stringtranslate.com

TAF1

El factor de iniciación de la transcripción TFIID subunidad 1 , también conocido como factor de iniciación de la transcripción TFIID subunidad 250 kDa (TAFII-250) o factor asociado a TBP 250 kDa (p250), es una proteína que en los humanos está codificada por el gen TAF1 . [5] [6]

Función

La iniciación de la transcripción por la ARN polimerasa II requiere las actividades de más de 70 polipéptidos. La proteína que coordina estas actividades es el factor de transcripción basal TFIID , que se une al promotor central para posicionar adecuadamente la polimerasa, sirve como andamio para el ensamblaje del resto del complejo de transcripción y actúa como un canal para señales reguladoras. TFIID está compuesto por la proteína de unión a TATA ( TBP ) y un grupo de proteínas conservadas evolutivamente conocidas como factores asociados a TBP o TAF. Los TAF pueden participar en la transcripción basal, servir como coactivadores , funcionar en el reconocimiento del promotor o modificar los factores de transcripción generales (GTF) para facilitar el ensamblaje complejo y la iniciación de la transcripción. Este gen codifica la subunidad más grande de TFIID. Esta subunidad se une a las secuencias promotoras centrales que abarcan el sitio de inicio de la transcripción. También se une a activadores y otros reguladores transcripcionales, y estas interacciones afectan la tasa de iniciación de la transcripción. Esta subunidad contiene dos dominios de proteína quinasa independientes en los extremos N y C, pero también posee actividad de acetiltransferasa y puede actuar como enzima activadora/conjugadora de ubiquitina . Se han identificado dos transcripciones que codifican diferentes isoformas para este gen. [5] Las histonas suelen acetilarse para abrir el ADN para la transcripción. TAF1 contiene dos bromodominios, cada uno de los cuales puede unirse a uno de los dos residuos de acetillisina en la posición 5 y 12 en la cola H4, para estabilizar el complejo de caja TBP-TATA.

Importancia clínica

Se identificó una mutación en TAF1 que contribuye a un fenotipo con discapacidad intelectual (DI) grave, un pliegue interglúteo característico y rasgos faciales distintivos, que incluyen una nariz ancha y respingada, mejillas caídas, fisuras palpebrales inclinadas hacia abajo, crestas periorbitales prominentes, ojos hundidos, hipertelorismo relativo, labio superior delgado, paladar muy arqueado, orejas prominentes con hélices engrosadas y un mentón puntiagudo [7] [8] Este es un cambio no sinónimo en TAF1 que resulta en un cambio de isoleucina (hidrofóbica) a treonina (polar) en el residuo de aminoácido 1337 en la proteína (NP_001273003.1). Se informaron otras dos mutaciones en TAF1 en dos familias con discapacidad intelectual, aunque no se informaron más detalles clínicos. [9]

Interacciones

Se ha demostrado que TAF1 interactúa con:

Véase también


Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000147133 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000031314 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ ab "Entrez Gene: TAF1 TAF1 ARN polimerasa II, factor asociado a la proteína de unión a la caja TATA (TBP), 250 kDa".
  6. ^ Sekiguchi T, Yoshida MC, Sekiguchi M, Nishimoto T (abril de 1987). "Aislamiento de un gen humano ligado al cromosoma X esencial para la progresión de la fase G1 a la fase S del ciclo celular". Exp. Cell Res . 169 (2): 395–407. doi :10.1016/0014-4827(87)90200-X. PMID  3556424.
  7. ^ He M, Person TN, Hebbring SJ, Heinzen E, Ye Z, Schrodi SJ, McPherson EW, Lin SM, Peissig PL, Brilliant MH, O'Rawe J, Robison RJ, Lyon GJ, Wang K (enero de 2015). "SeqHBase: un conjunto de herramientas de big data para el análisis de datos de secuenciación basados ​​en la familia". Journal of Medical Genetics . 52 (4): 282–8. doi :10.1136/jmedgenet-2014-102907. PMC 4382803 . PMID  25587064. 
  8. ^ O'Rawe JA, Wu Y, Dörfel MJ, Rope AF, Au PY, Parboosingh JS, Moon S, Kousi M, Kosma K, Smith CS, Tzetis M, Schuette JL, Hufnagel RB, Prada CE, Martinez F, Orellana C , Crain J, Caro-Llopis A, Oltra S, Monfort S, Jiménez-Barrón LT, Swensen J, Ellingwood S, Smith R, Fang H, Ospina S, Stegmann S, Den Hollander N, Mittelman D, Highnam G, Robison R, Yang E, Faivre L, Roubertie A, Rivière JB, Monaghan KG, Wang K, Davis EE, Katsanis N, Kalscheuer VM , Wang EH, Metcalfe K, Kleefstra T, Innes AM, Kitsiou-Tzeli S, Roselló M, Keegan CE, Lyon GJ (2015). "Una variante en TAF1 se asocia con un nuevo síndrome con discapacidad intelectual grave y rasgos dismórficos característicos". The American Journal of Human Genetics . 97 (6): 922–932. doi :10.1016/j.ajhg.2015.11 .005. PMC 4678794 . PMID  26637982. 
  9. ^ Hu H, Haas SA, Chelly J, Van Esch H, Raynaud M, de Brouwer AP, Weinert S, Froyen G, Frints SG, Laumonnier F, Zemojtel T, Love MI, Richard H, Emde AK, Bienek M, Jensen C , Hambrock M, Fischer U, Langnick C, Feldkamp M, Wissink-Lindhout W, Lebrun N, Castelnau L, Rucci J, Montjean R, Dorseuil O, Billuart P, Stuhlmann T, Shaw M, Corbett MA, Gardner A, Willis-Owen S, Tan C, Friend KL, Belet S, van Roozendaal KE, Jiménez-Pocquet M, Moizard MP, Ronce N, Sun R, O'Keeffe S, Chenna R, van Bömmel A, Göke J, Hackett A, Field M, Christie L, Boyle J, Haan E, Nelson J, Turner G, Baynam G, Gillessen-Kaesbach G, Müller U, Steinberger D, Budny B, Badura-Stronka M, Latos-Bieleńska A, Ousager LB, Wieacker P, Rodríguez Criado G, Bondeson ML, Annerén G, Dufke A, Cohen M, Van Maldergem L, Vincent-Delorme C, Echenne B, Simon-Bouy B, Kleefstra T, Willemsen M, Fryns JP, Devriendt K, Ullmann R, Vingron M, Wrogemann K, Wienker TF, Tzschach A, van Bokhoven H, Gecz J, Jentsch TJ, Chen W, Ropers HH, Kalscheuer VM (febrero de 2015) ). "La secuenciación del exoma X de 405 familias no resueltas identifica siete nuevos genes de discapacidad intelectual" (PDF) . Psiquiatría molecular . 21 (1): 133–48. doi :10.1038/mp.2014.193. PMC 5414091 . PMID  25644381. 
  10. ^ Allende-Vega N, McKenzie L, Meek D (septiembre de 2008). "El factor de transcripción TAFII250 fosforila el dominio ácido de Mdm2 mediante el reclutamiento de la proteína quinasa CK2". Mol. Cell. Biochem . 316 (1–2): 99–106. doi :10.1007/s11010-008-9816-3. PMID  18548200. S2CID  25685775.
