La cotransformación es la transformación simultánea de dos o más genes .
Sólo los genes que se encuentran en la misma vecindad cromosómica pueden ser transformados; cuanto más cerca estén los genes, más frecuentemente serán cotransformados. Por el contrario, los genes que están lo suficientemente separados como para no aparecer juntos en un fragmento de ADN extraño casi nunca serán cotransformados, porque la transformación es tan ineficiente que las células receptoras generalmente sólo absorben un único ADN.
En un estudio de transformación natural , los investigadores aislaron bacterias B. subtilis con dos mutaciones ( trpC2 e hisB2 ) que las convertían en auxótrofas Trp- e His-. Estas auxótrofas dobles sirvieron como receptoras en el estudio, las células de tipo salvaje (Trp+, His+) fueron las donantes. En este estudio, los números de transformantes Trp+ e His+ fueron iguales. Pruebas posteriores mostraron que 40 de cada 100 colonias transferidas Trp+ también eran His+. De manera similar, las pruebas de los transformantes His+ mostraron que aproximadamente el 40% también son Trp+. Por lo tanto, en el 40% de las colonias analizadas, los genes trpC+ e hisB+ habían sido cotransformados.
Dado que durante la transformación, el ADN del donante reemplaza solo un pequeño porcentaje del cromosoma del receptor , ¿por qué se cotransforman los dos genes de B. subtilis con una frecuencia tan alta? Porque los genes trpC e hisB se encuentran muy cerca uno del otro en el cromosoma y, por lo tanto, están vinculados genéticamente. Aunque el cromosoma del donante se fragmenta en pequeños trozos de aproximadamente 20 kb durante su extracción para el proceso de transformación, los alelos trpC+ e hisB+ de tipo salvaje están tan cerca que a menudo aparecen en la misma molécula de ADN del donante . El análisis de secuencias muestra que los genes trpC e hisB están separados solo por unos 7 kb.