dominio cachorro

Dominio proteico

El dominio CUB es un dominio proteico conservado evolutivamente . El dominio CUB (para el complemento C1r/C1s, Uegf, Bmp1) es un motivo estructural de aproximadamente 110 residuos que se encuentran casi exclusivamente en proteínas extracelulares y asociadas a la membrana plasmática, muchas de las cuales están reguladas por el desarrollo. ^{[1] [2]} Estas proteínas participan en una amplia gama de funciones, incluida la activación del complemento, patrones de desarrollo, reparación de tejidos, guía de axones y angiogénesis, señalización celular, fertilización, hemostasia, inflamación, neurotransmisión, endocitosis mediada por receptores y tumores. supresión. ^[3] Muchas proteínas que contienen CUB son peptidasas que pertenecen a las familias de peptidasas MEROPS M12A (astacina) y S1A (quimotripsina).

Ejemplos

Las proteínas que contienen un dominio CUB incluyen:

• Subcomponentes del complemento de mamíferos C1s/C1r, que forman el complejo C1 dependiente de calcio, el primer componente de la vía clásica del sistema del complemento.
• Cricétidae sp. (Hámster) serina proteasa Casp, que degrada el colágeno tipo I y IV y la fibronectina en presencia de calcio.
• Componente activador del complemento del factor reactivo Ra (RARF) en mamíferos, una proteasa que escinde el componente C4 del complemento.
• Enteropeptidasa de vertebrados ( EC 3.4.21.9), una proteína de membrana de tipo II del borde en cepillo intestinal, que activa el tripsinógeno.
• Proteína morfogénica 1 del hueso de vertebrados ( BMP-1 ), una proteína que induce la formación de cartílago y hueso y expresa actividad metaloendopeptidasa.
• Proteínas de blástula de erizo de mar BP10 y SpAN.
• Proteínas hipotéticas de C. elegans F42A10.8 y R151.5.
• Neuropilina (antígeno A5), una molécula de adhesión celular independiente del calcio que funciona durante la formación de determinados circuitos neuronales.
• Fibropelinas I y III de Strongylocentrotus purpuratus (erizo de mar morado).
• Proteína de unión a hialuronato de mamífero TSG-6 (o PS4), una proteína inducida por suero y factor de crecimiento.
• Espermadhesinas de mamíferos.
• Proteína embrionaria UVS.2 de Xenopus laevis , que se expresa durante el desarrollo dorsoanterior.

Varias de las proteínas anteriores constan de un dominio catalítico junto con varios dominios CUB intercalados por dominios EGF de unión a calcio .

La espermadhesina es una subdivisión de la familia de dominios CUB y forma un componente importante del líquido seminal de los mamíferos . Las espermadhesinas son polipéptidos de 110 a 133 aminoácidos. ^[4] La actividad de unión de las espermadhesinas, por ejemplo la unión de heparina y carbohidratos, permite su papel central en la promoción de la unión de los espermatozoides a los grupos de carbohidratos en las glicoproteínas que se encuentran en la superficie de los ovocitos. ^[5] Las espermadhesinas de cerdos, toros y sementales muestran una similitud del 40 al 98% en sus secuencias de aminoácidos y todas poseen un enlace disulfuro entre residuos de cisteína adyacentes. Los polipéptidos de espermadhesina porcina están codificados por cinco genes estrechamente relacionados. La espermadhesina bovina se basa en un número significativamente menor de genes y solo dos están asociados con la expresión de esta proteína en el líquido seminal bovino. Se ha observado codificación genética redundante para espermadhesinas en chimpancés, perros y humanos. ^[6] La región que se correlaciona con los genes de espermadhesina en el ADN de ratas y ratones carece de cualquier código de espermadhesina. Se considera que estas variaciones en la expresión y codificación genética de las espermadhesinas son el resultado de ajustes evolutivos en los genes como consecuencia de mutaciones y deleciones en el material genético.

