (B) fructosa-1,6-bifosfato aldolasa, que divide la molécula C6 en dos triosas fosfato (C) triosafosfato isomerasa, que interconvierte DHAP y GAP. (D) vía del glicerol que reduce la DHAP a glicerol-3-fosfato (G3P) por la G3P deshidrogenasa, seguida de la desfosforilación a glicerol por la G3Pasa. (E) La parte inferior de la glucólisis convierte GAP en piruvato mientras genera 1 NADH y 2 ATP a través de una serie de 5 enzimas. (F) Fermentación alcohólica; descarboxilación del piruvato por la piruvato descarboxilasa, seguida de la reducción de acetaldehído a etanol. (G) la piruvato-deshidrogenasa mitocondrial convierte el piruvato en acetil-CoA, que ingresa al ciclo del ácido tricarboxílico. (H) NADH deshidrogenasas mitocondriales externas. (I) G3P deshidrogenasa mitocondrial. Los electrones de estas tres deshidrogenasas ingresan a la cadena respiratoria al nivel del grupo de quinol (Q). (J) NADH deshidrogenasa mitocondrial interna. (K) ATP sintasa. (L) esquema generalizado de la lanzadera NADH. (M) oxidación de formiato por la formiato deshidrogenasa. [4]

Reacción

El par de coenzimas NAD+ / NADH actúa como reservorio de electrones para reacciones metabólicas redox , transportando electrones de una reacción a otra. [5] La mayoría de estas reacciones metabólicas ocurren en las mitocondrias . Para regenerar NAD+ para su uso posterior, los depósitos de NADH en el citosol deben reoxidarse. Dado que la membrana interna mitocondrial es impermeable tanto al NADH como al NAD+ , estos no pueden intercambiarse libremente entre el citosol y la matriz mitocondrial . [4]

Una forma de transportar este equivalente reductor a través de la membrana es a través de la lanzadera de glicerol-3-fosfato , que emplea dos formas de GPDH:

Las reacciones catalizadas por la GPDH citosólica (soluble) y mitocondrial son las siguientes:


Variantes

Hay dos formas de GPDH:

Los siguientes genes humanos codifican proteínas con actividad enzimática GPDH:

GPD1

La glicerol-3-fosfato deshidrogenasa citosólica (GPD1) es una enzima dependiente de NAD+ [8] que reduce el fosfato de dihidroxiacetona a glicerol-3-fosfato . Simultáneamente, el NADH se oxida a NAD+ en la siguiente reacción:

Mecanismo de reacción GPD1

Como resultado, el NAD+ se regenera para una mayor actividad metabólica.

GPD1 consta de dos subunidades [9] y reacciona con fosfato de dihidroxiacetona y NAD+ a través de la siguiente interacción:

Figura 4. El sitio activo putativo. El grupo fosfato de DHAP está medio rodeado por la cadena lateral de Arg269 e interactúa con Arg269 y Gly268 directamente mediante enlaces de hidrógeno (no se muestran). Los residuos conservados Lys204, Asn205, Asp260 y Thr264 forman una red de enlaces de hidrógeno estable. La otra red de enlaces de hidrógeno incluye los residuos Lys120 y Asp260, así como una molécula de agua ordenada (con un factor B de 16,4 Å2), que se une a Gly149 y Asn151 (no se muestra). En estas dos redes electrostáticas, sólo el grupo ε-NH 3 + de Lys204 es el más cercano al átomo de C2 de DHAP (3,4 Å). [1]

GPD2

La glicerol-3-fosfato deshidrogenasa mitocondrial (GPD2), cataliza la oxidación irreversible del glicerol-3-fosfato a dihidroxiacetona fosfato y concomitantemente transfiere dos electrones del FAD a la cadena de transporte de electrones . GPD2 consta de 4 subunidades idénticas. [10]

Mecanismo de reacción GPD2

Respuesta a las tensiones ambientales.

