La glicerol-3-fosfato deshidrogenasa ( GPDH ) es una enzima que cataliza la conversión redox reversible de dihidroxiacetona fosfato (también conocido como glicerol fosfato, obsoleto) en sn- glicerol 3-fosfato . [2]
Los términos más antiguos para la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa incluyen alfa glicerol-3-fosfato deshidrogenasa (alfaGPDH) y glicerolfosfato deshidrogenasa (GPDH). Sin embargo, no es lo mismo la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa que la gliceraldehído 3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH), cuyo sustrato es un aldehído y no un alcohol .
El par de coenzimas NAD+ / NADH actúa como reservorio de electrones para reacciones metabólicas redox , transportando electrones de una reacción a otra. [5] La mayoría de estas reacciones metabólicas ocurren en las mitocondrias . Para regenerar NAD+ para su uso posterior, los depósitos de NADH en el citosol deben reoxidarse. Dado que la membrana interna mitocondrial es impermeable tanto al NADH como al NAD+ , estos no pueden intercambiarse libremente entre el citosol y la matriz mitocondrial . [4]
Una forma de transportar este equivalente reductor a través de la membrana es a través de la lanzadera de glicerol-3-fosfato , que emplea dos formas de GPDH:
Como resultado, el NAD+ se regenera para una mayor actividad metabólica.
GPD1 consta de dos subunidades [9] y reacciona con fosfato de dihidroxiacetona y NAD+ a través de la siguiente interacción:
Figura 4. El sitio activo putativo. El grupo fosfato de DHAP está medio rodeado por la cadena lateral de Arg269 e interactúa con Arg269 y Gly268 directamente mediante enlaces de hidrógeno (no se muestran). Los residuos conservados Lys204, Asn205, Asp260 y Thr264 forman una red de enlaces de hidrógeno estable. La otra red de enlaces de hidrógeno incluye los residuos Lys120 y Asp260, así como una molécula de agua ordenada (con un factor B de 16,4 Å2), que se une a Gly149 y Asn151 (no se muestra). En estas dos redes electrostáticas, sólo el grupo ε-NH 3 + de Lys204 es el más cercano al átomo de C2 de DHAP (3,4 Å). [1]
Los estudios indican que la GPDH en su mayor parte no se ve afectada por los cambios de pH : ni la GPD1 ni la GPD2 se ven favorecidas en determinadas condiciones de pH .
A altas concentraciones de sal (por ejemplo, NaCl ), la actividad de GPD1 aumenta con respecto a GPD2, ya que un aumento en la salinidad del medio conduce a una acumulación de glicerol en respuesta.
Los cambios de temperatura no parecen favorecer ni a GPD1 ni a GPD2. [11]
Lanzadera de glicerol-3-fosfato
El citosólico junto con la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa mitocondrial trabajan en conjunto. La oxidación del NADH citoplasmático por la forma citosólica de la enzima crea glicerol-3-fosfato a partir de dihidroxiacetona fosfato. Una vez que el glicerol-3-fosfato ha atravesado la membrana mitocondrial externa, puede ser oxidado por una isoforma separada de glicerol-3-fosfato deshidrogenasa que utiliza quinona como oxidante y FAD como cofactor. Como resultado, hay una pérdida neta de energía, comparable a una molécula de ATP. [7]
La acción combinada de estas enzimas mantiene la relación NAD+ / NADH que permite el funcionamiento continuo del metabolismo.
Papel en la enfermedad
El papel fundamental de la GPDH en el mantenimiento del potencial NAD+ / NADH , así como su papel en el metabolismo de los lípidos , convierte a la GPDH en un factor en enfermedades de desequilibrio lipídico, como la obesidad .
También se ha descubierto que la GPDH desempeña un papel en el síndrome de Brugada . Se ha demostrado que las mutaciones en el gen que codifica GPD1 causan defectos en la cadena de transporte de electrones . Se cree que este conflicto con los niveles de NAD+ / NADH en la célula contribuye a defectos en la regulación del canal iónico de sodio cardíaco y puede provocar una arritmia letal durante la infancia. [13]
Objetivo farmacológico
Se cree que la isoforma mitocondrial de la G3P deshidrogenasa es inhibida por la metformina , un fármaco de primera línea para la diabetes tipo 2 . [14]
Investigación biológica
Sarcophaga barbata se utilizó para estudiar la oxidación del L-3-glicerofosfato en las mitocondrias. Se ha comprobado que el L-3-glicerofosfato no penetra en la matriz mitocondrial, a diferencia del piruvato. Esto ayuda a localizar la L-3-glicerofosfato-flavoproteína oxidorreductasa, que se encuentra en la membrana interna de las mitocondrias.
