stringtranslate.com

Canalrodopsina conductora de aniones

estructura iChloC
Figura 1: Se necesitaron 5 mutaciones puntuales para crear iChloC a partir de canalrodopsina-2 conductora de cationes . [1]

Las canalrodopsinas conductoras de aniones son canales iónicos activados por la luz que se abren en respuesta a la luz y permiten que iones cargados negativamente (como el cloruro) entren en la célula. Todas las canalrodopsinas utilizan retina como pigmento sensible a la luz, pero difieren en su selectividad iónica. Las canalrodopsinas conductoras de aniones se utilizan como herramientas para manipular la actividad cerebral en ratones, moscas de la fruta y otros organismos modelo ( Optogenética ). Las neuronas que expresan canalrodopsinas conductoras de aniones se silencian cuando se iluminan con luz, un efecto que se ha utilizado para investigar el procesamiento de información en el cerebro. Por ejemplo, la supresión de los picos de calcio dendrítico en neuronas específicas con luz redujo la capacidad de los ratones para percibir un ligero toque en un bigote. [2] Estudiar cómo cambia el comportamiento de un animal cuando se silencian neuronas específicas permite a los científicos determinar el papel de estas neuronas en los complejos circuitos que controlan el comportamiento.

Las primeras canalrodopsinas conductoras de aniones se diseñaron a partir del canal activado por luz conductor de cationes, Canalrodopsina-2, eliminando aminoácidos cargados negativamente del poro del canal (Fig. 1). [3] Como el anión principal del líquido extracelular es el cloruro (Cl ), las canalrodopsinas conductoras de aniones también se conocen como “canalrodopsinas conductoras de cloruro” (ChloC). Posteriormente se identificaron canalrodopsinas conductoras de aniones (ACR) naturales en algas criptofitas . [4] [5] [6] La estructura cristalina del GtACR1 natural se ha resuelto recientemente, allanando el camino para una mayor ingeniería de proteínas. [7] [8]

Estructura de GtACR1 unido a bromuro (PDB: 7LE1). Los dos planos grises indican los límites de hidrocarburos de la bicapa lipídica y se calcularon con el algoritmo ANVIL. [9]

Variantes

Aplicaciones

Las canalrodopsinas conductoras de aniones (ACR) se han utilizado como herramientas optogenéticas para inhibir la activación neuronal. Cuando se expresan en las células nerviosas, los ACR actúan como canales de cloruro dependientes de la luz . Su efecto sobre la actividad de la neurona es comparable a los receptores GABA A , canales de cloruro activados por ligando que se encuentran en las sinapsis inhibidoras : como la concentración de cloruro en las neuronas maduras es muy baja, la iluminación produce un flujo hacia adentro de iones cargados negativamente, sujetando la neurona. al potencial de inversión del cloruro (- 65 mV). En estas condiciones, las entradas sinápticas excitadoras no pueden despolarizar eficientemente la neurona. Este efecto se conoce como inhibición de derivación (a diferencia de la inhibición por hiperpolarización ). La iluminación de la dendrita previene la generación de picos de calcio dendrítico, mientras que la iluminación de toda la neurona bloquea el inicio del potencial de acción en respuesta a la estimulación sensorial. [2] [1] Los terminales de los axones , sin embargo, tienen una mayor concentración de cloruro y, por lo tanto, son excitados por los ACR. [22] Para inhibir las neuronas con iluminación de campo amplio, ha demostrado ser útil restringir las ACR al compartimento somático (variantes ST). [17] [16]

Debido a su alta sensibilidad a la luz, los ACR pueden activarse con luz tenue que no interfiere con la estimulación visual, incluso en animales muy pequeños como la mosca de la fruta Drosophila . [14] Cuando se combinan con una canalrodopsina conductora de cationes sensible a la luz roja, los ACR permiten el control bidireccional de las neuronas: silenciamiento con luz azul, activación con luz roja ("Bipolos"). [23]

Otras lecturas

Neuron Review (2017): Silenciamiento de neuronas: herramientas, aplicaciones y limitaciones experimentales [24]

Lo más destacado de la investigación: una mejor manera de apagar las neuronas [25]

Perspectiva: Ampliación del conjunto de herramientas de optogenética [26]

