Termoanaerobacteria

Género de bacterias

Thermoanaerobacter es un género del filo Bacillota ( Bacteria ). ^[1] Los miembros de este género son termófilos y anaeróbicos , varios de ellos fueron descritos previamente como especies de Clostridium y miembros de los géneros ahora obsoletos Acetogenium y Thermobacteroides ^{[2] [3]}

Etimología

El nombre Thermoanaerobacter deriva de: adjetivo
griego thermos (θερμός) , caliente; prefijo griego an (ἄν) , no; sustantivo griego aer, aeros (ἀήρ, ἀέρος) , aire; sustantivo neolatino de género masculino , bacter , que nominalmente significa "una varilla", pero en realidad significa una bacteria, varilla; sustantivo neolatino de género masculino Thermoanaerobacter , varilla que crece en ausencia de aire a temperaturas elevadas. ^[4]

Especies

El género contiene 15 especies, a saber: ^[4]

• T. acetoethylicus (Ben-Bassat y Zeikus 1983) Rainey y Stackebrandt 1993 (sustantivo latino acetum , vinagre;adjetivo neolatino ethylicus , perteneciente al alcohol etílico;adjetivo neolatino de género masculino acetoethylicus , destinado a significar que produce ácido acético y etanol). Esta especie, anteriormente conocida como Thermobacteroides acetoethylicus , solía ser la especie tipo de Thermobacteroides , pero fue transferida al género Thermoanaerobacter , mientras que el otro miembro del género Thermobacteroides , Thermobacteroides proteolyticus, fue reclasificado como Coprothermobacter proteolyticus ^[3]
• T. brockii (Zeikus et al . 1983) Lee et al . 1993 (sustantivo en caso genitivo neolatino brockii , de Brock, llamado así por Thomas Dale Brock , quien fue pionero en los estudios sobre la fisiología y ecología de los termófilos ). Esta especie se conocía anteriormente como Thermoanaerobium brockii ^{[5] [6]}
• T. ethanolicus Wiegel y Ljungdahl 1982 (especie tipo del género;sustantivo neolatino ethanol , etanol;  sufijo de género masculino latino - icus , sufijo usado con el sentido de perteneciente a;adjetivo de género masculino neolatino ethanolicus , que indica la producción de etanol.) ^[7]
• " T. inferii " Orlygsson y Beck 2007
• T. italicus Kozianowski et al . 1998 (adjetivo latino de género masculino italicus , perteneciente a Italia, donde se aisló el organismo). ^[8]
• " T. keratinophilus " Riesen y Antranikian 2001
• T. kivui (Leigh y Wolfe 1983) Collins et al . 1994 (sustantivo en caso genitivo neolatino kivui , perteneciente a Kivu, llamado así por su origen, el lago Kivu). Esta especie solía conocerse como Acetogenium kivui (único miembro del género anterior) antes de ser transferida a este género ^[9].
• T. mathranii Larsen et al . 1998 (sustantivo en caso genitivo neolatino mathranii , de Mathrani, en honor al difunto Indra M. Mathrani, quien contribuyó a la comprensión de los anaerobios termófilos de las fuentes termales durante su corta carrera). ^{[10] [11]}
• T. pentosaceus Tomás, Karakashev y Angelidaki 2013 ^[12]
• T. pseudethanolicus Onyenwoke et al . 2007 (adjetivo griego  pseudēs , falso;adjetivo neolatino ethanolicus , un epíteto específico de una bacteria;adjetivo neolatino de género masculino pseudethanolicus , un falso ( Thermoanaerobacter ) ethanolicus .) ^[13]
• T. siderophilus Slobodkin et al . 1999 (sustantivo griego sideros , hierro;adjetivo neolatino philus deladjetivo griego philos (φίλος) que significa amigo, cariñoso;adjetivo neolatino de género masculino siderophilus , amante del hierro.) ^[14]
• T. sulfurigignens Lee et al . 2007 ( sustantivo latino sulfur , azufre; adjetivo participio latino gignens , productor; adjetivo participio neolatino sulfurigignens , productor de azufre). ^[15]
• T. sulfurophilus Bonch-Osmolovskaya 1998 ( sustantivo latino sulfur , azufre; adjetivo neolatino philus del adjetivo griego philos (φίλος) que significa amigo, cariñoso; adjetivo neolatino de género masculino sulfurophilus , que gusta del azufre elemental.) ^[16]
• T. thermocopriae (Jin, Yamasato y Toda 1988) Collins et al . 1994 (sustantivo griego thermē (θέρμη) , calor;sustantivo griego kopria , estercolero;sustantivo genitivo neolatino thermocopriae , de abono térmico.) Esta especie se conocía anteriormente como Clostridium thermocopriae ^[9]
• T. thermohydrosulfuricus (Klaushofer y Parkkinen 1965) Lee et al . 1993 ( adjetivo griego thermos (θερμός) , caliente; adjetivo de género masculino neolatino hydrosulfuricus , perteneciente al sulfuro de hidrógeno; adjetivo de género masculino neolatino thermohydrosulfuricus , que indica que el organismo crece a altas temperaturas y reduce el sulfito a H ₂ S.), esta especie también solía ser Clostridium thermohydrosulfuricum ^[6]
• T. uzonensis Wagner et al . 2008 ( adjetivo de género masculino neolatino uzonensis , perteneciente a la caldera de Uzon, Kamchatka, Lejano Oriente de Rusia). ^[17]
• T. wiegelii Cook et al . 1996 ( sustantivo neolatino en caso genitivo wiegelii , de Juergen Wiegel, en reconocimiento a sus contribuciones al estudio de los anaerobios termófilos). ^[18]