  11. ^ Adnane J, Shao Z, Robbins PD (enero de 1999). "La ciclina D1 se asocia con el factor TAF(II)250 asociado a TBP para regular la transcripción mediada por Sp1". Oncogene . 18 (1): 239–47. doi : 10.1038/sj.onc.1202297 . PMID  9926939.
  12. ^ ab Siegert JL, Rushton JJ, Sellers WR, Kaelin WG, Robbins PD (noviembre de 2000). "La ciclina D1 suprime la inhibición de la actividad de la quinasa TAFII250 mediada por la proteína del retinoblastoma". Oncogene . 19 (50): 5703–11. doi : 10.1038/sj.onc.1203966 . PMID  11126356.
  13. ^ abc Siegert JL, Robbins PD (enero de 1999). "Rb inhibe la actividad quinasa intrínseca del factor asociado a la proteína de unión a TATA TAFII250". Mol. Cell. Biol . 19 (1): 846–54. doi :10.1128/MCB.19.1.846. PMC 83941. PMID  9858607 . 
  14. ^ Dikstein R, Ruppert S, Tjian R (marzo de 1996). "TAFII250 es una proteína quinasa bipartita que fosforila el factor de transcripción básico RAP74". Cell . 84 (5): 781–90. doi : 10.1016/s0092-8674(00)81055-7 . PMID  8625415.
  15. ^ Ruppert S, Tjian R (noviembre de 1995). "TAFII250 humano interactúa con RAP74: implicaciones para la iniciación de la ARN polimerasa II". Genes Dev . 9 (22): 2747–55. doi : 10.1101/gad.9.22.2747 . PMID  7590250.
  16. ^ Malik S, Guermah M, Roeder RG (marzo de 1998). "Un modelo dinámico para la función del coactivador de PC4 en la transcripción de la ARN polimerasa II". Proc. Natl. Sci. USA . 95 (5): 2192–7. Bibcode :1998PNAS...95.2192M. doi : 10.1073/pnas.95.5.2192 . PMC 19292 . PMID  9482861. 
  17. ^ Shao Z, Ruppert S, Robbins PD (abril de 1995). "El producto del gen de susceptibilidad al retinoblastoma se une directamente al factor asociado a la proteína de unión a TATA humana TAFII250". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 92 (8): 3115–9. Bibcode :1995PNAS...92.3115S. doi : 10.1073/pnas.92.8.3115 . PMC 42115 . PMID  7724524. 
  18. ^ Shao Z, Siegert JL, Ruppert S, Robbins PD (julio de 1997). "Rb interactúa con TAF(II)250/TFIID a través de múltiples dominios". Oncogene . 15 (4): 385–92. doi : 10.1038/sj.onc.1201204 . PMID  9242374.
  19. ^ Gegonne A, Weissman JD, Singer DS (octubre de 2001). "La unión de TAFII55 a TAFII250 inhibe su actividad de acetiltransferasa". Proc. Natl. Sci. USA . 98 (22): 12432–7. Bibcode :2001PNAS...9812432G. doi : 10.1073/pnas.211444798 . PMC 60071 . PMID  11592977. 
  20. ^ Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (junio de 1997). "Interacciones NF-Y-TBP que se unen a CCAAT: NF-YB y NF-YC requieren dominios cortos adyacentes a sus motivos de plegamiento de histonas para la asociación con residuos básicos de TBP". Nucleic Acids Res . 25 (11): 2174–81. doi :10.1093/nar/25.11.2174. PMC 146709 . PMID  9153318. 
  21. ^ Ruppert S, Wang EH, Tjian R (marzo de 1993). "Clonación y expresión de TAFII250 humano: un factor asociado a TBP implicado en la regulación del ciclo celular". Nature . 362 (6416): 175–9. Bibcode :1993Natur.362..175R. doi : 10.1038/362175a0 . PMID  7680771. S2CID  4364676.
  22. ^ O'Brien T, Tjian R (mayo de 1998). "Análisis funcional del dominio quinasa N-terminal TAFII250 humano". Mol. Cell . 1 (6): 905–11. doi : 10.1016/s1097-2765(00)80089-1 . PMID  9660973.
  23. ^ Lin CY, Tuan J, Scalia P, Bui T, Comai L (diciembre de 2002). "El factor regulador del ciclo celular TAF1 estimula la transcripción del ADN ribosómico uniéndose al activador UBF". Curr. Biol . 12 (24): 2142–6. doi : 10.1016/s0960-9822(02)01389-1 . PMID  12498690.

Lectura adicional

Enlaces externos

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que se encuentra en el dominio público .