APAF1

Proteína de mamífero encontrada en el Homo sapiens

El factor 1 activador de proteasa apoptótica , también conocido como APAF1 , es un homólogo humano del gen CED-4 de C. elegans . ^{[5] [6] [7]}

Función

La proteína fue identificada en el laboratorio de Xiaodong Wang como un activador de caspasa-3 en presencia de citocromoC y dATP. ^[8] Este gen codifica una proteína citoplasmática que forma uno de los centros centrales de la red reguladora de la apoptosis . Esta proteína contiene (desde el terminal N) un dominio de reclutamiento de caspasa ( CARD ), un dominio ATPasa (NB-ARC), algunos dominios helicoidales cortos y luego varias copias del dominio repetido WD40 . Al unirse al citocromo c y al dATP , esta proteína forma un apoptosoma oligomérico . El apoptosoma se une y escinde la proteína Procaspasa-9, liberando su forma madura y activada. El mecanismo preciso de esta reacción aún se debate, aunque un trabajo publicado por Guy Salvesen sugiere que el apoptosoma puede inducir la dimerización de la caspasa-9 y la posterior autocatálisis . ^[9] La caspasa-9 activada estimula la cascada de caspasas posterior que compromete a la célula a la apoptosis.

El empalme alternativo da como resultado varias variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas. ^[5]

Estructura

APAF1 contiene un dominio CARD con un motivo de clave griega compuesto por seis hélices, un dominio de unión de nucleótidos plegado de Rossman, un motivo helicoidal corto y un dominio de hélice alada. ^[10]

Interacciones

Se ha demostrado que APAF1 interactúa con:

• APIP , ^[11]
• Tipo BCL2 1 ^{[12] [13]}
• Caspasa-9 , ^{[14] [11] [15] [12] [13]}
• HSPA4 , ^[16] y
• NLRP1 . ^[14]

Referencias

1. GRCh38: Ensembl lanzamiento 89: ENSG00000120868 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl lanzamiento 89: ENSMUSG00000019979 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. "Entrez Gene: factor 1 activador de la peptidasa apoptótica APAF1".
6. Zou H, Henzel WJ, Liu X, Lutschg A, Wang X (agosto de 1997). "Apaf-1, una proteína humana homóloga a C. elegans CED-4, participa en la activación de caspasa-3 dependiente del citocromo c". Celúla . 90 (3): 405–13. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80501-2 . PMID  9267021. S2CID  18105320.
7. Kim H, Jung YK, Kwon YK, Park SH (1999). "Asignación del gen del factor 1 activador de proteasa apoptótica (APAF1) a la banda del cromosoma humano 12q23 mediante hibridación fluorescente in situ". Citogenética y genética celular . 87 (3–4): 252–3. doi :10.1159/000015436. PMID  10702682. S2CID  10377371.
8. Li P, Nijhawan D, Budihardjo I, Srinivasula SM, Ahmad M, Alnemri ES, Wang X (noviembre de 1997). "La formación del complejo Apaf-1 / caspasa-9 dependiente del citocromo c y dATP inicia una cascada de proteasas apoptóticas". Celúla . 91 (4): 479–89. doi : 10.1016/s0092-8674(00)80434-1 . PMID  9390557. S2CID  14321446.
9. Pop C, Timmer J, Sperandio S, Salvesen GS (abril de 2006). "El apoptosoma activa la caspasa-9 por dimerización". Célula molecular . 22 (2): 269–75. doi : 10.1016/j.molcel.2006.03.009 . PMID  16630894.
10. Riedl SJ, Li W, Chao Y, Schwarzenbacher R, Shi Y (abril de 2005). "Estructura del factor 1 activador de proteasa apoptótica unido al ADP". Naturaleza . 434 (7035): 926–33. Código Bib :2005Natur.434..926R. doi : 10.1038/naturaleza03465. PMID  15829969. S2CID  4355459.
11. Cho DH, Hong YM, Lee HJ, Woo HN, Pyo JO, Mak TW, Jung YK (septiembre de 2004). "Inhibición inducida de lesión isquémica/hipóxica por APIP, una nueva proteína que interactúa con Apaf-1". La Revista de Química Biológica . 279 (38): 39942–50. doi : 10.1074/jbc.M405747200 . PMID  15262985.
12. Hu Y, Benedict MA, Wu D, Inohara N, Núñez G (abril de 1998). "Bcl-XL interactúa con Apaf-1 e inhibe la activación de caspasa-9 dependiente de Apaf-1". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 95 (8): 4386–91. Código bibliográfico : 1998PNAS...95.4386H. doi : 10.1073/pnas.95.8.4386 . PMC 22498 . PMID  9539746. 
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14. Chu ZL, Pio F, Xie Z, Welsh K, Krajewska M, Krajewski S, Godzik A, Reed JC (marzo de 2001). "Un nuevo potenciador del apoptosoma Apaf1 implicado en la activación y apoptosis de caspasa dependiente del citocromo c". La Revista de Química Biológica . 276 (12): 9239–45. doi : 10.1074/jbc.M006309200 . PMID  11113115.
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16. Saleh A, Srinivasula SM, Balkir L, Robbins PD, Alnemri ES (agosto de 2000). "Regulación negativa del apoptosoma Apaf-1 por Hsp70". Biología celular de la naturaleza . 2 (8): 476–83. doi :10.1038/35019510. PMID  10934467. S2CID  20374981.

enlaces externos

• Ubicación del genoma humano APAF1 y página de detalles del gen APAF1 en el Navegador del genoma de UCSC .
• Descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : O14727 (Factor 1 activador de proteasa apoptótica) en el PDBe-KB .

Otras lecturas

• Smith TF, Gaitatzes C, Saxena K, Neer EJ (mayo de 1999). "La repetición WD: una arquitectura común para diversas funciones". Tendencias en Ciencias Bioquímicas . 24 (5): 181–5. doi : 10.1016/S0968-0004(99)01384-5 . PMID  10322433.
• van Oirschot JT (agosto de 1999). "Vacunas diva que reducen la transmisión de virus". Revista de Biotecnología . 73 (2–3): 195–205. doi :10.1016/S0168-1656(99)00121-2. PMID  10486928.
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