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Superfamilia de canales catiónicos

La superfamilia de canales catiónicos transmembrana se definió en InterPro y Pfam como la familia de canales iónicos tetraméricos . Estos incluyen los canales de sodio , potasio , [1] calcio , receptor de rianodina , HCN , CNG , CatSper y TRP . Este gran grupo de canales iónicos aparentemente incluye las familias 1.A.1 , 1.A.2 , 1.A.3 y 1.A.4 de la clasificación de transportadores TCDB .

Se describen como que tienen como mínimo dos hélices transmembrana que flanquean un bucle que determina la selectividad iónica del poro del canal. Muchos canales eucariotas tienen cuatro hélices transmembrana (TM) adicionales ( Pfam PF00520), relacionadas con o vestigiales de la compuerta de voltaje . Las proteínas con solo dos hélices transmembrana ( Pfam PF07885) se encuentran más comúnmente en bacterias. Esto también incluye los canales de potasio rectificadores hacia adentro de 2-TM ( Pfam PF01007) que se encuentran principalmente en eucariotas. Comúnmente hay dominios reguladores adicionales que sirven para regular la conducción iónica y la compuerta del canal. Los poros también pueden ser homotetrámeros o heterotetrámeros ; donde los heterotetrámeros pueden estar codificados como genes distintos o como dominios de poro múltiples dentro de un solo polipéptido. Las proteínas HVCN1 y la fosfatasa de tirosina-proteína putativa no contienen un dominio de poro de conducción de iones esperado, sino que tienen homología solo con el dominio del sensor de voltaje de los canales iónicos controlados por voltaje .

Canales humanos con 6 hélices TM

Catión

Potencial transitorio del receptor

Canónico
Melastatina
Vanilloide
Mucolipina
Anquirina
TRPP

Calcio

Dependiente del voltaje

Esperma

Receptor de rianodina

Potasio

Potasio dependiente del voltaje

Rectificador retardado
Potasio tipo A
Rectificador hacia el exterior
Rectificación interna
Activando lentamente
Modificador/silenciador

Activado por calcio

BK
es
Conocimiento
Otras subfamilias

Potasio rectificador interno

Sodio

Activado por nucleótidos cíclicos

Protón

Proteínas relacionadas

Canales humanos con 2 hélices TM en cada subunidad

Potasio

Canal de potasio de dominio de poro en tándem

Canales no humanos

De dos poros

Potasio que sólo afecta a los poros

Potasio dependiente de ligando

Potasio dependiente del voltaje

KCa procariota

Potasio regulado por voltaje y nucleótidos cíclicos

Sodio

No selectivo

Rectificador interno de potasio procariota

Diseñado

Referencias

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Enlaces externos

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