Tres antiguos miembros de este género, T. subterraneus , T. tengcongensis y T. yonseiensis , fueron reclasificados como subespecies de Caldanaerobacter subterraneus ^[19].

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) ^[20] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) ^[21].

Véase también

• Taxonomía bacteriana
• Microbiología
• Lista de órdenes bacterianos
• Lista de géneros de bacterias

Referencias

1. Clasificación del género Thermoanaerobacter en LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 de noviembre de 2020). "La lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) se traslada al DSMZ". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
2. Collins, MD; Lawson, PA; Willems, A; et al. (1994). "La filogenia del género Clostridium: propuesta de cinco nuevos géneros y once nuevas combinaciones de especies". Int. J. Syst. Bacteriol . 44 (4): 812–26. doi : 10.1099/00207713-44-4-812 . PMID  7981107.
3. Rainey, FA; Stackebrandt, E. (1993). "Transferencia de la especie tipo del género Thermobacteroides al género Thermoanaerobacter como Thermoanaerobacter acetoethylicus (Ben-Bassat y Zeikus 1981) comb. nov., descripción de Coprothermobacter gen. nov., y reclasificación de Thermobacteroides proteolyticus como Coprothermobacter proteolyticus (Ollivier et al. 1985) comb. nov". Int. J. Syst. Bacteriol . 43 (4): 857–859. doi : 10.1099/00207713-43-4-857 .
4. Thermoanaerobacter en LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 de noviembre de 2020). "La lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) se traslada al DSMZ". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
5. Zeikus, JG; Hegge, PW; Anderson, MA (1979). "Thermoanaerobium brockii gen. nov. y sp. nov., una nueva bacteria anaerobia, caldoactiva y quimioorganotrófica". Archivos de Microbiología . 122 (1): 41–48. doi :10.1007/BF00408044.
6. Lee, YE; Jain, MK; Lee, C.; Lowe, SE; Zeikus, JG (1993). "Distinción taxonómica de anaerobios termófilos sacarolíticos: descripción de Thermoanaerobacterium xylanolyticum gen. nov., sp. nov., y Thermoanaerobacterium saccharolyticum gen. nov., sp. nov.; reclasificación de Thermoanaerobium brockii, Clostridium thermosulfurogenes y Clostridium thermohydrosulfuricum E100-69 como Thermoanaerobacter brockii comb. nov., Thermoanaerobacterium thermosulfurigenes comb. nov., y Thermoanaerobacter thermohydrosulfuricus comb. nov., respectivamente; y transferencia de Clostridium thermohydrosulfuricum 39E a Thermoanaerobacter ethanolicus". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 43 (1): 41–51. doi :10.1099/00207713-43-1-41.
7. Wiegel, JR; Ljungdahl, LG (1981). "Thermoanaerobacter ethanolicus gen. Nov., spec. Nov., una nueva bacteria anaerobia extremadamente termófila". Archivos de Microbiología . 128 (4): 343–348. doi :10.1007/BF00405910.
8. Kozianowski, G.; Canganella, F.; Rainey, FA; Hippe, H.; Antranikian, G. (1997). "Purificación y caracterización de pectato-liasas termoestables de una bacteria termófila recientemente aislada, Thermoanaerobacter italicus sp. Nov". Extremófilos . 1 (4): 171–182. doi :10.1007/s007920050031. PMID  9680298.
9. Collins, MD; Lawson, PA; Willems, A.; Cordoba, JJ; Fernandez-Garayzabal, J.; Garcia, P.; Cai, J.; Hippe, H.; Farrow, JAE (1994). "La filogenia del género Clostridium: propuesta de cinco nuevos géneros y once nuevas combinaciones de especies". Revista internacional de bacteriología sistemática . 44 (4): 812–826. doi : 10.1099/00207713-44-4-812 . ISSN  0020-7713. PMID  7981107.
10. Larsen, L.; Nielsen, P.; Ahring, BK (1997). "Thermoanaerobacter mathranii sp. nov., una bacteria anaeróbica extremadamente termófila productora de etanol de una fuente termal en Islandia". Archivos de Microbiología . 168 (2): 114–119. doi :10.1007/s002030050476. PMID  9238102.
