Especies de arqueón
Thermococcus kodakarensis es una especie de arquea termófila . La cepa tipo T. kodakarensis KOD1 es uno de los miembros del género mejor estudiados . [2]
Historia
T. kodakarensis fue aislado de una solfatara cerca de la costa de la isla Kodakara , Kagoshima , Japón. [3] El aislado fue originalmente llamado Pyrococcus kodakarensis KOD1, pero reclasificó como una especie de Thermococcus , basándose en la secuencia de ARNr 16S . [1] Las primeras investigaciones con T. kodakarensis se dirigieron principalmente a sus enzimas termoestables (como la ADN polimerasa KOD ), pero su relativa facilidad de manejo y manipulación genética facilitada por la competencia natural lo ha convertido en un sistema atractivo para el estudio de varios procesos biológicos. [4] [5]
Propiedades
Las células de T. kodakarensis son cocos irregulares de 1 a 2 μm de diámetro, que a menudo se presentan en pares y son altamente móviles por medio de arqueas lofótricas . La pared celular consta de una capa de lípidos diéter y tetraéter, y una capa externa de glicoproteína . [1] [3] T. kodakarensis es un anaerobio obligado y un heterótrofo , que crece rápidamente en una variedad de sustratos orgánicos en presencia de azufre elemental , produciendo gas de sulfuro de hidrógeno . El tiempo de generación se estima en 40 minutos en condiciones óptimas. [3] El requisito de azufre elemental se alivia cuando se usa piruvato o almidón para el crecimiento. En ausencia de azufre, se produce hidrógeno en lugar de sulfuro de hidrógeno. [1] El crecimiento es posible a temperaturas que varían de 60 a 100 °C, con un óptimo a 85 °C. [1] Al igual que otros organismos marinos, se requieren altas concentraciones de sal para un crecimiento óptimo, y la lisis celular puede ocurrir en soluciones diluidas.
Genoma
En 2005 se secuenció por completo el genoma de T. kodakarensis KOD1. El genoma consta de un único cromosoma circular de 2.088.737 pares de bases, que codifica unas 2306 proteínas. [6]
Véase también
Referencias
- ^ abcde Atomi H, Fukui T, Kanai T, Morikawa M, Imanaka T (octubre de 2004). "Descripción de Thermococcus kodakaraensis sp. nov., una arquea hipertermófila bien estudiada y previamente reportada como Pyrococcus sp. KOD1". Archaea . 1 (4): 263–7. doi : 10.1155/2004/204953 . PMC 2685570 . PMID 15810436.
- ^ Atomi H, Reeve J (noviembre de 2019). "Perfil microbiano: Thermococcus kodakarensis: el modelo de arquea hipertermófila". Microbiología . 165 (11): 1166–1168. doi : 10.1099/mic.0.000839 . PMC 7137780 . PMID 31436525.
- ^ abc Morikawa M, Izawa Y, Rashid N, Hoaki T, Imanaka T (diciembre de 1994). "Purificación y caracterización de una tiol proteasa termoestable de una especie de Pyrococcus sp hipertermófila recientemente aislada". Applied and Environmental Microbiology . 60 (12): 4559–66. doi :10.1128/aem.60.12.4559-4566.1994. PMC 202019 . PMID 7811092.
- ^ Sato T, Fukui T, Atomi H, Imanaka T (enero de 2003). "Alteración genética dirigida por recombinación homóloga en el arqueón hipertermófilo Thermococcus kodakaraensis KOD1". Revista de Bacteriología . 185 (1): 210–20. doi :10.1128/JB.185.1.210-220.2003. PMC 141832 . PMID 12486058.
- ^ Sato T, Fukui T, Atomi H, Imanaka T (julio de 2005). "Sistema de transformación mejorado y versátil que permite múltiples manipulaciones genéticas de la arquea hipertermófila Thermococcus kodakaraensis". Applied and Environmental Microbiology . 71 (7): 3889–99. doi :10.1128/AEM.71.7.3889-3899.2005. PMC 1169065 . PMID 16000802.
- ^ Fukui T, Atomi H, Kanai T, Matsumi R, Fujiwara S, Imanaka T (marzo de 2005). "Secuencia completa del genoma de la arquea hipertermófila Thermococcus kodakaraensis KOD1 y comparación con genomas de Pyrococcus". Genome Research . 15 (3): 352–63. doi :10.1101/gr.3003105. PMC 551561 . PMID 15710748.
Lectura adicional
- Elshawadfy AM, Keith BJ, Ee Ooi H, Kinsman T, Heslop P, Connolly BA (27 de mayo de 2014). "Híbridos de ADN polimerasa derivados de las enzimas de la familia B de Pyrococcus furiosus y Thermococcus kodakarensis: mejora del rendimiento en la reacción en cadena de la polimerasa". Frontiers in Microbiology . 5 (224): 224. doi : 10.3389/fmicb.2014.00224 . PMC 4034419 . PMID 24904539.
- Hwa KY, Subramani B, Shen ST, Lee YM (septiembre de 2014). "Se requiere un enlace disulfuro intermolecular para la termoestabilidad y termoactividad de la β-glicosidasa de Thermococcus kodakarensis KOD1". Applied Microbiology and Biotechnology . 98 (18): 7825–36. doi :10.1007/s00253-014-5731-6. PMID 24728717. S2CID 9812474.
- Kishimoto A, Kita A, Ishibashi T, Tomita H, Yokooji Y, Imanaka T, et al. (septiembre de 2014). "Estructura cristalina de la fosfopantotenato sintetasa de Thermococcus kodakarensis". Proteínas . 82 (9): 1924–36. doi :10.1002/prot.24546. PMID 24638914. S2CID 23549563.