Roxan (proteína)

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens.

RoXaN (proteína no estructural asociada al rotavirus 'X') también conocida como ZC3H7B (tipo CCCH con dedos de zinc que contiene 7B), es una proteína que en los humanos está codificada por el gen ZC3H7B . ^[5] RoXaN es una proteína que contiene repetición tetratricopeptídica y repetición leucina-aspartato, así como dominios de dedos de zinc . Esta proteína también interactúa con la proteína no estructural NSP3 del rotavirus . ^[5]

Función

Los ARNm de rotavirus están protegidos pero no poliadenilados , y las proteínas virales son traducidas por la maquinaria de traducción celular. Esto se logra mediante la acción de la proteína no estructural viral NSP3, que se une específicamente a la secuencia consenso 3' de los ARNm virales e interactúa con el factor de iniciación de la traducción eucariótica eIF4G I. ^[6]

RoXaN (proteína de rotavirus X asociada con NSP3 ) es una proteína celular de 110 kDa que contiene un mínimo de tres regiones que se prevé que estén involucradas en las interacciones proteína-proteína o ácido nucleico-proteína. En la región amino terminal está presente una región de repetición tetratricopeptídica , un dominio de interacción proteína-proteína que se encuentra con mayor frecuencia en complejos multiproteicos. En el extremo carboxi, se observan al menos cinco motivos de dedos de zinc , lo que sugiere además la capacidad de RoXaN para unirse a otras proteínas o ácidos nucleicos. Entre estas dos regiones existe un motivo repetido de paxilina leucina-aspartato (LD) que participa en las interacciones proteína-proteína. ^[6]

Significación clínica

RoXaN es capaz de interactuar con NSP3 in vivo y durante la infección por rotavirus. Los dominios de interacción corresponden al dominio de dimerización de NSP3 (aminoácidos 163 a 237) y al dominio LD de RoXaN (aminoácidos 244 a 341). La interacción entre NSP3 y RoXaN no perjudica la interacción entre NSP3 y eIF4G I, y se puede detectar un complejo ternario formado por NSP3, RoXaN y eIF4G I en células infectadas por rotavirus, lo que implica a RoXaN en la regulación de la traducción . ^[6]

Se encontró que la expresión de RoXaN se correlacionaba con una mayor graduación tumoral en GIST ( tumores del estroma gastrointestinal ). ^[7]

Referencias

1. GRCh38: Ensembl lanzamiento 89: ENSG00000100403 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl lanzamiento 89: ENSMUSG00000022390 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. "Entrez Gene: ZC3H7B tipo CCCH con dedo de zinc que contiene 7B".
6. Vitour D, Lindenbaum P, Vende P, Becker MM, Poncet D (abril de 2004). "RoXaN, una nueva proteína celular que contiene motivos de dedos de zinc, TPR y LD, forma un complejo ternario con el factor de iniciación eucariota 4G y el rotavirus NSP3". J. Virol . 78 (8): 3851–62. doi :10.1128/JVI.78.8.3851-3862.2004. PMC 374268 . PMID  15047801. 
7. Kang HJ, Koh KH, Yang E, You KT, Kim HJ, Paik YK, Kim H (febrero de 2006). "Proteínas expresadas diferencialmente en tumores del estroma gastrointestinal con mutaciones KIT y PDGFRA". Proteómica . 6 (4): 1151–7. doi :10.1002/pmic.200500372. PMID  16402362. S2CID  2780778.

Otras lecturas

• Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de la tapa de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gen.​ 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5'". Gen.​ 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
• Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K, et al. (junio de 1999). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XIV. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro". Investigación del ADN . 6 (3): 197–205. doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID  10470851.
• Dunham I, Shimizu N, Roe BA, et al. (Diciembre de 1999). "La secuencia de ADN del cromosoma 22 humano". Naturaleza . 402 (6761): 489–95. Código Bib :1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID  10591208.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (Marzo de 2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanos: secuenciación y análisis de 500 nuevos ADNc humanos que codifican proteínas completas". Investigación del genoma . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC  311072 . PMID  11230166.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (Diciembre de 2002). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 99 (26): 16899–903. Código bibliográfico : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (octubre de 2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc completo de los NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)". Investigación del genoma . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928 . PMID  15489334.
• Rush J, Moritz A, Lee KA, et al. (Enero de 2005). "Perfil de inmunoafinidad de la fosforilación de tirosina en células cancerosas". Biotecnología de la Naturaleza . 23 (1): 94-101. doi :10.1038/nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (mayo de 2006). "Una red de interacción proteína-proteína para ataxias hereditarias humanas y trastornos de la degeneración de las células de Purkinje". Celúla . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569.