11. "Lista de nuevos nombres y nuevas combinaciones publicadas previamente de forma efectiva, pero no válida". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 57 (Pt 1): 1. 2007. doi : 10.1099/ijs.0.64923-0 . PMID  17220429.
12. Tomás, AF; Karakashev, D.; Angelidaki, I. (2013). "Thermoanaerobacter pentosaceus sp. nov., una bacteria anaeróbica, extremadamente termófila y con alto rendimiento de etanol aislada de desechos domésticos". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 63 (7): 2396–2404. doi :10.1099/ijs.0.045211-0. PMID  23178727.
13. Onyenwoke, RU; Kevbrin, VV; Lysenko, AM; Wiegel, J. (2007). "Thermoanaerobacter pseudethanolicus sp. nov., un anaerobio heterotrófico termófilo del Parque Nacional de Yellowstone". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 57 (10): 2191–2193. doi : 10.1099/ijs.0.65051-0 . PMID  17911280.
14. Slobodkin, AI; Tourova, TP; Kuznetsov, BB; Kostrikina, NA; Chernyh, NA; Bonch-Osmolovskaya, EA (1999). "Thermoanaerobacter siderophilus sp. nov., una nueva bacteria termófila, anaeróbica, reductora de Fe(III) desasimiladora". Revista Internacional de Bacteriología Sistemática . 49 (4): 1471–1478. doi : 10.1099/00207713-49-4-1471 . PMID  10555328.
15. Lee, Y. -J.; Dashti, M.; Prange, A.; Rainey, FA; Rohde, M.; Whitman, WB; Wiegel, J. (2007). "Thermoanaerobacter sulfurigignens sp. nov., una bacteria termófila anaeróbica que reduce 1 M de tiosulfato a azufre elemental y tolera 90 mM de sulfito". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 57 (7): 1429–1434. doi : 10.1099/ijs.0.64748-0 . PMID  17625170.
16. Bonch-Osmolovskaya, EA; Miroshnichenko, ML; Chernykh, NA; Kostrikina, NA; Pikuta, EV; Rainey, FA (1997). "Reducción de azufre elemental por bacterias organotróficas moderadamente termófilas y la descripción de Thermoanaerobacter sulfurophilus sp. nov". Microbiología . 66 : 483–489.
17. Wagner, ID; Zhao, W.; Zhang, CL; Romanek, CS; Rohde, M.; Wiegel, J. (2008). "Thermoanaerobacter uzonensis sp. nov., una bacteria termófila anaeróbica aislada de una fuente termal dentro de la caldera de Uzon, Kamchatka, extremo oriente de Rusia". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 58 (11): 2565–2573. doi : 10.1099/ijs.0.65343-0 . PMID  18984694.
18. Cook, GM; Rainey, FA; Patel, BKC; Morgan, HW (1996). "Caracterización de un nuevo termófilo anaeróbico obligado, Thermoanaerobacter wiegelii sp. nov". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 46 (1): 123–127. doi : 10.1099/00207713-46-1-123 . PMID  8573487.
19. Fardeau, M.; Salinas, M.; L'Haridon, S.; Jeanthon, C.; Verhé, F.; Cayol, J.; Patel, B.; Garcia, J.; Ollivier, B. (2004). "Aislamiento de nuevos anaerobios termófilos filogenéticamente relacionados con Thermoanaerobacter subterraneus a partir de yacimientos de petróleo: reasignación de T. subterraneus, Thermoanaerobacter yonseiensis, Thermoanaerobacter tengcongensis y Carboxydibrachium pacificum a Caldanaerobacter subterraneus gen. nov., sp. nov., comb. nov. como cuatro nuevas subespecies". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 54 (2): 467–474. doi : 10.1099/ijs.0.02711-0 . Número de modelo  : PMID15023962.
20. JP Euzéby. "Thermoanaerobacter". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 9 de septiembre de 2022 .
21. Sayers; et al. "Thermoanaerobacter". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 9 de septiembre de 2022 .
22. "El LTP" . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
23. "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
24. "Notas de la versión LTP_08_2023" (PDF) . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
25. "GTDB release 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
26. "bac120_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
27. "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .