Dominio proteico
El dominio de cremallera de leucina básica ( dominio bZIP ) se encuentra en muchas proteínas eucariotas que se unen al ADN . Una parte del dominio contiene una región que media las propiedades de unión al ADN específicas de la secuencia y la cremallera de leucina que se requiere para mantener juntas (dimerizar) dos regiones de unión al ADN. La región de unión al ADN comprende una serie de aminoácidos básicos como la arginina y la lisina . Las proteínas que contienen este dominio son factores de transcripción . [1] [2]
Factores de transcripción bZIP
Los factores de transcripción bZIP se encuentran en todos los eucariotas y forman una de las familias más grandes de TF dimerizantes. [3] Un estudio evolutivo de 2008 reveló que 4 genes bZIP fueron codificados por el genoma del ancestro común más reciente de todas las plantas. [4] Las interacciones entre los factores de transcripción bZIP son numerosas y complejas [5] [6] [3] y juegan papeles importantes en el desarrollo del cáncer [7] en los tejidos epiteliales, la síntesis de hormonas esteroides por células de los tejidos endocrinos, [8] factores que afectan las funciones reproductivas, [9] y varios otros fenómenos que afectan la salud humana.
Proteínas que contienen el dominio bZIP
- Heterodímero fos / jun AP-1 que forma un factor de transcripción
- Factor de transcripción Jun-B
- Factor de transcripción del elemento de respuesta a cAMP CREB
- Factor de transcripción OPAQUE2 (O2) del gen zeína de 22 kD que codifica una clase de proteínas de almacenamiento en el endospermo de los granos de maíz ( Zea mays )
- NFE2L2 o Nrf2
- Factores de transcripción Bzip Maf
Proteínas humanas que contienen este dominio
ATF1 ; ATF2 ; ATF4 ; ATF5 ; ATF6 ; ATF7 ; BACH1 ; BACH2 ; BATF ; BATF2 ; CEBPA ; CEBPB ; CEBPD ; CEBPE ; CEBPG ; CEBPZ ; CREB1 ; CREB3 ; CREB3L1 ; CREB3L2; CREB3L3; CREB3L4; CREB5 ; CREBL1 ; CREMA ; E4BP4 ; FOSL1 ; FOSL2 ; JUN ; JUNB ; JUND ; MAFA ; MAFB ; MAFF ; MAFG ; NRL; C-MAF ; MAFK ; ENF2 ; NFE2L2 ; NFE2L3 ; SNFT; XBP1
Referencias
- ^ Ellenberger T (1994). "Cómo comprender el reconocimiento del ADN: estructuras de la cremallera de leucina de la región básica y de los dominios de unión al ADN hélice-bucle-hélice de la región básica". Curr. Opin. Struct. Biol . 4 (1): 12–21. doi :10.1016/S0959-440X(94)90054-X.
- ^ Hurst HC (1995). "Factores de transcripción 1: proteínas bZIP". Perfil proteico . 2 (2): 101–68. PMID 7780801.
- ^ ab Amoutzias, Grigoris D.; Robertson, David L.; Van de Peer, Yves; Oliver, Stephen G. (1 de mayo de 2008). "Elija a sus socios: dimerización en factores de transcripción eucariotas". Tendencias en Ciencias Bioquímicas . 33 (5): 220–229. doi :10.1016/j.tibs.2008.02.002. ISSN 0968-0004. PMID 18406148.
- ^ Corrêa LG, Riaño-Pachón DM, Schrago CG, dos Santos RV, Mueller-Roeber B, Vincentz M (2008). Shiu SH (ed.). "El papel de los factores de transcripción bZIP en la evolución de las plantas verdes: características adaptativas que surgen de cuatro genes fundadores". PLOS ONE . 3 (8): e2944. Bibcode :2008PLoSO...3.2944C. doi : 10.1371/journal.pone.0002944 . PMC 2492810 . PMID 18698409.
- ^ Vinson, Charles; Acharya, Asha; Taparowsky, Elizabeth J. (1 de enero de 2006). "Descifrando las interacciones del factor de transcripción B-ZIP in vitro e in vivo". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Estructura y expresión génica . 1759 (1–2): 4–12. doi :10.1016/j.bbaexp.2005.12.005. ISSN 0006-3002. PMID 16580748.
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Enlaces externos
- Entrada de dominio bZIP en la base de datos SMART
- Familia bZIP en PlantTFDB: base de datos de factores de transcripción de plantas
- Factores de transcripción bZIP de plantas Archivado el 20 de marzo de 2012 en Wayback Machine.