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Enfermedad común-variante común

La hipótesis de enfermedad común-variante común (a menudo abreviada CD-CV ) predice que se encontrarán alelos o variantes causantes de enfermedades comunes en todas las poblaciones humanas que manifiestan una enfermedad determinada. Se sabe que existen variantes comunes (no necesariamente causantes de enfermedades) en las secuencias codificantes y reguladoras de los genes. Según la hipótesis CD-CV, algunas de esas variantes conducen a la susceptibilidad a enfermedades poligénicas complejas. Cada variante en cada gen que influye en una enfermedad compleja tendrá un pequeño efecto aditivo o multiplicador en el fenotipo de la enfermedad. Estas enfermedades o rasgos son evolutivamente neutrales en parte porque muchos genes influyen en los rasgos. La hipótesis se ha mantenido en el caso de variantes causales putativas en la apolipoproteína E, incluida APOE ε4, asociada con la enfermedad de Alzheimer . [1] Se ha descubierto que IL23R está asociado con la enfermedad de Crohn ; el alelo en riesgo tiene una frecuencia del 93% en la población general [ cita requerida ] .

Una forma común de variación en los genomas humanos se denomina polimorfismo de un solo nucleótido (SNP). Como lo indica el nombre, los SNP son cambios de una sola base en el ADN. Las variantes de SNP tienden a ser comunes en diferentes poblaciones humanas. Estos polimorfismos han sido valiosos como indicadores genómicos, o "marcadores", en la búsqueda de variantes comunes que influyen en la susceptibilidad a enfermedades comunes. La investigación ha vinculado los SNP comunes a enfermedades como la diabetes tipo 2, el Alzheimer, la esquizofrenia y la hipertensión . [2] [3] [4] [5] [6]

Véase también

Referencias

  1. ^ Estudio genético ampliado de alta resolución de 109 familias suecas con enfermedad de Alzheimer, Anna Sillén, Jorge Andrade, Lena Lilius, Charlotte Forsell, Karin Axelman, Jacob Odeberg, Bengt Winblad y Caroline Graff, European Journal of Human Genetics (2008) 16, 202–208; doi :10.1038/sj.ejhg.5201946; publicado en línea el 24 de octubre de 2007
  2. ^ Duerr, RH; Taylor, KD; Brant, SR; Rioux, JD; Silverberg, MS; Daly, MJ ; Steinhart, AH; Abraham, C.; Regueiro, M.; Griffiths, A.; Dassopoulos, T.; Bitton, A.; Yang, H.; Targan, S.; Datta, LW; Kistner, EO; Schumm, LP; Lee, AT; Gregersen, PK; Barmada, MM; Rotter, JI; Nicolae, DL; Cho, JH (2006). "Un estudio de asociación de todo el genoma identifica IL23R como un gen de la enfermedad inflamatoria intestinal". Ciencia . 314 (5804): 1461–1463. Código bibliográfico : 2006 Ciencia... 314.1461D. doi : 10.1126/ciencia.1135245. 1998. ISSN  0036-8075. PMC 4410764. PMID  17068223. 
  3. ^ Levy, Daniel; Ehret, Georg B; Arroz, Kenneth; Verwoert, Germaine C; Launer, Lenore J; Dehghan, Abbas; Glazer, Nicole L; Morrison, Alanna C; Johnson, Andrew D; Aspelund, Thor; Aulchenko, Yurii; Lumley, Thomas; Köttgen, Anna; Vasan, Ramachandran S; Rivadeneira, Fernando; Eiriksdóttir, Gudny; Guo, Xiuqing; Arking, Dan E; Mitchell, Gary F; Mattace-Raso, Francesco EE.UU.; Smith, Alberto V; Taylor, Kent; Scharpf, Robert B; Hwang, Shih-Jen ; Sijbrands, Eric JG; Bis, Josué; Harris, Tamara B; Ganesh, Santhi K; O'Donnell, Christopher J; Hofman, Albert; Rotter, Jerónimo I; Coresh, Josef; Benjamín, Emelia J; Uitterlinden, André G; Heiss, Gerardo; Fox, Carolina S; Witteman, Jacqueline CM; Boerwinkle, Eric; Wang, Thomas J; Gudnason, Vilmundur; Larson, Martín G; Chakravarti, Aravinda; Psaty, Bruce M; van Duijn, Cornelia M (2009). "Estudio de asociación de todo el genoma de la presión arterial y la hipertensión". Genética de la Naturaleza . 41 (6): 677–687. doi :10.1038/ng.384. ISSN  1061-4036. PMC 2998712 . PMID  19430479. 
  4. ^ Storey, John D.; Raychaudhuri, Soumya; Plenge, Robert M.; Rossin, Elizabeth J.; Ng, Aylwin CY; Purcell, Shaun M.; Sklar, Pamela; Scolnick, Edward M.; Xavier, Ramnik J.; Altshuler, David; Daly, Mark J. (2009). "Identificación de relaciones entre regiones genómicas de enfermedades: predicción de genes en asociaciones de SNP patógenos y deleciones raras". PLOS Genetics . 5 (6): e1000534. doi : 10.1371/journal.pgen.1000534 . ISSN  1553-7404. PMC 2694358 . PMID  19557189. 
  5. ^ Seshadri, Sudha (2010). "Análisis de todo el genoma de loci genéticos asociados con la enfermedad de Alzheimer". JAMA . 303 (18): 1832–1840. doi :10.1001/jama.2010.574. ISSN  0098-7484. PMC 2989531 . PMID  20460622. 
  6. ^ Zeggini, Elefteria ; Scott, Laura J; Saxena, Richa; Voight, Benjamín F; Marchini, Jonathan L; Hu, Tianle; de Bakker, Paul IW; Abecasis, Gonçalo R; Almgren, Peter; Andersen, Gitte; Ardlie, Kristin; Boström, Kristina Bengtsson; Bergman, Richard N; Bonnycastle, Lori L; Borch-Johnsen, Knut; Burtt, Noël P; Chen, Hong; Chinos, Peter S; Daly, Mark J ; Deodhar, Parimal; Ding, Chia-Jen; Doney, Alex SF; Düren, William L; Elliott, Katherine S; Erdos, Michael R; Frayling, Timothy M; Freathy, Rachel M; Gianniny, Lauren; Grallert, Harald; Grarup, Niels; Arboledas, Christopher J; Guiducci, Candace; Hansen, Torben; Pastor, cristiano; Sicario, Graham A; Hughes, Thomas E; Isomaa, Bo; Jackson, Anne U; Jørgensen, Torben; Kong, Agustín; Kubalanza, Kari; Kuruvilla, Finny G; Kuusisto, Johanna; Langenberg, Claudia; Lango, Hana; Lauritzen, Torsten; Li, Yun; Lindgren, Cecilia M; Lyssenko, Valeriya; Marvelle, Amanda F; Meisinger, Christa; Midthjell, Kristian; Mohlke, Karen L; Morken, Mario A; Morris, Andrés D; Narisu, Narisu; Nilsson, Peter; Owen, Katharine R; Palmer, Colin NA; Payne, Felicidad; Perry, John RB; Pettersen, Elin; Platou, Carl; Prokopenko, Inga; Qi, Lu; Qin, Li; Rayner, Nigel W; Rees, Mateo; Roix, Jeffrey J; Sandbaek, Anelli; Escudos, Beverly; Sjögren, Marketa; Steinthorsdóttir, Valgerdur; Stringham, Heather M; Rápido, Amy J; Thorleifsson, Gudmar; Thorsteinsdóttir, Unnur; Timpson, Nicolás J; Tuomi, Tiinamaija; Tuomilehto, Jaakko; Caminante, marca; Watanabe, Richard M; Weedon, Michael N; Willer, Cristen J; Illig, Thomas; Hveem, Kristian; Hu, Frank B; Laakso, Markku; Stefansson, Kari; Pedersen, Oluf; Wareham, Nicolás J; Barroso, Inés; Hattersley, Andrew T; Collins, Francisco S; Grupo, Leif; McCarthy, Marco I; Boehnke, Michael; Altshuler, David (2008). "El metanálisis de datos de asociación de todo el genoma y la replicación a gran escala identifica loci de susceptibilidad adicionales para la diabetes tipo 2". Genética de la Naturaleza . 40 (5): 638–645. doi :10.1038/ng.120. ISSN  1061-4036. PMC 2672416 . PMID  18372903.