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Dihidroorotato deshidrogenasa

La dihidroorotato deshidrogenasa ( DHODH ) es una enzima que en los seres humanos está codificada por el gen DHODH en el cromosoma 16. La proteína codificada por este gen cataliza el cuarto paso enzimático, la oxidación mediada por ubiquinona de dihidroorotato a orotato , en la biosíntesis de novo de pirimidinas . Esta proteína es una proteína mitocondrial ubicada en la superficie externa de la membrana mitocondrial interna (IMM). [1] Los inhibidores de esta enzima se utilizan para tratar enfermedades autoinmunes como la artritis reumatoide . [2]

Estructura

La DHODH puede variar en contenido de cofactor , estado oligomérico, localización subcelular y asociación de membrana . Una alineación de secuencia general de estas variantes de DHODH presenta dos clases de DHODH: la Clase 1 citosólica y la Clase 2 unida a la membrana. En la DHODH de Clase 1, un residuo básico de cisteína cataliza la reacción de oxidación , mientras que en la Clase 2, la serina cumple esta función catalítica. Estructuralmente, las DHODH de Clase 1 también se pueden dividir en dos subclases, una de las cuales forma homodímeros y usa fumarato como su aceptor de electrones , y la otra que forma heterotetrámeros y usa NAD+ como su aceptor de electrones. Esta segunda subclase contiene una subunidad de adición (PyrK) que contiene un grupo de hierro-azufre y un dinucleótido de flavina y adenina (FAD). Mientras tanto, las DHODH de Clase 2 usan coenzima Q / ubiquinonas como oxidante . [2]

En eucariotas superiores , esta clase de DHODH contiene una señal bipartita N-terminal que comprende una secuencia de orientación mitocondrial catiónica anfipática de aproximadamente 30 residuos y una secuencia transmembrana hidrófoba . La secuencia de orientación es responsable de la localización de esta proteína en la IMM, posiblemente al reclutar el aparato de importación y mediar el transporte impulsado por ΔΨ a través de las membranas mitocondriales internas y externas , mientras que la secuencia transmembrana es esencial para su inserción en la IMM. [2] [3] Esta secuencia es adyacente a un par de hélices α , α1 y α2, que están conectadas por un bucle corto. Juntos, este par forma un embudo hidrófobo que se sugiere que sirve como sitio de inserción para la ubiquinona , junto con la cavidad de unión de FMN en la terminal C. [2] Los dos dominios terminales están conectados directamente por un bucle extendido. El dominio C-terminal es el más grande de los dos y se pliega en una estructura de barril α/β conservada con un núcleo de ocho cadenas β paralelas rodeadas por ocho hélices α. [2] [4]

Función

La DHODH humana es una flavoproteína FMN ubicua . En las bacterias (gen pyrD ), se encuentra en el lado interno de la membrana citosólica . En algunas levaduras, como en Saccharomyces cerevisiae (gen URA1), es una proteína citosólica, mientras que, en otros eucariotas, se encuentra en las mitocondrias. [5] También es la única enzima en la vía de biosíntesis de pirimidinas ubicada en las mitocondrias en lugar del citosol. [4]

Como enzima asociada con la cadena de transporte de electrones , la DHODH vincula la bioenergética mitocondrial, la proliferación celular, la producción de ROS y la apoptosis en ciertos tipos de células. La disminución de DHODH también resultó en un aumento de la producción de ROS, una disminución del potencial de membrana y un retraso del crecimiento celular. [4] Además, debido a su papel en la síntesis de ADN , la inhibición de DHODH puede proporcionar un medio para regular la elongación transcripcional . [6]

Mecanismo

En especies de mamíferos, la DHODH cataliza el cuarto paso en la biosíntesis de pirimidina de novo, que implica la oxidación mediada por ubiquinona de dihidroorotato a orotato y la reducción de FMN a mononucleótido de dihidroflavina (FMNH2):

(S)-dihidroorotato + O 2 orotato + H 2 O 2

El mecanismo particular de deshidrogenación del ácido dihidroorótico por DHODH difiere entre las dos clases de DHODH. Los DHODH de clase 1 siguen un mecanismo concertado, en el que los dos enlaces C–H del ácido dihidroorótico se rompen de manera concertada. Los DHODH de clase 2 siguen un mecanismo escalonado, en el que la ruptura de los enlaces C–H precede al equilibrio del iminio en ácido orótico . [2]

Inhibidores

Importancia clínica

Se ha demostrado que los fármacos inmunomoduladores teriflunomida y leflunomida inhiben la DHODH. La DHODH humana tiene dos dominios: un dominio de barril alfa/beta que contiene el sitio activo y un dominio alfa-helicoidal que forma la apertura de un túnel que conduce al sitio activo. Se ha demostrado que la leflunomida se une en este túnel. [7] La ​​leflunomida se está utilizando para el tratamiento de la artritis reumatoide y psoriásica , así como de la esclerosis múltiple . [2] [7] Sus efectos inmunosupresores se han atribuido al agotamiento del suministro de pirimidina para las células T o a vías más complejas mediadas por interferón o interleucina , pero, no obstante, requieren más investigación. [2]

