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N-formilmetionina

La N -formilmetionina (fMet, [2] HCO-Met, [3] For-Met [3] ) es un derivado del aminoácido metionina en el que se ha añadido un grupo formilo al grupo amino . Se utiliza específicamente para el inicio de la síntesis de proteínas a partir de genes bacterianos y orgánulos , y puede eliminarse postraduccionalmente .

fMet juega un papel crucial en la síntesis de proteínas de bacterias, mitocondrias y cloroplastos . No se utiliza en la síntesis de proteínas citosólicas de eucariotas , donde se traducen los genes nucleares de eucariotas . Tampoco es utilizado por Archaea . En el cuerpo humano, el sistema inmunológico reconoce fMet como material extraño o como una señal de alarma liberada por células dañadas, y estimula al cuerpo a luchar contra posibles infecciones.

Función en la síntesis de proteínas.

Traducción

fMet es necesario para el inicio eficiente de la síntesis de proteínas en la mayoría de los grupos de bacterias. El complejo ribosoma 30S-ARNm recluta específicamente ARNt con un aminoácido formilado: ARNt fMet unido a fMet en el caso natural. [4]

Debido a que fMet dirige la iniciación, las proteínas en las bacterias comienzan ( terminal N ) con un residuo de fMet en lugar de una metionina. Otras apariciones del codón "AUG" darán como resultado una metionina normal, porque se utiliza un ARNt Met "alargado" normal. [4]

La adición del grupo formilo a la metionina está catalizada por la enzima metionil-ARNt formiltransferasa . Esta modificación se realiza después de que la aminoacil-ARNt sintetasa haya cargado metionina en el ARNt fMet . La propia metionina se puede cargar en tRNA fMet o tRNA Met . Sin embargo, la formiltransferasa catalizará la adición del grupo formilo a la metionina sólo si la metionina se ha cargado en el ARNt fMet , no en el ARNt Met . Esto se debe a que la formiltransferasa reconoce características específicas del ARNt fMet . [4]

Las mitocondrias de las células eucariotas , incluidas las humanas, y los cloroplastos de las células vegetales también inician la síntesis de proteínas con fMet. Dado que las mitocondrias y los cloroplastos tienen esta síntesis inicial de proteínas con fMet en común con las bacterias, esto se ha citado como evidencia a favor de la teoría endosimbiótica . [5]

Inesperadamente, la formiltransferasa también puede actuar sobre el ARNt iniciador eucariota en células de levadura vivas. Incluso en condiciones normales, la formiltransferasa codificada nuclearmente no se importa completamente a las mitocondrias; aún más queda en el citosol bajo estrés. Estas formiltransferasas citosólicas producen fMet-tRNA i , que puede ser utilizado por los ribosomas citosólicos para producir proteínas con una fMet N-terminal. Estas proteínas están dirigidas a la degradación mediante procesos específicos en la célula. [6]

Más procesamiento

El fMet N -terminal se elimina de la mayoría de las proteínas, tanto del huésped como recombinantes, mediante una secuencia de dos reacciones enzimáticas. Primero, la péptido deformilasa (PDF) lo deformila, convirtiendo el residuo nuevamente en una metionina normal. Luego la metionina aminopeptidasa (MetAP) elimina el residuo de la cadena. [7] MetAP solo actúa sobre proteínas con residuos de segunda posición que son menos voluminosos que la valina. [8]

El fMet N -terminal, si no se elimina mediante PDF, parece actuar como un degrón , una señal para la degradación de proteínas. [8]

Variación

El grupo formilo no es estrictamente necesario para la iniciación. Las bacterias con su formiltransferasa desactivada, lo que evita que Met-tRNA fMet (es decir, metionina cargada en tRNA fMet ) se convierta en fMet-tRNA fMet , pueden tener diversos grados de capacidad residual para iniciar la síntesis de proteínas. E. coli , S. pneumoniae y B. subtilis casi no muestran capacidad de traducción restante, mientras que P. aeruginosa , S. aureus , H. influenzae y posiblemente S. faecalis todavía producen mucha proteína. En P. aeruginosa , esta capacidad se ve facilitada por el factor de iniciación bacteriano 2 , que puede transportar tanto Met-tRNA fMet como fMet-tRNA fMet al ribosoma. [9]

Relevancia para la inmunología

Debido a que fMet está presente en las proteínas producidas por bacterias pero no en las producidas por eucariotas (aparte de los orgánulos derivados de bacterias), el sistema inmunológico podría utilizarla para ayudar a distinguir lo propio de lo no propio. Las células polimorfonucleares pueden unirse a proteínas comenzando con fMet y utilizarlas para iniciar la atracción de los leucocitos sanguíneos circulantes y luego estimular actividades microbicidas como la fagocitosis . [10] [11] [12]

