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RaTG13

El coronavirus de murciélago RaTG13 es un betacoronavirus similar al SARS identificado en los excrementos del murciélago de herradura Rhinolophus affinis . [2] [3] Fue descubierto en 2013 en excrementos de murciélago de una cueva minera cerca de la ciudad de Tongguan en el condado de Mojiang en Yunnan , China . [4] En febrero de 2020, [5] fue identificado como el pariente más cercano conocido del SARS-CoV-2 , el virus que causa COVID-19 , compartiendo una identidad de nucleótidos del 96,1% . [6] [7] Sin embargo, en 2022, los científicos encontraron tres coincidencias más cercanas en murciélagos encontrados a 530 km al sur, en Feuang , Laos, designados como BANAL-52 (96,8% de identidad), BANAL-103 y BANAL-236. [8] [9] [10]

Historia

En la primavera de 2012, tres mineros que limpiaban heces de murciélago en una mina de cobre abandonada cerca de la ciudad de Tongguan en el condado autónomo de Mojiang Hani desarrollaron una neumonía mortal . [11] Debido a la preocupación de que los casos de los mineros pudieran representar una nueva enfermedad, [12] las muestras de suero recolectadas de los mineros se enviaron al Instituto de Virología de Wuhan y Shi Zhengli y su grupo las analizaron para detectar el virus del Ébola , el virus Nipah y el SARSr-CoV Rp3 de murciélago. Las muestras dieron negativo. [3] [13] [11]

Para descubrir una posible causa de la infección, también se tomaron muestras de diferentes animales (incluidos murciélagos, ratas y musarañas almizcleras ) dentro y alrededor de la cueva minera. Entre 2012 y 2015, Shi Zhengli y su grupo aislaron 293 coronavirus diferentes (284 alfa-coronavirus y 9 beta-coronavirus ) de muestras de heces de murciélago en la cueva. Una de las muestras recolectadas en 2013 de Rhinolophus affinis (el murciélago de herradura intermedio) contenía una nueva secuencia de ácidos ribonucleicos identificada posteriormente como "RaTG13". [3] [13]

En 2020, Shi y su grupo volvieron a analizar las muestras de suero de los mineros para detectar el SARS-CoV-2. Las muestras dieron negativo. [3]

En 2020, la cepa identificada en la muestra pasó de llamarse Ra4991 original (muestra 4991 recolectada de Rhinolophus affinis ) a "RaTG13", para reflejar la especie de murciélago de origen (Ra de Rhinolophus affinis ), la ubicación geográfica (TG de Tongguan) y el año de recolección (13 de 2013). [14] El cambio de nombre ha sido considerado una insinuación por los defensores de la teoría de la fuga de laboratorio para la pandemia de COVID-19 . [14]

Virología

La secuencia de RaTG13 se reconstruyó a partir de un muestreo metagenómico (una práctica común en virología ambiental), [15] y como tal, podría ser potencialmente una quimera in silico . [16] No se ha confirmado que RaTG13 exista en la naturaleza, que haya sido cultivado o aislado en algún laboratorio, [12] o que sea un patógeno humano viable. [16] Nunca se ha detectado un virus vivo "RaTG13" en ninguna muestra de laboratorio del WIV o de otro lugar. [16]

Según su secuencia, RaTG13 es un virus de ARN de cadena positiva con una membrana externa. Su genoma tiene aproximadamente 29.800 nucleótidos. El genoma codifica una replicasa (ORF1a/1b) y cuatro proteínas estructurales; incluyendo una proteína de la espícula (S), proteína de membrana (M), proteína de la envoltura (E) y proteína de la nucleocápside (N); y cinco proteínas accesorias virales , incluyendo ORF3a (NS3), ORF6 (NS6), ORF7a (NS7a), ORF7b (NS7b) y ORF8 (NS8). [3] [17]

El virus RaTG13 tiene un gran parecido con el genoma del SARS-CoV-2 (comparte un 96,1 % de similitud de nucleótidos) y su identificación en excrementos de animales es una prueba que respalda el origen natural del SARS-CoV-2. [7] La ​​principal área de divergencia entre el virus RaTG13 y el SARS-CoV-2 se encuentra en el dominio de unión al receptor (RBD) de la proteína de la espícula (S), que es la porción que se une a la proteína del receptor en la superficie de la célula huésped y causa la infección. La divergencia en este dominio indica que, a diferencia del SARS-CoV-2, el virus RaTG13 podría no utilizar la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) como su sitio de entrada a la célula. [18] Además, la proteína S del virus RaTG13 carece del motivo de escisión de furina RRAR↓S. [18]

La afinidad de unión entre RATG13 y hACE2 es menor que la existente entre SARS-CoV-2 RBD y hACE2. [19]

Filogenética

Árbol filogenético

Un árbol filogenético basado en secuencias del genoma completo del SARS-CoV-2 y coronavirus relacionados es: [20] [21]

Véase también

Referencias

  1. ^ "Navegador de taxonomía (coronavirus de murciélago RaTG13)" www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 2 de enero de 2021 .
  2. ^ Ge XY, Wang N, Zhang W, Hu B, Li B, Zhang YZ, et al. (febrero de 2016). "Coexistencia de múltiples coronavirus en varias colonias de murciélagos en un pozo de mina abandonado". Virologica Sinica . 31 (1): 31–40. doi :10.1007/s12250-016-3713-9. PMC 7090819 . PMID  26920708. 
  3. ^ abcde Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (diciembre de 2020). "Adenda: un brote de neumonía asociado con un nuevo coronavirus de probable origen en murciélagos". Nature . 588 (7836): E6. Bibcode :2020Natur.588E...6Z. doi : 10.1038/s41586-020-2951-z . PMC 9744119 . PMID  33199918. 
  4. ^ Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (diciembre de 2020). "Adenda: un brote de neumonía asociado con un nuevo coronavirus de probable origen en murciélagos". Nature . 588 (7836): E6. Bibcode :2020Natur.588E...6Z. doi :10.1038/s41586-020-2951-z. PMC 9744119 . PMID  33199918. 
  5. ^ Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (marzo de 2020). "Un brote de neumonía asociado con un nuevo coronavirus de probable origen en murciélagos". Nature . 579 (7798): 270–273. Bibcode :2020Natur.579..270Z. doi :10.1038/s41586-020-2012-7. PMC 7095418 . PMID  32015507. 
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