El Torneo Nacional por Invitación de 2006 fue la primera vez que el torneo fue planificado y operado por la NCAA , asumiendo el control después de 68 años bajo los auspicios de la Asociación Metropolitana Intercolegial de Baloncesto (MIBA). En el NIT de 2006 también se realizaron cambios en el proceso de selección, además de ser la primera vez que el NIT seleccionó a los participantes. [1] Los Gamecocks de Carolina del Sur ganaron su segundo título NIT consecutivo.
A continuación se muestran listas del equipo seleccionado para el torneo. Los equipos recibieron semillas por primera vez. [2]
A continuación se muestran los cuatro grupos del torneo, junto con el grupo de la ronda del campeonato de cuatro equipos. [2] También los mejores clasificados restantes fueron los anfitriones de los juegos.