Algunos dominios CUB parecen estar implicados en la oligomerización y/o el reconocimiento de sustratos y compañeros de unión. Por ejemplo, en las proteasas del complemento, los dominios CUB median en la dimerización y la unión a regiones similares al colágeno de proteínas diana (por ejemplo, C1q para C1r/C1s). La estructura de los dominios CUB consiste en un sándwich beta con un pliegue en forma de gelatina . Casi todos los dominios CUB contienen cuatro cisteínas conservadas que probablemente forman dos puentes disulfuro (C1-C2, C3-C4). Los dominios CUB1 de C1 y Map19 tienen sitios de unión a calcio. ^[7]

Los genes humanos que codifican proteínas que contienen este dominio incluyen:

• ATRN , ATRNL1, BMP1 ,
• C1R , C1RL, C1S , CDCP2, CSMD1 , CSMD2 , CSMD3, CUBN , CUZD1 ,
• DCBLD1, DCBLD2 , DMBT1 , DREG,
• GPR126 ,
• KREMEN1 , KREMEN2,
• LRP10 , LRP12, LRP3 ,
• MASP1, MASP2 , MFRP ,
• NETO1 , NETO2, NRP1 , NRP2 ,
• OVCH1, OVCH2,
• PCOLCE , PCOLCE2 , PDGFC , PDGFD , PRSS7,
• RAMPA,
• SCUBE1 , SCUBE2, SCUBE3, SEZ6 , SEZ6L , SEZ6L2, ST14 ,
• TLL1 , TLL2 , TMPRSS7, TNFAIP6
• psk-2

Referencias

1. Bork P, Beckmann G (mayo de 1993). "El dominio CUB. Un módulo generalizado en proteínas reguladas por el desarrollo". Revista de biología molecular . 231 (2): 539–45. doi :10.1006/jmbi.1993.1305. PMID  8510165.
2. Bork P (abril de 1991). "Los componentes del complemento C1r/C1s, la proteína morfogénica ósea 1 y la proteína UVS.2 regulada por el desarrollo de Xenopus laevis comparten repeticiones comunes". Cartas FEBS . 282 (1): 9-12. doi : 10.1016/0014-5793(91)80433-4 . PMID  2026272. S2CID  33375087.
3. Perry SE, Robinson P, Melcher A, Quirke P, Bühring HJ, Cook GP, Blair GE (marzo de 2007). "Expresión del gen de la proteína 1 (CDCP1) que contiene el dominio CUB en células tumorales colorrectales". Cartas FEBS . 581 (6): 1137–42. doi : 10.1016/j.febslet.2007.02.025 . PMID  17335815. S2CID  30701692.
4. Romero A, Varela PF, Sanz L, Töpfer-Petersen E, Calvete JJ (marzo de 1996). "Cristalización y análisis preliminar de difracción de rayos X de la espermadhesina de plasma seminal de jabalí PSP-I / PSP-II, un heterodímero de dos dominios CUB". Cartas FEBS . 382 (1–2): 15–7. doi : 10.1016/0014-5793(96)00133-0 . hdl : 10261/246550 . PMID  8612739. S2CID  37515421.
5. Töpfer-Petersen E, Romero A, Varela PF, Ekhlasi-Hundrieser M, Dostàlovà Z, Sanz L, Calvete JJ (1998). "Espermadhesinas: una nueva familia de proteínas. Hechos, hipótesis y perspectivas". Andrología . 30 (4–5): 217–24. doi : 10.1111/j.1439-0272.1998.tb01163.x . PMID  9739418. S2CID  24941844.
6. Haase B, Schlötterer C, Hundrieser ME, Kuiper H, Distl O, Töpfer-Petersen E, Leeb T., Evolución de la familia de genes de espermadhesina, Gene. (2005) 352, P-20-29
7. Blanc G, Font B, Eichenberger D, Moreau C, Ricard-Blum S, Hulmes DJ, Moali C (junio de 2007). "Información sobre cómo los dominios CUB pueden ejercer funciones específicas mientras comparten un pliegue común: las características conservadas y específicas del dominio CUB1 contribuyen a la base molecular de la actividad del potenciador 1 de la proteinasa C del procolágeno". La Revista de Química Biológica . 282 (23): 16924–33. doi : 10.1074/jbc.M701610200 . PMID  17446170.

Este artículo incorpora texto del dominio público Pfam e InterPro : IPR000858