Conjuntos de datos de COVID-19

Conjuntos de datos sobre la COVID-19

Los conjuntos de datos de COVID-19 son bases de datos públicas para compartir datos de casos e información médica relacionada con la pandemia de COVID-19 .

Estadísticas agregadas

Estados Unidos

Voluntaria/no gubernamental

Departamento de Salud y Servicios Humanos de los Estados Unidos

Global

• Centro de recursos sobre el coronavirus de Johns Hopkins : datos globales agregados que incluyen casos, pruebas, rastreo de contactos y desarrollo de vacunas ^[12]
• Panel de datos sobre enfermedades por coronavirus de la Organización Mundial de la Salud (OMS): base de datos de casos confirmados y muertes notificadas a nivel mundial y desglosada por región. ^[13] Esta base de datos forma parte de la Plataforma de datos sanitarios de la OMS. ^[14]
• Proyecto de datos abiertos sobre la COVID-19 en África: una base de datos y un panel de información gestionados por voluntarios que informan sobre el número de casos, muertes, infecciones de trabajadores sanitarios, servicios de atención sanitaria y necesidades urgentes a nivel de región, país y distrito. ^[15]

Centros de datos

• Health Data Research UK ofrece un registro de búsqueda de recursos de datos de salud del Reino Unido, incluidos conjuntos de datos relacionados con COVID-19.
• Conjuntos de datos de acceso abierto de los NIH: Los Institutos Nacionales de Salud proporcionan datos de acceso abierto y recursos computacionales relacionados con la COVID-19. ^[16]
• Conjunto de datos de investigación abierta sobre la COVID-19 (CORD-19): el proyecto Semantic Scholar del Instituto Allen de IA alberga CORD-19, un conjunto de datos públicos de artículos académicos sobre la COVID-19 y la investigación relacionada. ^[17] El conjunto de datos se actualiza a diario e incluye artículos revisados ​​por pares y preimpresiones. ^[18] CORD-19 fue publicado originalmente el 16 de marzo de 2020 por investigadores y líderes del Instituto Allen de IA, la Iniciativa Chan Zuckerberg , el Centro de Seguridad y Tecnología Emergente de la Universidad de Georgetown , Microsoft y la Biblioteca Nacional de Medicina . ^[19] El conjunto de datos se crea mediante el uso de minería de texto de la literatura de investigación actual. ^[20]

Recursos específicos sobre temas y de interés especial

Genómica

• Los datos genómicos de consenso para el SARS-CoV-2 están disponibles a través de GISAID para usuarios registrados ^[21] y están incluidos en un panel de árbol filogenético interactivo ^[22] en Nextstrain , un proyecto de datos genómicos de patógenos de código abierto . ^[23]

Imágenes (radiología)

• Las características de imagen características en las radiografías de tórax y la tomografía computarizada (TC) de personas sintomáticas incluyen opacidades periféricas asimétricas en vidrio deslustrado sin derrames pleurales . ^[24] La Universidad de Montreal y Mila crearon la "Colección de datos de imágenes de COVID-19" en marzo, que es un repositorio de datos público de imágenes de tórax. ^{[25] [26] [27]} El Banco de datos de imágenes médicas de la Región Valenciana publicó un gran conjunto de datos de imágenes de tórax de España. ^{[28] [29]} La Sociedad Radiológica Italiana está compilando una base de datos internacional en línea de hallazgos de imágenes para casos confirmados. ^[30] Las plataformas de intercambio de casos de radiología en línea como Eurorad y Radiopaedia sirven como plataformas para compartir datos e imágenes de casos de COVID-19. ^{[31] [32]}