Lanzadera de glicerol-3-fosfato

El citosólico junto con la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa mitocondrial trabajan en conjunto. La oxidación del NADH citoplasmático por la forma citosólica de la enzima crea glicerol-3-fosfato a partir de dihidroxiacetona fosfato. Una vez que el glicerol-3-fosfato ha atravesado la membrana mitocondrial externa, puede ser oxidado por una isoforma separada de glicerol-3-fosfato deshidrogenasa que utiliza quinona como oxidante y FAD como cofactor. Como resultado, hay una pérdida neta de energía, comparable a una molécula de ATP. [7]

La acción combinada de estas enzimas mantiene la relación NAD+ / NADH que permite el funcionamiento continuo del metabolismo.

Papel en la enfermedad

El papel fundamental de la GPDH en el mantenimiento del potencial NAD+ / NADH , así como su papel en el metabolismo de los lípidos , convierte a la GPDH en un factor en enfermedades de desequilibrio lipídico, como la obesidad .

Objetivo farmacológico

Se cree que la isoforma mitocondrial de la G3P deshidrogenasa es inhibida por la metformina , un fármaco de primera línea para la diabetes tipo 2 . [14]

Investigación biológica

Sarcophaga barbata se utilizó para estudiar la oxidación del L-3-glicerofosfato en las mitocondrias. Se ha comprobado que el L-3-glicerofosfato no penetra en la matriz mitocondrial, a diferencia del piruvato. Esto ayuda a localizar la L-3-glicerofosfato-flavoproteína oxidorreductasa, que se encuentra en la membrana interna de las mitocondrias.

Estructura

La glicerol-3-fosfato deshidrogenasa consta de dos dominios proteicos . El dominio N-terminal es un dominio de unión a NAD y el extremo C actúa como un dominio de unión a sustrato. [15] Sin embargo, los residuos de la interfaz de dímero y tetrámero están involucrados en la unión de GAPDH-ARN, ya que GAPDH puede exhibir varias actividades de pluriempleo, incluida la modulación de la unión y/o la estabilidad del ARN. [dieciséis]