Relacionado: Halorodopsina , una bomba de cloruro impulsada por luz

Referencias

  1. ^ abc Wietek, Jonas; Beltrámo, Ricardo; Scanziani, Massimo; Hegemann, Peter; Oertner, Thomas G.; Wiegert, J. Simon (7 de octubre de 2015). "Una canalrodopsina conductora de cloruro mejorada para la inhibición de la actividad neuronal inducida por la luz in vivo". Informes científicos . 5 : 14807. doi : 10.1038/srep14807. ISSN  2045-2322. PMC  4595828 . PMID  26443033.
  2. ^ abc Takahashi, Naoya; Oertner, Thomas G.; Hegemann, Peter; Larkum, Matthew E. (23 de diciembre de 2016). "Las dendritas corticales activas modulan la percepción". Ciencia . 354 (6319): 1587-1590. doi : 10.1126/ciencia.aah6066. ISSN  0036-8075. PMID  28008068. S2CID  28317052.
  3. ^ ab Wietek, Jonas; Wiegert, J. Simón; Adeishvili, Nona; Schneider, Franziska; Watanabe, Hiroshi; Tsunoda, Satoshi P.; Vogt, Arend; Elstner, Marco; Oertner, Thomas G.; Hegemann, Peter (25 de abril de 2014). "Conversión de canalrodopsina en un canal de cloruro activado por luz". Ciencia . 344 (6182): 409–412. doi : 10.1126/ciencia.1249375 . ISSN  0036-8075. PMID  24674867. S2CID  206554245.
  4. ^ abcGovorunova , Elena G.; Sineshchekov, Oleg A.; Janz, Roger; Liu, Xiaoqin; Spudich, John L. (7 de agosto de 2015). "Canales aniónicos activados por luz natural: una familia de rodopsinas microbianas para optogenética avanzada". Ciencia . 349 (6248): 647–650. doi : 10.1126/ciencia.aaa7484. ISSN  0036-8075. PMC 4764398 . PMID  26113638. 
  5. ^ ab Govorunova, Elena G.; Sineshchekov, Oleg A.; Rodarte, Elsa M.; Janz, Roger; Morelle, Olivier; Melkoniano, Michael; Wong, Gane K.-S.; Spudich, John L. (3 de marzo de 2017). "La familia en expansión de canalrodopsinas aniónicas naturales revela grandes variaciones en la cinética, la conductancia y la sensibilidad espectral". Informes científicos . 7 : 43358. doi : 10.1038/srep43358. ISSN  2045-2322. PMC 5335703 . PMID  28256618. 
  6. ^ abcGovorunova , Elena G.; Sineshchekov, Oleg A.; Hemmati, Raheleh; Janz, Roger; Morelle, Olivier; Melkoniano, Michael; Wong, Gane K.-S.; Spudich, John L. (1 de mayo de 2018). "Ampliación del dominio temporal del silenciamiento neuronal con canalrodopsinas aniónicas criptofitas". eNeuro . 5 (3): ENEURO.0174–18.2018. doi :10.1523/ENEURO.0174-18.2018. ISSN  2373-2822. PMC 6051594 . PMID  30027111. 
  7. ^ abc Kato, Hideaki E.; Kim, Yoon Seok; Paggi, José M.; Evans, Kathryn E.; Allen, William E.; Richardson, Claire; Inoue, Keiichi; Ito, Shota; Ramakrishnan, Charu (29 de agosto de 2018). "Mecanismos estructurales de selectividad y activación de canalrodopsinas aniónicas". Naturaleza . 561 (7723): 349–354. doi :10.1038/s41586-018-0504-5. ISSN  0028-0836. PMC 6317992 . PMID  30158697. 
  8. ^ Kim, Yoon Seok; Kato, Hideaki E.; Yamashita, Keitaro; Ito, Shota; Inoue, Keiichi; Ramakrishnan, Charu; Fenno, Lief E.; Evans, Kathryn E.; Paggi, José M. (29 de agosto de 2018). "Estructura cristalina de la canalrodopsina GtACR1 conductora de aniones naturales". Naturaleza . 561 (7723): 343–348. doi :10.1038/s41586-018-0511-6. ISSN  0028-0836. PMC 6340299 . PMID  30158696. 
