La numeración de los "Papas Juan" no sigue un orden numérico estricto. Aunque ha habido veintiún papas legítimos llamados Juan, la numeración llegó a XXIII debido a dos errores administrativos que se introdujeron en la Edad Media: primero, el antipapa Juan XVI se mantuvo en la secuencia numérica en lugar de eliminarse; luego, se omitió el número XX porque el Papa Juan XXI contó dos veces a Juan XIV .
El número XX se omitió debido a una confusión sobre Juan XIV (983–984), que resultó de un error en la transmisión textual de su entrada en el Liber Pontificalis . Esta entrada especificaba originalmente no sólo la duración de su pontificado ("VIII mens." = ocho meses), sino también la duración de su consiguiente encarcelamiento por parte del antipapa Bonifacio VII , "per IV menses" ("durante cuatro meses"). En el siglo XI, algún tiempo después del pontificado de Juan XIX , se interpretó erróneamente que esta entrada sobre Juan XIV se refería a dos "Papas Juan" diferentes, el primero que reinó durante ocho meses y que fue sucedido directamente por otro Juan que reinó durante cuatro meses:
Al distinguir a estos dos Juanes, el segundo pasó a denominarse "Iohannes XIV. bis" ("Juan XIV el segundo") y se confundió con un personaje histórico, el cardenal diácono Juan hijo de Roberto, que se opuso a Bonifacio VII después de Juan. Muerte del XIV. Dado que Juan XV a XIX parecía haber descuidado la existencia de Juan XIV "bis", Pedro Julião "corrigió" este "error" tomando el nombre de Juan XXI.
Dado que estos cálculos se descubrieron en el siglo XIX, los papas ahora se enumeran utilizando los números que utilizaron durante sus reinados. No existe un verdadero Juan XX. Sin embargo, los "Papas Juan XV" al "XIX" tienen números dobles del "XVI" al "XX" porque algunas fuentes ya habían utilizado la secuencia de numeración modificada. Juan XXI también tiene el doble número XX en obras más antiguas.
Durante el Cisma de Occidente , hubo dos pretendientes al papado. El Concilio de Pisa (1409) intentó poner fin al cisma eligiendo Papa a Alejandro V. Sin embargo, ni el antipapa de Aviñón ni el Papa romano estaban dispuestos a abdicar, por lo que ahora había tres pretendientes papales. El antipapa pisano Alejandro V fue sucedido por Juan XXIII , quien abdicó en 1415 como parte de un acuerdo para poner fin al cisma.
Hasta mediados del siglo XX, el Anuario Pontificio consideraba legítima la línea romana hasta 1409, seguida por la línea pisana hasta 1415. Los tres últimos papas del cisma figuraban como Gregorio XII (1406-1409), Alejandro V (1409-1409 ). 1410) y Juan XXIII (1410-1415). [7] Sin embargo, el Cisma de Occidente fue reinterpretado cuando el Papa Juan XXIII (1958-1963) decidió reutilizar el ordinal XXIII, citando "veintidós [sic] Juanes de legitimidad indiscutible". [8] Esto se refleja en las ediciones modernas del Anuario Pontificio , que extienden el reinado de Gregorio XII hasta 1415. Los papas pisanos Alejandro V y Juan XXIII ahora son considerados antipapas.