Además, la DHODH puede desempeñar un papel en la supresión del cáncer mediada por el retinoide N-(4-hidroxifenil)retinamida ( 4HPR ) . La inhibición de la actividad de la DHODH con teriflunomida o la expresión con interferencia de ARN resultó en una menor generación de ROS en las células epiteliales de la piel y la próstata transformadas y, por lo tanto, en la apoptosis de las mismas . [8]

Se ha demostrado que las mutaciones en este gen causan el síndrome de Miller , también conocido como síndrome de Genee-Wiedemann, síndrome de Wildervanck-Smith o distosis acrofacial postaxial. [9] [10]

Interacciones

La DHODH se une a su cofactor FMN junto con la ubiquinona para catalizar la oxidación de dihidroorotato a orotato. [2]

Referencias

  1. ^ "Gen Entrez: DHODH dihidroorotato deshidrogenasa (quinona)".
  2. ^ abcdefghi Munier-Lehmann H, Vidalain PO, Tangy F, Janin YL (abril de 2013). "Sobre las dihidroorotato deshidrogenasas y sus inhibidores y usos". Journal of Medicinal Chemistry . 56 (8): 3148–67. doi :10.1021/jm301848w. PMID  23452331.
  3. ^ Rawls J, Knecht W, Diekert K, Lill R, Löffler M (abril de 2000). "Requisitos para la importación y localización mitocondrial de la dihidroorotato deshidrogenasa". Revista Europea de Bioquímica . 267 (7): 2079–87. doi : 10.1046/j.1432-1327.2000.01213.x . PMID  10727948.
  4. ^ abc Fang J, Uchiumi T, Yagi M, Matsumoto S, Amamoto R, Takazaki S, et al. (5 de febrero de 2013). "La dihidro-orotato deshidrogenasa está físicamente asociada con el complejo respiratorio y su pérdida conduce a una disfunción mitocondrial". Bioscience Reports . 33 (2): e00021. doi :10.1042/BSR20120097. PMC 3564035 . PMID  23216091. 
  5. ^ Nagy M, Lacroute F, Thomas D (octubre de 1992). "Evolución divergente de la biosíntesis de pirimidina entre levaduras anaeróbicas y aeróbicas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 89 (19): 8966–70. Bibcode :1992PNAS...89.8966N. doi : 10.1073/pnas.89.19.8966 . PMC 50045 . PMID  1409592. 
  6. ^ White RM, Cech J, Ratanasirintrawoot S, Lin CY, Rahl PB, Burke CJ, et al. (marzo de 2011). "DHODH modula la elongación transcripcional en la cresta neural y el melanoma". Nature . 471 (7339): 518–22. Bibcode :2011Natur.471..518W. doi :10.1038/nature09882. PMC 3759979 . PMID  21430780. 
  7. ^ ab Liu S, Neidhardt EA, Grossman TH, Ocain T, Clardy J (enero de 2000). "Estructuras de la dihidroorotato deshidrogenasa humana en complejo con agentes antiproliferativos". Structure . 8 (1): 25–33. doi : 10.1016/S0969-2126(00)00077-0 . PMID  10673429.
  8. ^ Hail N, Chen P, Kepa JJ, Bushman LR, Shearn C (julio de 2010). "La dihidroorotato deshidrogenasa es necesaria para la producción de especies reactivas de oxígeno y la apoptosis inducidas por N-(4-hidroxifenil)retinamida". Free Radical Biology & Medicine . 49 (1): 109–16. doi :10.1016/j.freeradbiomed.2010.04.006. PMC 2875309 . PMID  20399851. 
  9. ^ Ng SB, Buckingham KJ, Lee C, Bigham AW, Tabor HK, Dent KM, et al. (enero de 2010). "La secuenciación del exoma identifica la causa de un trastorno mendeliano". Nature Genetics . 42 (1): 30–5. doi :10.1038/ng.499. PMC 2847889 . PMID  19915526. 
  10. ^ Fang J, Uchiumi T, Yagi M, Matsumoto S, Amamoto R, Saito T, et al. (diciembre de 2012). "Inestabilidad proteica y defectos funcionales causados ​​por mutaciones de la dihidro-orotato deshidrogenasa en pacientes con síndrome de Miller". Bioscience Reports . 32 (6): 631–9. doi :10.1042/BSR20120046. PMC 3497730 . PMID  22967083. 

Lectura adicional

Enlaces externos

Este artículo incorpora texto de dominio público de Pfam e InterPro : IPR001295