Ver también

Referencias

  1. ^ ab PDB : 1X0V ​; Ou X, Ji C, Han X, Zhao X, Li X, Mao Y, Wong LL, Bartlam M, Rao Z (marzo de 2006). "Estructuras cristalinas de la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa 1 (GPD1) humana". Revista de biología molecular . 357 (3): 858–69. doi :10.1016/j.jmb.2005.12.074. PMID  16460752.
  2. ^ Ou X, Ji C, Han X, Zhao X, Li X, Mao Y, Wong LL, Bartlam M, Rao Z (marzo de 2006). "Estructuras cristalinas de la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa 1 (GPD1) humana". Revista de biología molecular . 357 (3): 858–69. doi :10.1016/j.jmb.2005.12.074. PMID  16460752.
  3. ^ ab Harding JW, Pyeritz EA, Copeland ES, White HB (enero de 1975). "Papel de la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa en el metabolismo de los glicéridos. Efecto de la dieta sobre las actividades enzimáticas en el hígado de pollo". La revista bioquímica . 146 (1): 223–9. doi :10.1042/bj1460223. PMC 1165291 . PMID  167714. 
  4. ^ ab Geertman JM, van Maris AJ, van Dijken JP, Pronk JT (noviembre de 2006). "Ingeniería fisiológica y genética del metabolismo redox citosólico en Saccharomyces cerevisiae para mejorar la producción de glicerol". Ingeniería Metabólica . 8 (6): 532–42. doi :10.1016/j.ymben.2006.06.004. PMID  16891140.
  5. ^ Ansell R, Granath K, Hohmann S, Thevelein JM, Adler L (mayo de 1997). "Las dos isoenzimas para la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa dependiente de NAD+ de levadura codificada por GPD1 y GPD2 tienen funciones distintas en la osmoadaptación y la regulación redox". La Revista EMBO . 16 (9): 2179–87. doi :10.1093/emboj/16.9.2179. PMC 1169820 . PMID  9171333. 
  6. ^ Kota V, Rai P, Weitzel JM, Middendorff R, Bhande SS, Shivaji S (septiembre de 2010). "Papel de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 2 en la capacitación de espermatozoides de ratón". Reproducción y Desarrollo Molecular . 77 (9): 773–83. doi :10.1002/mrd.21218. PMID  20602492. S2CID  19691537.
  7. ^ ab Stryer, Lubert; Berg, Jeremy Mark; Tymoczko, John L. (2002). "Capítulo 18.5: Lanzadera de glicerol 3-fosfato". Bioquímica . San Francisco: WH Freeman. ISBN 0-7167-4684-0.
  8. ^ Guindalini C, Lee KS, Andersen ML, Santos-Silva R, Bittencourt LR, Tufik S (enero de 2010). "La influencia de la apnea obstructiva del sueño en la expresión del gen de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 1". Biología y Medicina Experimentales . 235 (1): 52–6. doi :10.1258/ebm.2009.009150. PMID  20404019. S2CID  207194967. Archivado desde el original el 24 de julio de 2011 . Consultado el 16 de mayo de 2011 .
  9. ^ Bunoust O, Devin A, Avéret N, Camougrand N, Rigoulet M (febrero de 2005). "Competencia de electrones para entrar en la cadena respiratoria: un nuevo mecanismo regulador del metabolismo oxidativo en Saccharomyces cerevisiae". La Revista de Química Biológica . 280 (5): 3407–13. doi : 10.1074/jbc.M407746200 . PMID  15557339.
  10. ^ Kota V, Dhople VM, Shivaji S (abril de 2009). "Tirosina fosfoproteoma de espermatozoides de hámster: papel de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 2 en la capacitación de los espermatozoides". Proteómica . 9 (7): 1809–26. doi :10.1002/pmic.200800519. PMID  19333995. S2CID  9248320.
  11. ^ Kumar S, Kalyanasundaram GT, Gummadi SN (febrero de 2011). "Respuesta diferencial de la catalasa, superóxido dismutasa y glicerol-3-fosfato deshidrogenasa a diferentes estreses ambientales en Debaryomyces nepalensis NCYC 3413". Microbiología actual . 62 (2): 382–7. doi :10.1007/s00284-010-9717-z. PMID  20644932. S2CID  41613712.
  12. ^ Xu SP, Mao XY, Ren FZ, Che HL (febrero de 2011). "Efecto atenuante del glicomacropéptido de caseína sobre la proliferación, diferenciación y acumulación de lípidos de preadipocitos de rata Sprague-Dawley in vitro". Revista de ciencia láctea . 94 (2): 676–83. doi : 10.3168/jds.2010-3827 . PMID  21257036.
  13. ^ Van Norstrand DW, Valdivia CR, Tester DJ, Ueda K, London B, Makielski JC, Ackerman MJ (noviembre de 2007). "Caracterización molecular y funcional de nuevas mutaciones del gen similar a la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 1 (GPD1-L) en el síndrome de muerte súbita del lactante". Circulación . 116 (20): 2253–9. doi :10.1161/CIRCULATIONAHA.107.704627. PMC 3332545 . PMID  17967976. 
  14. ^ Ferrannini E (octubre de 2014). "El objetivo de la metformina en la diabetes tipo 2". El diario Nueva Inglaterra de medicina . 371 (16): 1547–8. doi :10.1056/NEJMcibr1409796. PMID  25317875.
  15. ^ Suresh S, Turley S, Opperdoes FR, Michels PA, Hol WG (mayo de 2000). "Una enzima diana potencial para fármacos tripanocidas revelada por la estructura cristalina de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa dependiente de NAD de Leishmania mexicana". Estructura . 8 (5): 541–52. doi : 10.1016/s0969-2126(00)00135-0 . PMID  10801498.
  16. ^ White MR, Khan MM, Deredge D, Ross CR, Quintyn R, Zucconi BE, Wysocki VH, Wintrode PL, Wilson GM, Garcin ED (enero de 2015). "Una mutación de la interfaz del dímero en la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa regula su unión al ARN rico en AU". La Revista de Química Biológica . 290 (3): 1770–85. doi : 10.1074/jbc.M114.618165 . PMC 4340419 . PMID  25451934. 

Otras lecturas

enlaces externos

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