Estructura
La glicerol-3-fosfato deshidrogenasa consta de dos dominios proteicos . El dominio N-terminal es un dominio de unión a NAD y el extremo C actúa como un dominio de unión a sustrato. [15] Sin embargo, los residuos de la interfaz de dímero y tetrámero están involucrados en la unión de GAPDH-ARN, ya que GAPDH puede exhibir varias actividades de pluriempleo, incluida la modulación de la unión y/o la estabilidad del ARN. [dieciséis]
^ ab PDB : 1X0V ; Ou X, Ji C, Han X, Zhao X, Li X, Mao Y, Wong LL, Bartlam M, Rao Z (marzo de 2006). "Estructuras cristalinas de la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa 1 (GPD1) humana". Revista de biología molecular . 357 (3): 858–69. doi :10.1016/j.jmb.2005.12.074. PMID 16460752.
^ Ou X, Ji C, Han X, Zhao X, Li X, Mao Y, Wong LL, Bartlam M, Rao Z (marzo de 2006). "Estructuras cristalinas de la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa 1 (GPD1) humana". Revista de biología molecular . 357 (3): 858–69. doi :10.1016/j.jmb.2005.12.074. PMID 16460752.
^ ab Harding JW, Pyeritz EA, Copeland ES, White HB (enero de 1975). "Papel de la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa en el metabolismo de los glicéridos. Efecto de la dieta sobre las actividades enzimáticas en el hígado de pollo". La revista bioquímica . 146 (1): 223–9. doi :10.1042/bj1460223. PMC 1165291 . PMID 167714.
^ ab Geertman JM, van Maris AJ, van Dijken JP, Pronk JT (noviembre de 2006). "Ingeniería fisiológica y genética del metabolismo redox citosólico en Saccharomyces cerevisiae para mejorar la producción de glicerol". Ingeniería Metabólica . 8 (6): 532–42. doi :10.1016/j.ymben.2006.06.004. PMID 16891140.
^ Ansell R, Granath K, Hohmann S, Thevelein JM, Adler L (mayo de 1997). "Las dos isoenzimas para la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa dependiente de NAD+ de levadura codificada por GPD1 y GPD2 tienen funciones distintas en la osmoadaptación y la regulación redox". La Revista EMBO . 16 (9): 2179–87. doi :10.1093/emboj/16.9.2179. PMC 1169820 . PMID 9171333.
^ Kota V, Rai P, Weitzel JM, Middendorff R, Bhande SS, Shivaji S (septiembre de 2010). "Papel de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 2 en la capacitación de espermatozoides de ratón". Reproducción y Desarrollo Molecular . 77 (9): 773–83. doi :10.1002/mrd.21218. PMID 20602492. S2CID 19691537.
^ ab Stryer, Lubert; Berg, Jeremy Mark; Tymoczko, John L. (2002). "Capítulo 18.5: Lanzadera de glicerol 3-fosfato". Bioquímica . San Francisco: WH Freeman. ISBN0-7167-4684-0.
^ Guindalini C, Lee KS, Andersen ML, Santos-Silva R, Bittencourt LR, Tufik S (enero de 2010). "La influencia de la apnea obstructiva del sueño en la expresión del gen de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 1". Biología y Medicina Experimentales . 235 (1): 52–6. doi :10.1258/ebm.2009.009150. PMID 20404019. S2CID 207194967. Archivado desde el original el 24 de julio de 2011 . Consultado el 16 de mayo de 2011 .
^ Bunoust O, Devin A, Avéret N, Camougrand N, Rigoulet M (febrero de 2005). "Competencia de electrones para entrar en la cadena respiratoria: un nuevo mecanismo regulador del metabolismo oxidativo en Saccharomyces cerevisiae". La Revista de Química Biológica . 280 (5): 3407–13. doi : 10.1074/jbc.M407746200 . PMID 15557339.
^ Kota V, Dhople VM, Shivaji S (abril de 2009). "Tirosina fosfoproteoma de espermatozoides de hámster: papel de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 2 en la capacitación de los espermatozoides". Proteómica . 9 (7): 1809–26. doi :10.1002/pmic.200800519. PMID 19333995. S2CID 9248320.
^ Kumar S, Kalyanasundaram GT, Gummadi SN (febrero de 2011). "Respuesta diferencial de la catalasa, superóxido dismutasa y glicerol-3-fosfato deshidrogenasa a diferentes estreses ambientales en Debaryomyces nepalensis NCYC 3413". Microbiología actual . 62 (2): 382–7. doi :10.1007/s00284-010-9717-z. PMID 20644932. S2CID 41613712.
^ Xu SP, Mao XY, Ren FZ, Che HL (febrero de 2011). "Efecto atenuante del glicomacropéptido de caseína sobre la proliferación, diferenciación y acumulación de lípidos de preadipocitos de rata Sprague-Dawley in vitro". Revista de ciencia láctea . 94 (2): 676–83. doi : 10.3168/jds.2010-3827 . PMID 21257036.
^ Van Norstrand DW, Valdivia CR, Tester DJ, Ueda K, London B, Makielski JC, Ackerman MJ (noviembre de 2007). "Caracterización molecular y funcional de nuevas mutaciones del gen similar a la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 1 (GPD1-L) en el síndrome de muerte súbita del lactante". Circulación . 116 (20): 2253–9. doi :10.1161/CIRCULATIONAHA.107.704627. PMC 3332545 . PMID 17967976.
^ Ferrannini E (octubre de 2014). "El objetivo de la metformina en la diabetes tipo 2". El diario Nueva Inglaterra de medicina . 371 (16): 1547–8. doi :10.1056/NEJMcibr1409796. PMID 25317875.
^ Suresh S, Turley S, Opperdoes FR, Michels PA, Hol WG (mayo de 2000). "Una enzima diana potencial para fármacos tripanocidas revelada por la estructura cristalina de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa dependiente de NAD de Leishmania mexicana". Estructura . 8 (5): 541–52. doi : 10.1016/s0969-2126(00)00135-0 . PMID 10801498.
^ White MR, Khan MM, Deredge D, Ross CR, Quintyn R, Zucconi BE, Wysocki VH, Wintrode PL, Wilson GM, Garcin ED (enero de 2015). "Una mutación de la interfaz del dímero en la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa regula su unión al ARN rico en AU". La Revista de Química Biológica . 290 (3): 1770–85. doi : 10.1074/jbc.M114.618165 . PMC 4340419 . PMID 25451934.
Otras lecturas
Baranowski T (1963). "α-glicerofosfato deshidrogenasa". En Boyer PD, Lardy H, Myrbäck K (eds.). Las enzimas (2ª ed.). Nueva York: Academic Press. págs. 85–96.
Brosemer RW, Kuhn RW (mayo de 1969). "Propiedades estructurales comparativas de las alfa-glicerofosfato deshidrogenasas de abejas y conejos". Bioquímica . 8 (5): 2095–105. doi :10.1021/bi00833a047. PMID 4307630.
O'Brien SJ, MacIntyre RJ (octubre de 1972). "El ciclo del -glicerofosfato en Drosophila melanogaster. I. Aspectos bioquímicos y de desarrollo". Genética Bioquímica . 7 (2): 141–61. doi :10.1007/BF00486085. PMID 4340553. S2CID 22009695.
Warkentin DL, Fondy TP (julio de 1973). "Aislamiento y caracterización de L-glicerol-3-fosfato deshidrogenasa citoplasmática del tejido adiposo renal de conejo y su comparación con la enzima del músculo esquelético". Revista europea de bioquímica . 36 (1): 97-109. doi : 10.1111/j.1432-1033.1973.tb02889.x . PMID 4200180.
Albertyn J, van Tonder A, Prior BA (agosto de 1992). "Purificación y caracterización de glicerol-3-fosfato deshidrogenasa de Saccharomyces cerevisiae". Cartas FEBS . 308 (2): 130-2. doi : 10.1016/0014-5793(92)81259-O . PMID 1499720. S2CID 39643279.
Koekemoer TC, Litthauer D, Oelofsen W (junio de 1995). "Aislamiento y caracterización de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa del tejido adiposo". La Revista Internacional de Bioquímica y Biología Celular . 27 (6): 625–32. doi :10.1016/1357-2725(95)00012-E. PMID 7671141.
Påhlman IL, Larsson C, Averét N, Bunoust O, Boubekeur S, Gustafsson L, Rigoulet M (agosto de 2002). "Regulación cinética de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa mitocondrial por la NADH deshidrogenasa externa en Saccharomyces cerevisiae". La Revista de Química Biológica . 277 (31): 27991–5. doi : 10.1074/jbc.M204079200 . PMID 12032156.
Overkamp KM, Bakker BM, Kötter P, van Tuijl A, de Vries S, van Dijken JP, Pronk JT (mayo de 2000). "Análisis in vivo de los mecanismos de oxidación del NADH citosólico por las mitocondrias de Saccharomyces cerevisiae". Revista de Bacteriología . 182 (10): 2823–30. CiteSeerX 10.1.1.335.5313 . doi :10.1128/JB.182.10.2823-2830.2000. PMC 101991 . PMID 10781551.
Dawson AG, Cooney GJ (julio de 1978). "Reconstrucción de la lanzadera de alfa-glicerolfosfato utilizando mitocondrias de riñón de rata". Cartas FEBS . 91 (2): 169–72. doi : 10.1016/0014-5793(78)81164-8 . PMID 210038.
Opperdoes FR, Borst P, Bakker S, Leene W (junio de 1977). "Localización de glicerol-3-fosfato oxidasa en la mitocondria y partículas de glicerol-3-fosfato deshidrogenasa unida a NAD + en los microcuerpos del torrente sanguíneo se forman en Trypanosoma brucei". Revista europea de bioquímica . 76 (1): 29–39. doi : 10.1111/j.1432-1033.1977.tb11567.x . PMID 142010.
Eswaramoorthy S, Bonanno JB, Burley SK, Swaminathan S (junio de 2006). "Mecanismo de acción de una monooxigenasa que contiene flavina". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 103 (26): 9832–7. Código bibliográfico : 2006PNAS..103.9832E. doi : 10.1073/pnas.0602398103 . PMC 1502539 . PMID 16777962.