Un gráfico de hidrofilicidad es un análisis cuantitativo del grado de hidrofobicidad o hidrofilicidad de los aminoácidos de una proteína . Se utiliza para caracterizar o identificar posibles estructuras o dominios de una proteína.
La gráfica muestra la secuencia de aminoácidos de una proteína en el eje x y el grado de hidrofobicidad e hidrofilicidad en el eje y . Existen varios métodos para medir el grado de interacción de solventes polares como el agua con aminoácidos específicos. Por ejemplo, la escala de Kyte-Doolittle indica aminoácidos hidrofóbicos, mientras que la escala de Hopp-Woods mide residuos hidrofílicos.
El análisis de la forma del gráfico proporciona información sobre la estructura parcial de la proteína. Por ejemplo, si un tramo de unos 20 aminoácidos muestra un resultado positivo en cuanto a hidrofobicidad, estos aminoácidos pueden ser parte de una hélice alfa que se extiende a lo largo de una bicapa lipídica , que está compuesta de ácidos grasos hidrófobos. Por el contrario, los aminoácidos con alta hidrofilicidad indican que estos residuos están en contacto con un disolvente o agua y que, por lo tanto, es probable que residan en la superficie externa de la proteína.
Los datos de la tabla anterior se generaron utilizando un programa de computadora que evalúa la hidrofobicidad promedio de los segmentos dentro de una proteína y utiliza datos recopilados de la literatura.