  9. ^ Postic, Guillaume; Ghouzam, Yassine; Guiraud, Vicente; Gelly, Jean-Christophe (2016). "Posicionamiento de membranas para estructuras proteicas de alta y baja resolución mediante un enfoque de clasificación binaria". Ingeniería, Diseño y Selección de Proteínas . 29 (3): 87–91. doi : 10.1093/proteína/gzv063 . PMID  26685702.
  10. ^ Berndt, André; Lee, Soo Yeun; Ramakrishnan, Charu; Deisseroth, Karl (25 de abril de 2014). "Transformación guiada por la estructura de canalrodopsina en un canal de cloruro activado por luz". Ciencia . 344 (6182): 420–424. doi : 10.1126/ciencia.1252367. ISSN  0036-8075. PMC 4096039 . PMID  24763591. 
  11. ^ ab Berndt, André; Lee, Soo Yeun; Wietek, Jonás; Ramakrishnan, Charu; Steinberg, Elizabeth E.; Rashid, Asim J.; Kim, Hoseok; Parque, Sungmo; Santoro, Adán (26 de enero de 2016). "Fundamentos estructurales de la optogenética: determinantes de la selectividad del ion canalrodopsina". Procedimientos de la Academia Nacional de Ciencias . 113 (4): 822–829. doi : 10.1073/pnas.1523341113 . ISSN  0027-8424. PMC 4743797 . PMID  26699459. 
  12. ^ Chung, Shinjae; Weber, Franz; Zhong, Peng; Tan, Chan Lek; Nguyen, Thuc Nghi; Beier, Kevin T.; Hörmann, Nikolai; Chang, Wei-Cheng; Zhang, Zhe (2017). "Identificación de neuronas preópticas del sueño mediante etiquetado retrógrado y perfiles genéticos". Naturaleza . 545 (7655): 477–481. doi : 10.1038/naturaleza22350. PMC 5554302 . PMID  28514446. 
  13. ^ ab Mohammad, Farhan; Stewart, James C; Ott, Stanislav; Chlebikova, Katarina; Chua, Jia Yi; Koh, Tong-Wey; Ho, José; Claridge-Chang, Adam (2017). "Inhibición optogenética del comportamiento con canalrodopsinas aniónicas". Métodos de la naturaleza . 14 (3): 271–274. doi :10.1038/nmeth.4148. PMID  28114289. S2CID  4133602.
  14. ^ ab Mauss, Alex S.; Busch, cristiano; Borst, Alejandro (23 de octubre de 2017). "Silenciamiento neuronal optogenético en Drosophila durante el procesamiento visual". Informes científicos . 7 (1): 13823. doi :10.1038/s41598-017-14076-7. ISSN  2045-2322. PMC 5653863 . PMID  29061981. 
  15. ^ Govorunova, Elena G.; Cunha, Shane R.; Sineshchekov, Oleg A.; Spudich, John L. (15 de septiembre de 2016). "Canalrodopsinas aniónicas para optogenética cardíaca inhibidora". Informes científicos . 6 (1): 33530. doi : 10.1038/srep33530. ISSN  2045-2322. PMC 5024162 . PMID  27628215. 
  16. ^ ab Mardinly, Alan R.; Oldenburg, Ian Antón; Pégard, Nicolás C.; Sridharan, Savitha; Lyall, Evan H.; Chesnov, Kirill; Brohawn, Stephen G.; Waller, Laura; Adesnik, Hillel (30 de abril de 2018). "Control óptico multimodal preciso de la actividad del conjunto neuronal". Neurociencia de la Naturaleza . 21 (6): 881–893. doi :10.1038/s41593-018-0139-8. ISSN  1097-6256. PMC 5970968 . PMID  29713079. 
  17. ^ ab Mahn, Mathías; Gibor, Lihi; Malina, Katayun Cohen-Kashi; Patil, pritish; Printz, Yoav; Oring, Shir; Levy, Rivka; Lampl, Ilán; Yizhar, Ofer (2018). "Silenciamiento optogenético de alta eficiencia con canalrodopsinas conductoras de aniones dirigidas al soma". Comunicaciones de la naturaleza . 9 (1): 4125. doi : 10.1038/s41467-018-06511-8 . PMC 6175909 . PMID  30297821. 
