Las finales de la Copa Intertoto de la UEFA de 2003 las ganaron el Schalke 04 , el Villarreal y el Perugia . Los tres equipos avanzaron a la Copa de la UEFA .
Este partido fue declarado nulo por la UEFA debido a un incidente entre un aficionado en el estadio y una bomba de humo arrojada al campo. El partido de vuelta determinó por sí solo el resultado del encuentro.
Con un resultado global de 2-2, Pasching ganó gracias a los goles de visitante.
Lierse ganó 7-1 en el global.
Pobeda ganó 7-2 en el global.
Con un resultado global de 3-3, el Partizani ganó gracias a los goles marcados fuera de casa.
Con un resultado global de 3-3, el Brno ganó gracias al valor de los goles marcados fuera de casa.
Koper ganó 3-2 en el global.
El Örgryte IS ganó 4-1 en el global.
Con un resultado global de 3-3, el Győr ganó gracias al valor de los goles marcados fuera de casa.
Marek Dupnitsa ganó 5-4 en el global.
Shamrock Rovers ganó 3-1 en el global.
Con un resultado global de 2-2, el Tampere United ganó gracias a los goles de visitante.
Sutjeska ganó 4-1 en el global.
Gloria Bistrița ganó 6-2 en el global.
El OFK Belgrado ganó 5-3 en el global.
Wil ganó 2-1 en el global.
Tobol ganó 5-1 en el global.
El ZTS Dubnica ganó 7-1 en el global.
Dacia Chișinău ganó 5-1 en el global.
El Sloboda Tuzla ganó en los penaltis con un resultado global de 2-2.
Shakhtyor Soligorsk ganó 8-1 en el global.
Allianssi ganó 2-1 en el global.
Allianssi ganó 1-0 en el global.
Con un resultado global de 4-4, el Niza ganó gracias a los goles marcados fuera de casa.
Slovácko ganó 4-3 en el global.
Por 2-2 en el global, el Racing de Santander ganó gracias al valor doble de los goles marcados fuera de casa.
Slovan Liberec ganó 4-0 en el global.
Brno ganó 4-3 en el global.
Brescia ganó 3-2 en el global.
El Wolfsburgo ganó 3-1 en el global.
Cibalia ganó 5-3 en el global.
Tobol ganó 3-0 en el global.
Wil ganó 4-3 en el global.
Pasching ganó 3-2 en el global.
Lierse ganó 5-2 en el global.
El Tampere United ganó 1-0 en el global.
Dacia Chișinău ganó 5-0 en el global.
Con un resultado global de 3-3, el Koper ganó gracias a los goles de visitante.
Pasching ganó 4-0 en el global.
Perugia ganó 4-0 en el global.
Koper ganó 5-4 en el global.
El Nantes ganó 5-3 en el global.
El Werder Bremen ganó 1-0 en el global.
Villarreal won 3–1 on aggregate.
Brno won 5–4 on aggregate.
Schalke 04 won 3–1 on aggregate.
Slovan Liberec won 3–1 on aggregate.
Wolfsburg won 3–0 on aggregate.
Cibalia won 2–1 on aggregate.
Heerenveen won 5–1 on aggregate.
Heerenveen won 2–1 on aggregate.
Wolfsburg won 8–1 on aggregate.
Schalke 04 won 2–1 on aggregate.
Pasching won 5–1 on aggregate.
Perugia won 1–0 on aggregate.
Villarreal won 3–1 on aggregate.
Schalke 04 won 2–0 on aggregate.
Perugia won 3–0 on aggregate.
Villarreal won 2–1 on aggregate.