Referencias

1. Torpey, Holly; Caballero, MD, Jorge A. (eds.). "Datos de los sitios de prueba de COVID-19". GISCorps/Coders Against COVID Testing Site Data . Consultado el 14 de diciembre de 2020 .
2. "Un grupo de voluntarios desarrolla una base de datos de ubicaciones de pruebas de COVID-19 para EE. UU." TechCrunch . Consultado el 3 de febrero de 2021 .
3. "Aplicación de la semana: localizador de sitios de prueba de COVID-19". Agencia Federal para el Manejo de Emergencias (FEMA) . Consultado el 3 de febrero de 2021 .
4. "Sitios de prueba de COVID-19 en California". www.arcgis.com . Consultado el 3 de febrero de 2021 .
5. "Casos y muertes por coronavirus en EE. UU." USAFacts.org . 2021-02-03 . Consultado el 2021-02-03 .
6. "Metodología detallada y fuentes: datos de COVID-19". USAFacts . Consultado el 3 de febrero de 2021 .
7. "Estadísticas y datos del brote de coronavirus". USAFacts . Consultado el 3 de febrero de 2021 .
8. Stephens, Autumn (21 de agosto de 2020). "Tracking Star in Oakland". Revista Diablo . Consultado el 18 de septiembre de 2020 .
9. "Acerca de nosotros". El proyecto de seguimiento de COVID . Consultado el 3 de febrero de 2021 .
10. Ahmad, Kashif (2021). "Un conjunto de datos de referencia para el análisis de sentimientos de las reseñas de los usuarios sobre las aplicaciones de rastreo de contactos de COVID-19". Harvard Dataverse. doi :10.7910/DVN/1RDRCM. {{cite journal}}: Requiere citar revista |journal=( ayuda )
11. Ahmad, Kashif (2021). "Análisis de sentimientos de las reseñas de los usuarios sobre aplicaciones de rastreo de contactos de COVID-19 con un conjunto de datos de referencia". arXiv : 2103.01196 [cs.CL].
12. "Inicio". Centro de recursos sobre el coronavirus de Johns Hopkins . Consultado el 18 de septiembre de 2020 .
13. "Panel de control de la enfermedad por coronavirus (COVID-19) de la OMS". covid19.who.int . Consultado el 18 de septiembre de 2020 .
14. "Plataforma de datos sanitarios mundiales - OMS". www.who.int . Consultado el 18 de septiembre de 2020 .
15. "Datos abiertos sobre la COVID-19 en África" ​​. Consultado el 16 de noviembre de 2020 .
16. "Datos de acceso abierto y recursos computacionales para abordar la COVID-19 | Ciencia de datos en los NIH". datascience.nih.gov . Consultado el 13 de octubre de 2020 .
17. "CORD-19". Semantic Scholar . Consultado el 13 de octubre de 2020 .
18. "El análisis de las publicaciones sobre la COVID-19 identifica lagunas en la investigación". EurekAlert! . Consultado el 13 de octubre de 2020 .
19. "Llamado a la acción a la comunidad tecnológica sobre el nuevo conjunto de datos legibles por máquina sobre la COVID-19". whitehouse.gov . Consultado el 13 de octubre de 2020 a través de Archivos Nacionales .
20. "La NLM aprovecha los datos y la minería de texto para mejorar las bases de datos de investigación sobre la COVID-19". governmentciomedia.com . 11 de mayo de 2020 . Consultado el 13 de octubre de 2020 .
21. "GISAID". www.gisaid.org . Consultado el 29 de diciembre de 2020 .
22. "Panel de control de SARS-CoV-2 de Nexstrain". nextstrain.org . Consultado el 29 de diciembre de 2020 .
23. "Nextstrain". docs.nextstrain.org . Consultado el 29 de diciembre de 2020 .
24. Li Y, Xia L (marzo de 2020). "Enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19): papel de la TC de tórax en el diagnóstico y tratamiento". Revista Estadounidense de Roentgenología . 214 (6): 1280-1286. doi : 10.2214/AJR.20.22954 . PMID  32130038. S2CID  212416282.
25. "Proyectos relacionados con la COVID-19". Mila . Recopilación de datos de imágenes de la COVID-19 . Consultado el 12 de julio de 2020 .
26. "Recopilación de datos de imágenes de COVID-19". GitHub . Consultado el 12 de julio de 2020 .
27. Cohen, Joseph (25 de marzo de 2020). "Recopilación de datos de imágenes de COVID-19". arXiv : 2003.11597 [eess.IV].
28. "BIMCV-COVID19, Conjuntos de datos relacionados con el curso patológico de la COVID19". Banco de datos de imágenes médicas de la Comunidad Valenciana Medical . Consultado el 12 de julio de 2020 .
29. de la Iglesia Vayá, María (1 de junio de 2020). "BIMCV COVID-19+: un gran conjunto de datos anotados de imágenes de RX y CT de pacientes con COVID-19". arXiv : 2006.01174 [eess.IV].
30. "Base de datos COVID-19". Società Italiana di Radiologia Medica e Interventistica (en italiano) . Consultado el 11 de marzo de 2020 .
31. "Neumotórax y neumomediastino: una complicación rara en la evolución de la neumonía por COVID-19". Eurorad . Consultado el 12 de julio de 2020 .
32. Campana, Daniel; Knipe, Henry. "COVID-19 (resumen)". Radiopedia . Consultado el 12 de julio de 2020 .