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Dominio NACHT

El dominio NACHT es un dominio proteico conservado evolutivamente . Este dominio NTPasa se encuentra en las proteínas de apoptosis , así como en las implicadas en la transcripción del MHC . [1] Su nombre refleja algunas de las proteínas que la contienen: NAIP ( proteína inhibidora de la apoptosis de la familia NLP ), CIITA (es decir, C2TA o activador de la transcripción MHC clase II ), HET-E (proteína del locus de incompatibilidad de Podospora anserina ) y TEP1 (es decir, TP1 o proteína asociada a telomerasa).

El dominio NACHT contiene de 300 a 400 aminoácidos . Es un dominio predicho de nucleósido-trifosfatasa (NTPasa), que se encuentra en proteínas animales , fúngicas y bacterianas . Se encuentra asociado con otros dominios, como el dominio de reclutamiento de caspasa ( InterProIPR001315 ), el dominio de pirina ( InterProIPR004020 ), el dominio de repetición HEAT ( InterProIPR004155 ), la repetición WD40 ( InterProIPR001680 ), el repetición rica en leucina (LRR) o repetición BIR ( InterProIPR001370 ). [1]

El dominio NACHT consta de siete motivos conservados distintos, incluido el bucle P específico de ATP/GTPasa, el sitio de unión de Mg 2+ ( motivos Walker A y B , respectivamente) y cinco motivos más específicos. Las características únicas del dominio NACHT incluyen la prevalencia de residuos "pequeños" (glicina, alanina o serina) directamente C-terminal del aspartato coordinador de Mg 2+ en el motivo Walker B, en lugar de un segundo residuo ácido prevalente en otros NTPasas. Un segundo residuo ácido se encuentra típicamente en las proteínas que contienen NACHT dos posiciones aguas abajo. Además, el motivo distal VII contiene un patrón conservado de residuos polares, aromáticos e hidrofóbicos que no se observa en ninguna otra familia de NTPasa. [1]

Ejemplos

Las proteínas humanas que contienen este dominio incluyen:

Referencias

  1. ^ abc Koonin EV, Aravind L (mayo de 2000). "La familia NACHT: un nuevo grupo de NTPasas predichas implicadas en la apoptosis y la activación de la transcripción del MHC". Tendencias en Ciencias Bioquímicas . 25 (5): 223–4. doi :10.1016/S0968-0004(00)01577-2. PMID  10782090.
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