  18. ^ Wietek, Jonás; Broser, Matías; Krause, Benjamín S.; Hegemann, Peter (19 de febrero de 2016). "Identificación de una canalrodopsina conductora de cloruro absorbente de luz verde natural de Proteomonas sulcata". Revista de Química Biológica . 291 (8): 4121–4127. doi : 10.1074/jbc.M115.699637 . ISSN  0021-9258. PMC 4759187 . PMID  26740624. 
  19. ^ Govorunova, Elena G.; Sineschekov, Oleg A.; Spudich, John L. (1 de febrero de 2016). "Proteomonas sulcata ACR1: una canalrodopsina aniónica rápida". Fotoquímica y Fotobiología . 92 (2): 257–263. doi :10.1111/php.12558. PMC 4914479 . PMID  26686819. 
  20. ^ ab Wietek, Jonas; Rodríguez-Rozada, Silvia; Tutas, Janine; Tenedini, Federico; Grimm, Christiane; Oertner, Thomas G.; Soba, Pedro; Hegemann, Peter; Wiegert, J. Simon (noviembre de 2017). "Canalrodopsinas conductoras de aniones con espectros sintonizados y cinética modificada diseñadas para la manipulación optogenética del comportamiento". Informes científicos . 7 (1): 14957. doi :10.1038/s41598-017-14330-y. ISSN  2045-2322. PMC 5668261 . PMID  29097684. 
  21. ^ Oppermann, Johannes; Fischer, Pablo; Silapetere, Arita; Liepe, Bernhard; Rodríguez-Rozada, Silvia; Flores-Uribe, José; Pedro, Enrique; Keidel, Anke; Vierock, Johannes; Kaufmann, Joel; Broser, Matías (25 de julio de 2019). "Sirenas: una familia de canalrodopsinas marinas intensamente desensibilizantes y conductoras de aniones marinas descubiertas metagenómicamente". Comunicaciones de la naturaleza . 10 (1): 3315. doi : 10.1038/s41467-019-11322-6. ISSN  2041-1723. PMC 6658528 . PMID  31346176. 
  22. ^ Mahn, Mathías; Prigge, Matías; Ron, Shiri; Levy, Rivka; Yizhar, Ofer (2016). "Limitaciones biofísicas de la inhibición optogenética en las terminales presinápticas". Neurociencia de la Naturaleza . 19 (4): 554–556. doi :10.1038/nn.4266. PMC 4926958 . PMID  26950004. 
  23. ^ Vierock, Johannes; Rodríguez-Rozada, Silvia; Dieter, Alejandro; Pieper, Florián; Sims, Rut; Tenedini, Federico; Bergs, Amelie CF; Bendifallah, Imane; Zhou, Fangmin; Zeitzschel, Nadja; Ahlbeck, Joachim (26 de julio de 2021). "BiPOLES es una herramienta optogenética desarrollada para el control bidireccional de neuronas de doble color". Comunicaciones de la naturaleza . 12 (1): 4527. doi : 10.1038/s41467-021-24759-5. ISSN  2041-1723. PMC 8313717 . PMID  34312384. 
  24. ^ Wiegert, J. Simón; Mahón, Mathías; Prigge, Matías; Printz, Yoav; Yizhar, Ofer (2017). "Silenciar neuronas: herramientas, aplicaciones y limitaciones experimentales". Neurona . 95 (3): 504–529. doi :10.1016/j.neuron.2017.06.050. PMC 5830081 . PMID  28772120. 
  25. ^ Evanko, Daniel (2014). "Neurociencia: una mejor manera de apagar las neuronas". Métodos de la naturaleza . 11 (6): 608. doi : 10.1038/nmeth.2988 . S2CID  1699434.
  26. ^ Berndt, André; Deisseroth, Karl (7 de agosto de 2015). "Ampliando el conjunto de herramientas de optogenética". Ciencia . 349 (6248): 590–591. doi : 10.1126/ciencia.aac7889. ISSN  0036-8075. PMC 4776750 . PMID  26250674.