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Dominio del factor von Willebrand tipo A

El dominio del factor von Willebrand tipo A (vWA) es un dominio proteico que lleva el nombre de su aparición en el factor von Willebrand (vWF), una gran glicoproteína multimérica que se encuentra en el plasma sanguíneo. Las formas mutantes de vWF están implicadas en la etiología de los trastornos hemorrágicos. [2] Este dominio tipo A es el prototipo de una superfamilia de proteínas ( InterProIPR036465 ; ver también clan Pfam).

El dominio vWA se encuentra en diversas proteínas plasmáticas: factores del complemento B, C2, CR3 y CR4; las integrinas (dominios I); colágeno tipos VI, VII, XII y XIV; y otras proteínas extracelulares. [3] [4] [5] Aunque la mayoría de las proteínas que contienen vWA son extracelulares, las más antiguas presentes en todos los eucariotas son todas proteínas intracelulares involucradas en funciones como la transcripción, la reparación del ADN, el transporte ribosomal y de membrana y el proteosoma . Una característica común parece ser la participación en complejos multiproteicos. Las proteínas que incorporan dominios vWA participan en numerosos eventos biológicos (p. ej., adhesión celular, migración, localización, formación de patrones y transducción de señales), que implican la interacción con una gran variedad de ligandos. [3] Varias enfermedades humanas surgen de mutaciones en los dominios vWA.

La predicción de la estructura secundaria a partir de 75 secuencias vWA alineadas ha revelado una secuencia en gran medida alterna de hélices alfa y hebras beta. [4] Se utilizaron algoritmos de reconocimiento de pliegues para calificar la compatibilidad de secuencias con una biblioteca de estructuras conocidas: se predijo que el pliegue del dominio vWA sería una hoja beta doblemente enrollada, abierta y retorcida, flanqueada por hélices alfa . [6] Se han determinado estructuras 3D para los dominios I de las integrinas CD11b (con magnesio unido) [7] y CD11a (con manganeso unido). [8] El dominio adopta un pliegue clásico alfa/beta de Rossmann y contiene un sitio de coordinación de iones metálicos inusual en su superficie. Se ha sugerido que este sitio representa un sitio de adhesión dependiente de iones metálicos general (MIDAS) para unir ligandos de proteínas. [7] Los residuos que constituyen el motivo MIDAS en los dominios I CD11b y CD11a están completamente conservados, pero la manera en que se coordina el ion metálico difiere ligeramente. [8]

Proteínas humanas que contienen este dominio.

ANTXR1 ; ANTXR2 ; novio ; C2 ; CACHD1 ; CACNA2D1 ; CACNA2D2 ; CACNA2D3 ; CACNA2D4 ; CFB ; CLCA1 ; CLCA2 ; CLCA4 ; COCH ; COL12A1 ; COL14A1 ; COL20A1 ; COL21A1 ; COL22A1 ; COL28; COL6A1 ; COL6A2 ; COL6A3 ; COL7A1 ; COLA1L; CaCC1; ITGA1 ; ITGA10 ; ITGA11 ; ITGA2 ; ITGAD ; ITGAE ; ITGAL ; ITGAM ; ITGAX ; ITIH1 ; ITIH2 ; ITIH3 ; ITIH4 ; ITIH5; ITIH5L; LOC285929; LOC340267; LOC389462; LOH11CR2A; MATN1 ; MATN2 ; MATN3 ; MATN4; PARP4 ; SVEP1(SEL-OB); VIT; SVA1; SVA2 ; FvW ; hCLCA1; hCLCA2; CMG2;

Referencias

  1. ^ Qu A, Leahy DJ (octubre de 1995). "Estructura cristalina del dominio I de la integrina CD11a / CD18 (LFA-1, alfa L beta 2)". Proc. Nacional. Acad. Ciencia. EE.UU . 92 (22): 10277–81. Código bibliográfico : 1995PNAS...9210277Q. doi : 10.1073/pnas.92.22.10277 . PMC  40779 . PMID  7479767.
  2. ^ Ruggeri ZM, Ware J (1993). "factor von Willebrand". FASEB J. 7 (2): 308–316. doi : 10.1096/fasebj.7.2.8440408 . PMID  8440408. S2CID  10574567.
  3. ^ ab Colombatti A, Bonaldo P, Doliana R (1993). "Módulos tipo A: dominios interactivos que se encuentran en varios colágenos no fibrilares y en otras proteínas de la matriz extracelular". Matriz . 13 (4): 297–306. doi :10.1016/S0934-8832(11)80025-9. PMID  8412987.
  4. ^ ab Smith KF, Haris PI, Chapman D, Perkins SJ, Williams SC, Sim RB (1994). "La estructura secundaria del dominio tipo A del factor von Willebrand en el factor B del complemento humano mediante espectroscopia infrarroja por transformada de Fourier. Su aparición en los tipos de colágeno VI, VII, XII y XIV, las integrinas y otras proteínas mediante predicciones de estructura promediadas". J. Mol. Biol . 238 (1): 104-119. doi :10.1006/jmbi.1994.1271. PMID  8145250.
  5. ^ Bork P (1991). "Dominios mezclados en proteínas extracelulares". FEBS Lett . 286 (1): 47–54. doi : 10.1016/0014-5793(91)80937-X . PMID  1864378. S2CID  22126481.
  6. ^ Perkins SJ, Edwards YJ (1995). "Se predice que el pliegue proteico del dominio tipo A del factor von Willebrand será similar a la hoja beta retorcida abierta flanqueada por hélices alfa que se encuentran en el ras-p21 humano". FEBS Lett . 358 (3): 283–286. doi : 10.1016/0014-5793(94)01447-9 . PMID  7843416. S2CID  85317759.
  7. ^ ab Lee JO, Rieu P, Arnaout MA, Liddington R (1995). "Estructura cristalina del dominio A de la subunidad alfa de la integrina CR3 (CD11b/CD18)". Celúla . 80 (4): 631–638. doi : 10.1016/0092-8674(95)90517-0 . PMID  7867070. S2CID  11275359.
  8. ^ ab Leahy DJ, Qu A (1995). "Estructura cristalina del dominio I de la integrina CD11a / CD18 (LFA-1, alfa L beta 2)". Proc. Nacional. Acad. Ciencia. EE.UU . 92 (22): 10277–10281. Código bibliográfico : 1995PNAS...9210277Q. doi : 10.1073/pnas.92.22.10277 . PMC 40779 . PMID  7479767. 

enlaces externos

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