stringtranslate.com

Enlace de hidrógeno de baja barrera

Perfiles de energía para diferentes tipos de enlaces de hidrógeno entre heteroátomos de oxígeno . Los enlaces de hidrógeno estándar son asimétricos, y el hidrógeno está asociado con un heteroátomo. Cuando el pKa entre los heteroátomos es igual, se forma un enlace de hidrógeno simétrico con el hidrógeno en equilibrio entre dos ubicaciones. A distancias más cortas, la barrera entre los dos mínimos de energía es lo suficientemente baja como para que el hidrógeno esté igualmente unido como un enlace de hidrógeno de barrera baja o de un solo pozo.

Un enlace de hidrógeno de baja barrera ( LBHB , por sus siglas en inglés) es un tipo especial de enlace de hidrógeno . Los LBHB pueden ocurrir cuando el pKa de los dos heteroátomos es muy similar, lo que permite que el hidrógeno se comparta de manera más equitativa entre ellos. Esta compartición de hidrógeno provoca la formación de enlaces de hidrógeno especialmente cortos y fuertes. [1]

Descripción

En este compuesto macrocíclico de tipo corona aza , un protón se encuentra entre dos oxígenos carbonílicos de amida separados por una distancia de 2,45 Å. [2]

Los enlaces de hidrógeno estándar son más largos (por ejemplo, 2,8 Å para un enlace de hidrógeno O···O) y el ion hidrógeno pertenece claramente a uno de los heteroátomos . Cuando el pKa de los heteroátomos coincide estrechamente, es posible que se produzca un LBHB a una distancia más corta (~2,55 Å). Cuando la distancia disminuye aún más (<2,29 Å), el enlace se caracteriza como un enlace de hidrógeno de un solo pozo o de corta duración. [3]

Proteínas

Los enlaces de hidrógeno de baja barrera se producen en los entornos de exclusión de agua de las proteínas. [4] Múltiples residuos actúan juntos en un sistema de relevo de carga para controlar los valores de pKa de los residuos involucrados. Los LBHB también se producen en las superficies de las proteínas, pero son inestables debido a su proximidad al agua a granel y a los requisitos conflictivos de fuertes puentes salinos en las interfaces proteína-proteína. [4]

Catálisis enzimática

Se ha propuesto que los enlaces de hidrógeno de baja barrera son relevantes para la catálisis enzimática en dos tipos de circunstancias. [5] En primer lugar, un enlace de hidrógeno de baja barrera en una red de retransmisión de carga dentro de un sitio activo podría activar un residuo catalítico (por ejemplo, entre ácido y base dentro de una tríada catalítica ). En segundo lugar, un LBHB podría formarse durante la catálisis para estabilizar un estado de transición (por ejemplo, con un estado de transición de sustrato en un agujero de oxianión ). Ambos mecanismos son polémicos, y la evidencia teórica y experimental está dividida sobre si ocurren. [6] [7] Desde la década de 2000, el consenso general ha sido que las enzimas no utilizan los LBHB para ayudar a la catálisis. [7] [8] Sin embargo, en 2012, se propuso que un enlace de hidrógeno de baja barrera está involucrado en la discriminación de fosfato-arsenato para una proteína de transporte de fosfato. [9] Este hallazgo podría indicar la posibilidad de que los enlaces de hidrógeno de baja barrera desempeñen un papel catalítico en la selección del tamaño de los iones para algunos casos muy raros.

Referencias

  1. ^ Gilli, G.; Gilli, P. (26 de septiembre de 2000). "Hacia una teoría unificada del enlace de hidrógeno". Journal of Molecular Structure . 552 (1–3): 1–15. Bibcode :2000JMoSt.552....1G. doi :10.1016/S0022-2860(00)00454-3.
  2. ^ Day, Victor W.; Hossain, Md. Alamgir; Kang, Sung Ok; Powell, Douglas; Lushington, Gerald; Bowman-James, Kristin (2007). "Protón rodeado". J. Am. Chem. Soc. 129 (28): 8692–3. doi :10.1021/ja0724745. PMID  17585768.
  3. ^ Schiøtt B, Iversen BB, Madsen GK, Larsen FK, Bruice TC (octubre de 1998). "Sobre la naturaleza electrónica de los enlaces de hidrógeno de baja barrera en reacciones enzimáticas". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 95 (22): 12799–802. Bibcode :1998PNAS...9512799S. doi : 10.1073/pnas.95.22.12799 . PMC 23598 . PMID  9788994. 
  4. ^ ab Ishikita, Hiroshi; Saito, Keisuke (6 de febrero de 2014). "Reacciones de transferencia de protones y redes de enlaces de hidrógeno en entornos proteicos". Journal of the Royal Society Interface . 11 (91): 20130518. doi :10.1098/rsif.2013.0518. ISSN  1742-5689. PMC 3869154 . PMID  24284891. 
  5. ^ Cleland, WW; Frey, PA; Gerlt, JA (2 de octubre de 1998). "El enlace de hidrógeno de baja barrera en la catálisis enzimática". Journal of Biological Chemistry . 273 (40): 25529–25532. doi : 10.1074/jbc.273.40.25529 . PMID  9748211.
  6. ^ Ash, EL (7 de noviembre de 1997). "¿Un enlace de hidrógeno de baja barrera en la tríada catalítica de las serina proteasas? Teoría versus experimento". Science . 278 (5340): 1128–1132. Bibcode :1997Sci...278.1128A. doi :10.1126/science.278.5340.1128. PMID  9353195.
  7. ^ ab Schutz, Claudia N.; Warshel, Arieh (1 de abril de 2004). "Revisión de la propuesta del enlace de hidrógeno de baja barrera (LBHB): el caso del par Asp···His en las serina proteasas". Proteínas: estructura, función y bioinformática . 55 (3): 711–723. doi :10.1002/prot.20096. PMID  15103633. S2CID  34229297.
  8. ^ Warshel, Arieh; Sharma, Pankaz K.; Kato, Mitsunori; Xiang, Yun; Liu, Hanbin; Olsson, Mats HM (agosto de 2006). "Base electrostática para la catálisis enzimática". Chemical Reviews . 106 (8): 3210–3235. doi :10.1021/cr0503106. PMID  16895325.
  9. ^ Elias, Mikael; Wellner, Alon; Goldin-Azulay, Korina; Chabriere, Eric; Vorholt, Julia A.; Erb, Tobias J.; Tawfik, Dan S. (1 de noviembre de 2012). "La base molecular de la discriminación de fosfato en entornos ricos en arsenato". Nature . 491 (7422): 134–137. Bibcode :2012Natur.491..134E. doi :10.1038/nature11517. ISSN  0028-0836. PMID  23034649. S2CID  205230854.