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Cloruro de dansilo

El cloruro de dansilo o cloruro de 5-(dimetilamino)naftaleno-1-sulfonilo es un reactivo que reacciona con grupos amino primarios en aminas alifáticas y aromáticas para producir aductos de sulfonamida fluorescentes estables de color azul o azul verdoso . También se puede hacer reaccionar con aminas secundarias. El cloruro de dansilo se usa ampliamente para modificar aminoácidos; específicamente, secuenciación de proteínas y análisis de aminoácidos . [2] [3] El cloruro de dansilo también puede denominarse DNSC . Asimismo, un derivado similar, la dansilamida, se conoce como DNSA.

Además, estos conjugados proteína-DNSC son sensibles a su entorno inmediato. Esto, en combinación con su capacidad para aceptar energía (como en la transferencia de energía por resonancia de fluorescencia ) del aminoácido triptófano , permite que esta técnica de etiquetado se utilice en la investigación del plegamiento y la dinámica de proteínas.

La fluorescencia de estos aductos de sulfonamida se puede mejorar añadiendo alfa-ciclodextrina . [4] El cloruro de dansilo es inestable en dimetilsulfóxido , que nunca debe usarse para preparar soluciones del reactivo. [5]

El coeficiente de extinción de los derivados del dansilo es importante para medir su concentración en solución. El cloruro de dansilo es uno de los derivados de sulfonamida más simples, por lo que comúnmente sirve como reactivo de partida para la producción de otros derivados. Los derivados exóticos pueden tener coeficientes de extinción muy diferentes, pero otros, como la dansilamida , son similares al cloruro de dansilo en características de absorción y fluorescencia. Pero incluso para el cloruro de dansilo, se han informado diversos valores de coeficiente de extinción. Algunos de los valores se utilizan para estimar el grado de éxito en los intentos de conjugar el tinte con una proteína. Se pueden usar otros valores para determinar una concentración precisa de una solución madre. Consulte la siguiente tabla para conocer valores específicos y sus usos.

Para todos los estudios siguientes, el valor de absorción siempre se toma como máximo que aparece entre 310 nm y 350 nm. El pico es amplio, por lo que la medición no es muy sensible a una mala calibración de la longitud de onda del espectrofotómetro, y el error debido a una mala calibración se puede evitar tomando el valor al máximo en lugar de usar estrictamente 330 nm.

Preparación

Este compuesto se puede preparar haciendo reaccionar el ácido sulfónico correspondiente con un exceso de oxicloruro de fósforo (POCl 3 ) a temperatura ambiente. [10]

Referencias

  1. ^ "MSDS". Sigma-Aldrich . Archivado desde el original el 27 de diciembre de 2007 . Consultado el 2 de diciembre de 2007 .
  2. ^ Caminante JM (1994). "El método Dansyl para identificar aminoácidos N-terminales". Protocolos básicos de proteínas y péptidos . Métodos Mol. Biol. vol. 32. págs. 321–8. doi :10.1385/0-89603-268-X:321. ISBN 0-89603-268-X. PMID  7951732.
  3. ^ Caminante JM (1994). "El método Dansyl-Edman para la secuenciación de péptidos". Protocolos básicos de proteínas y péptidos . Métodos Mol. Biol. vol. 32. págs. 329–34. doi :10.1385/0-89603-268-X:329. ISBN 0-89603-268-X. PMID  7951733.
  4. ^ Kinoshita T, Iinuma F, Tsuji A (1974). "Microanálisis de proteínas y péptidos. I. Mejora de la intensidad de fluorescencia de dansyl aminoácidos y dansyl proteínas en medios acuosos y su aplicación al ensayo de aminoácidos y proteínas". Química. Farmacéutica. Toro . 22 (10): 2413–20. doi : 10.1248/cpb.22.2413 . PMID  4468087.
  5. ^ Boyle, RE (1966). "La reacción de dimetilsulfóxido y cloruro de 5-dimetilaminonaftaleno-1-sulfonilo". La Revista de Química Orgánica . 31 (11): 3880–3882. doi :10.1021/jo01349a529.
  6. ^ Hartley, licenciado en Letras; V Massey (1956). "El centro activo de la quimotripsina: 1. Marcado con tinte fluorescente". Biochimica et Biophysica Acta . 21 (1): 58–70. doi :10.1016/0006-3002(56)90093-2. PMID  13363860.
  7. ^ Chen, RF (1968). "Proteínas marcadas con Dansyl". Bioquímica Analítica . 25 (1): 412–416. doi :10.1016/0003-2697(68)90116-4. PMID  5704757.
  8. ^ ab Weber, G (1952). "Fluorescencia polarizada de conjugados de proteínas". Revista Bioquímica . 51 (2): 145-155. doi :10.1042/bj0510145. PMC 1197814 . PMID  14944566. 
  9. ^ "Manual de sondas moleculares: cumarinas, pirenos y otros fluoróforos excitables por luz ultravioleta (sección 1.7)" . Consultado el 12 de junio de 2009 .
  10. ^ Arturo Mendel (1970). "Preparación mejorada de cloruro de 5-dimetilamino-1-naftalenosulfonilo". J. química. Ing. Datos . 15 (2): 340–341. doi :10.1021/je60045a010.