La Universidad de Dole fue fundada en 1423 por Felipe el Bueno de Borgoña en Dole, en el condado libre de Borgoña (en aquel entonces un principado del Sacro Imperio Romano Germánico , pero ahora en Francia ). Se convirtió en una universidad líder en Europa occidental, históricamente notable por su enseñanza del derecho canónico y civil.
Desde su fundación, la universidad estuvo dirigida por estudiantes, siguiendo el modelo de Bolonia , pero en 1613 el colegio de profesores envió un delegado formal a los archiduques en Bruselas , buscando convertir la universidad en una Magisteruniversität como Lovaina y Douai . Los archiduques emitieron edictos (1616-1618) con esa intención, pero los estudiantes no lo aceptaron, repudiaron abiertamente los edictos y boicotearon la universidad. [1] Es probable que los edictos nunca se aplicaran.
En 1691 Luis XIV , que había conquistado la región en 1678, trasladó la universidad de Dole a Besançon , donde su sucesora se conoce hoy como la Universidad del Franco Condado .