Un complejo proteína-ligando es un complejo de una proteína unida a un ligando [2] que se forma tras el reconocimiento molecular entre proteínas que interactúan entre sí o con otras moléculas . La formación de un complejo proteína-ligando se basa en el reconocimiento molecular entre macromoléculas biológicas y ligandos, donde ligando significa cualquier molécula que se une a la proteína con alta afinidad y especificidad. El reconocimiento molecular no es un proceso en sí mismo, ya que es parte de un mecanismo funcionalmente importante que involucra los elementos esenciales de la vida, como la autorreplicación , el metabolismo y el procesamiento de la información . Por ejemplo, la replicación del ADN depende del reconocimiento y la unión de la doble hélice del ADN mediante la helicasa , del ADN monocatenario mediante la ADN polimerasa y de los segmentos de ADN mediante la ligasa . El reconocimiento molecular depende de la afinidad y la especificidad . La especificidad significa que las proteínas distinguen a la pareja de unión altamente específica de las menos específicas y la afinidad permite que la pareja específica con alta afinidad permanezca unida incluso si hay altas concentraciones de parejas menos específicas con menor afinidad. [3]
El complejo proteína-ligando es una interacción no covalente reversible entre dos (macro)moléculas biológicas. En las interacciones no covalentes no se comparten electrones como en las interacciones o enlaces covalentes. La unión no covalente puede depender de enlaces de hidrógeno , fuerzas hidrófobas , fuerzas de van der Waals , interacciones π-π , interacciones electrostáticas en las que no se comparten electrones entre las dos o más moléculas involucradas. [4] Las moléculas (proteína y ligando) se reconocen entre sí también por estereoespecificidad , es decir, por la forma de las dos moléculas. Debido a esta propiedad realmente discriminativa, si no "cognitiva", Werner Loewenstein utiliza el término "demonio cognitivo" o demonio molecular para referirse al demonio de Maxwell , el famoso experimento mental. De hecho, las proteínas que forman complejos son capaces de elegir un sustrato entre una multitud de moléculas diferentes. [5] Jacques Monod atribuyó un desempeño o función teleonómica a estos complejos biológicos. La teleonomía implica la idea de una actividad orientada, coherente y constructiva. Por tanto, las proteínas deben considerarse agentes moleculares esenciales en el funcionamiento teleonómico de todos los seres vivos. [6]
La mayor afinidad posible de una proteína hacia el ligando, o molécula objetivo, se puede observar cuando la proteína tiene una imagen especular perfecta de la forma de la superficie objetivo junto con una distribución de carga que complementa perfectamente la superficie objetivo. [7] La afinidad entre proteína y ligando viene dada por la constante de disociación de equilibrio K d o la inversa de la constante de asociación 1/K a (o constante de unión 1/K b) que relaciona las concentraciones de las especies complejadas y no complejadas en solución. .
La constante de disociación se define como
Kd =
donde [L], [P] y [LP] representan concentraciones molares de la proteína, ligando y complejo, respectivamente.
Cuanto menor sea el valor de Kd, mayor será la afinidad de la proteína por el ligando y viceversa. El valor de K d es equivalente a la concentración del ligando en la que la mitad de las proteínas contienen ligando unido. [3] [8] La afinidad también está influenciada por las propiedades de la solución, como el pH , la temperatura y la concentración de sal, que pueden afectar el estado estable de las proteínas y ligandos y, por lo tanto, también su interacción, y por la presencia de otras macromoléculas que causan apiñamiento macromolecular . [9]
Los complejos proteína-ligando se pueden encontrar en casi cualquier proceso celular. La unión de un ligando provoca un cambio conformacional en la proteína y, a menudo, también en el ligando. Este cambio inicia una secuencia de eventos que conducen a diferentes funciones celulares. Los complejos están formados por diferentes moléculas como macromoléculas como en los complejos de proteínas, complejos de proteínas de ADN o proteínas de ARN , así como por proteínas que se unen a moléculas más pequeñas como péptidos , lípidos , carbohidratos y pequeños ácidos nucleicos . Pueden tener diversas funciones dentro de la célula: catálisis de reacciones químicas ( enzima -sustrato), defensa del organismo a través del sistema inmunológico ( complejos anticuerpo -antígeno ), transducción de señales (complejos receptor-ligando) que consiste en un receptor transmembrana que al unirse el ligando activa una cascada intracelular. Los complejos de receptores hormonales lipófilos pueden atravesar la membrana nuclear donde se puede regular la transcripción. [8]
El complejo proteína-ligando es esencial en muchos de los procesos celulares que ocurren dentro de los organismos. Uno de estos ejemplos es el receptor de glucagón (GCGR). El receptor de glucagón (GCGR) es una familia de receptores acoplados a proteína G ( GPCR ) en humanos que desempeña un papel importante en el mantenimiento de la concentración de glucosa en la sangre durante períodos de estado de baja energía. La unión del glucagón al GPCR provoca un cambio conformacional en el dominio intracelular, lo que permite la interacción con la proteína Gs heterotrimérica . La subunidad alfa de la proteína Gs libera el GDP unido y se une al GTP . El complejo subunidad alfa-GTP se disocia del dímero beta y gamma e interactúa con la adenilato ciclasa . La unión de la molécula de glucagón activa muchas subunidades alfa, lo que amplifica la señal hormonal. Luego, la subunidad alfa activa la adenilato ciclasa, que convierte el ATP en AMPc . La subunidad alfa se desactiva en cuestión de minutos hidrolizando GTP a GDP ( actividad GTPasa ). La subunidad alfa se reasocia con el dímero beta-gamma para formar un complejo inactivo. Una mejor comprensión de los mecanismos del complejo proteína-ligando puede permitirnos el tratamiento de algunas enfermedades como la diabetes tipo 2 . [10] Los inhibidores del receptor de glucagón son prometedores para el tratamiento de la diabetes tipo 2. [11] Los inhibidores de los receptores de glucagón son neutralizadores de glucagón o antagonistas moleculares pequeños, y todos se basan en el concepto de interacción compleja proteína-ligando. [11]
![{\displaystyle {\frac {[L][P]}{[LP]}}}](https://wikimedia.org/api/rest_v1/media/math/render/svg/f44181064627d411c7ab944c36423f0cbbedf2e7)
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