Secuencia de ARN que dirige la traducción de codones UGA como selenocisteínas
En biología , el elemento SECIS (SECIS: se leno c ysteine insertion s equence ) es un elemento de ARN de alrededor de 60 nucleótidos de longitud que adopta una estructura de tallo-bucle . [1] Este motivo estructural (patrón de nucleótidos) dirige a la célula a traducir codones UGA como selenocisteínas (UGA es normalmente un codón de terminación ). Los elementos SECIS son, por tanto, un aspecto fundamental de los ARN mensajeros que codifican selenoproteínas , proteínas que incluyen uno o más residuos de selenocisteína .
En las bacterias, el elemento SECIS aparece poco después del codón UGA al que afecta. En arqueas y eucariotas , ocurre en la UTR 3' de un ARNm y puede causar que múltiples codones UGA dentro del ARNm codifiquen la selenocisteína. Un elemento SECIS arqueal, en Methanococcus , se encuentra en la UTR 5' . [2] [3]
El elemento SECIS aparece definido por características de secuencia, es decir, nucleótidos particulares tienden a estar en posiciones particulares en ella, y una estructura secundaria característica . La estructura secundaria es el resultado del emparejamiento de bases de nucleótidos de ARN complementarios y provoca una estructura en forma de horquilla. El elemento SECIS eucariota incluye pares de bases AG no canónicos , que son poco comunes en la naturaleza, pero son de importancia crítica para el correcto funcionamiento del elemento SECIS. Aunque los elementos SECIS eucariotas, arqueales y bacterianos comparten cada uno una estructura general en horquilla, no son alineables; por ejemplo, un esquema basado en alineación para reconocer elementos SECIS eucarióticos no podrá reconocer elementos SECIS arqueales. Sin embargo, en Lokiarcheota , los elementos SECIS son más similares a los elementos eucariotas. [4]
En bioinformática se han creado varios programas informáticos que buscan elementos SECIS dentro de una secuencia del genoma , basándose en las características de secuencia y estructura secundaria de los elementos SECIS. Estos programas se han utilizado en la búsqueda de nuevas selenoproteínas. [5]
Distribución de especies
El elemento SECIS se encuentra en una amplia variedad de organismos de los tres dominios de la vida (incluidos sus virus). [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11]
Referencias
- ^ Walczak R, Westhof E, Carbon P, Krol A (abril de 1996). "Un nuevo motivo estructural de ARN en el elemento de inserción de selenocisteína de los ARNm de selenoproteínas eucarióticas". ARN . 2 (4): 367–379. PMC 1369379 . PMID 8634917.
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enlaces externos
- Página para el elemento 1 de SECIS en Rfam
- Página para el elemento 2 de SECIS en Rfam
- Página para el elemento 3 de SECIS en Rfam
- Página para el elemento 4 de SECIS en Rfam
- Página para el elemento 5 de SECIS en Rfam