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Ciberinfraestructura comunitaria para la investigación y el análisis avanzados de la ecología microbiana

CAMERA , o Community Cyberinfrastructure for Advanced Microbial Ecology Research and Analysis , es un servicio de computación en la nube en línea que proporciona herramientas de software alojadas y una infraestructura informática de alto rendimiento para el análisis de datos metagenómicos . [1] [2] [3] El proyecto se anunció en enero de 2006 y se convirtió en el proyecto insignia de Calit2 . [4]

Misión

El proyecto tiene como objetivo acelerar la investigación genómica mediante la acumulación de un gran repositorio de datos metagenómicos generados por miembros independientes de la comunidad de investigación en general, mediante el desarrollo de un conjunto de herramientas bioinformáticas personalizadas optimizadas para la computación en clúster y ofreciendo la infraestructura informática de alto rendimiento en la que ejecutarlo. [5] [6]

CAMERA ayuda a los científicos a acceder y trabajar con datos de la Expedición Global de Muestreo de Océanos del Instituto Venter . [7] En 2007, su conjunto de datos GOS fue el más grande jamás publicado en el dominio público. [8] El grupo también coloca muchos otros conjuntos de datos para descargar en su sitio web. [9]

El proyecto está financiado por la Fundación Gordon y Betty Moore , que otorgó una subvención de investigación de 24,5 millones de dólares por siete años al proyecto CAMERA, a partir de enero de 2006. [10]

Historia

En sus inicios, la misión de CAMERA se centró en la investigación genómica de microorganismos marinos. Posteriormente, CAMERA amplió su misión para incluir la ecología terrestre y eliminó la palabra "marina" de su nombre original, "Ciberinfraestructura comunitaria para la investigación y el análisis avanzados de la ecología microbiana marina".

Gente

El liderazgo de CAMERA incluye: [11]

Véase también

Referencias

  1. ^ Sun, Shulei; Chen Jing; Li Weizhong; Altintas Ilkay; Lin Abel; Peltier Steve; Stocks Karen; Allen Eric E; Ellisman Mark; Grethe Jeffrey; Wooley John (enero de 2011). "Ciberinfraestructura comunitaria para la investigación y el análisis avanzados de la ecología microbiana: el recurso CAMERA". Nucleic Acids Res . 39 (número de la base de datos). Inglaterra: D546-51. doi :10.1093/nar/gkq1102 . PMC 3013694. PMID  21045053. sí 
  2. ^ PubMed Central: "CAMERA: un recurso comunitario para la metagenómica"
  3. ^ DOE Microbial Genomics: bases de datos del genoma microbiano Archivado el 6 de octubre de 2008 en Wayback Machine
  4. ^ Fundación Gordon y Betty Moore: Un destacado científico del Departamento de Energía en el campo del genoma dirigirá una iniciativa conjunta de ciberinfraestructura para la metagenómica microbiana marina (nota de prensa) Archivado el 20 de octubre de 2009 en Wayback Machine.
  5. ^ "CÁMARA: ¿Qué es CÁMARA?". Archivado desde el original el 23 de abril de 2012. Consultado el 8 de abril de 2012 .
  6. ^ "CAMERA: Conjuntos de datos de referencia". Archivado desde el original el 21 de abril de 2012. Consultado el 8 de abril de 2012 .
  7. ^ Anchorage Daily News: Un científico acecha a microbios astutos desde un velero [ enlace muerto permanente ]
  8. ^ Science Daily: Millones de nuevos genes y miles de nuevas familias de proteínas se encuentran en una expedición de muestreo oceánico (nota de prensa)
  9. ^ "CAMERA: Conjuntos de datos completos". Archivado desde el original el 21 de octubre de 2008. Consultado el 27 de septiembre de 2008 .
  10. ^ "CÁMARA: ¿Qué es CÁMARA?". Archivado desde el original el 26 de septiembre de 2008. Consultado el 27 de septiembre de 2008 .
  11. ^ "Acerca de CAMERA: People". Archivado desde el original el 29 de diciembre de 2012. Consultado el 8 de abril de 2012 .

Enlaces externos