Dado que fMet está presente en proteínas producidas por mitocondrias y cloroplastos, las teorías más recientes no la ven como una molécula que el sistema inmunológico pueda utilizar para distinguir lo propio de lo no propio. [13] En cambio, los oligopéptidos y proteínas que contienen fMet parecen ser liberados por las mitocondrias de los tejidos dañados, así como por las bacterias dañadas, y por lo tanto pueden calificarse como una señal de "alarma", como se analiza en el modelo de inmunidad Danger . El oligopéptido prototípico que contiene fMet es la N -formilmetionina-leucil-fenilalanina (FMLP), que activa los leucocitos y otros tipos de células uniéndose a los receptores acoplados a proteína G del receptor 1 del péptido formilo (FPR1) y del receptor 2 del péptido formilo (FPR2) de estas células ( ver también receptor de péptido formilo 3 ). Actuando a través de estos receptores, los oligopéptidos y proteínas que contienen fMet forman parte del sistema inmunológico innato ; funcionan para iniciar respuestas de inflamación aguda , pero en otras condiciones funcionan para inhibir y resolver estas respuestas. Los oligopéptidos y proteínas que contienen fMet también funcionan en otras respuestas fisiológicas y patológicas.

Ver también

Referencias

  1. ^ "N-formil-DL-metionina". pubchem.ncbi.nlm.nih.gov .
  2. ^ PubChem. "N-formil-DL-metionina". pubchem.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 24 de octubre de 2020 .
  3. ^ ab Nomenclatura y simbolismo de aminoácidos y péptidos, 3AA-18 y 3AA-19
  4. ^ abc Shetty, S; Shah, RA; Chembazhi, UV; Sah, S; Varshney, U (28 de febrero de 2017). "Dos características altamente conservadas de los ARNt iniciadores bacterianos les permiten pasar por distintos puntos de control en el inicio de la traducción". Investigación de ácidos nucleicos . 45 (4): 2040-2050. doi :10.1093/nar/gkw854. PMC 5389676 . PMID  28204695. 
  5. ^ Alberts, Bruce (18 de noviembre de 2014). Biología molecular de la célula (Sexta ed.). Nueva York, NY. pag. 800.ISBN 978-0-8153-4432-2. OCLC  887605755.{{cite book}}: Mantenimiento CS1: falta el editor de la ubicación ( enlace )
  6. ^ Varshavsky, Alexander (8 de enero de 2019). "Vías de degradación de proteínas N-degron y C-degron". Procedimientos de la Academia Nacional de Ciencias . 116 (2): 358–366. Código Bib : 2019PNAS..116..358V. doi : 10.1073/pnas.1816596116 . PMC 6329975 . PMID  30622213. 
  7. ^ Sherman F, Stewart JW, Tsunasawa S (julio de 1985). "Metionina o no metionina al inicio de una proteína". Bioensayos . 3 (1): 27–31. doi :10.1002/bies.950030108. PMID  3024631. S2CID  33735710.
  8. ^ ab Piatkov, KI; Vu, TT; Hwang, CS; Varshavsky, A (2015). "Formil-metionina como señal de degradación en el extremo N de proteínas bacterianas". Célula Microbiana (Graz, Austria) . 2 (10): 376–393. doi : 10.15698/mic2015.10.231. PMC 4745127 . PMID  26866044. 
  9. ^ Piatkov, KI; Vu, TT; Hwang, CS; Varshavsky, A (2015). "Formil-metionina como señal de degradación en el extremo N de proteínas bacterianas". Célula Microbiana (Graz, Austria) . 2 (10): 376–393. doi : 10.15698/mic2015.10.231 . PMC 4745127 . PMID  26866044. 
  10. ^ Inmunología en MCG 1/phagstep
  11. ^ "El sistema inmunológico innato: receptores de reconocimiento de patrones, moléculas corporales antimicrobianas inespecíficas de antígenos y citocinas". Archivado desde el original el 27 de julio de 2010.
  12. ^ Detmers PA, Wright SD, Olsen E, Kimball B, Cohn ZA (septiembre de 1987). "Agregación de receptores del complemento en neutrófilos humanos en ausencia de ligando". La revista de biología celular . 105 (3): 1137–45. doi :10.1083/jcb.105.3.1137. PMC 2114803 . PMID  2958480. 
  13. ^ Zhang Q, Raoof M, Chen Y, Sumi Y, Sursal T, Junger W, Brohi K, Itagaki K, Hauser CJ (4 de marzo de 2010). "Los DAMP mitocondriales circulantes provocan respuestas inflamatorias a las lesiones". Naturaleza . 464 (7285): 104-107. Código Bib :2010Natur.464..104Z. doi : 10.1038/naturaleza08780. PMC 2843437 . PMID  20203610. 

enlaces externos