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búfer TAE

El tampón TAE es una solución tampón que contiene una mezcla de base Tris , ácido acético y EDTA .

En biología molecular, se utiliza en electroforesis en agarosa , típicamente para la separación de ácidos nucleicos como el ADN y el ARN . [1] Está compuesto por un tampón Tris-acetato , generalmente a pH 8,3, y EDTA , que secuestra cationes divalentes. TAE tiene una capacidad tampón menor que TBE y puede agotarse fácilmente, pero el ADN lineal de doble cadena corre más rápido en TAE.

Anteriormente, Brody & Kern simplificó los tampones electroforéticos sustituyendo los tampones TBE y TAE por medios conductores más eficientes y económicos en sistemas de gel. [2]

Usos

El tampón TAE (Tris-acetato-EDTA) se utiliza como tampón de ejecución y en geles de agarosa. [3] También se ha descrito su uso en métodos de electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante para análisis de mutaciones de amplio rango. [4] TAE se ha utilizado en diversas concentraciones para estudiar la movilidad del ADN en solución con y sin cloruro de sodio . [5] Sin embargo, las altas concentraciones de cloruro de sodio (y muchas otras sales) en una muestra de ADN retardan su movilidad. Esto puede dar lugar a interpretaciones incorrectas del patrón de bandas de ADN resultante.

Preparación

El tampón TAE se prepara comúnmente como una solución madre 50X para uso en laboratorio. Se puede preparar una solución madre de 50X disolviendo 242 g de base Tris en agua, añadiendo 57,1 ml de ácido acético glacial y 100 ml de solución de EDTA 500 mM (pH 8,0) y elevando el volumen final a 1 litro. Esta solución madre se puede diluir 49:1 con agua para obtener una solución de trabajo 1x. Esta solución 1X contendrá Tris 40 mM, ácido acético 20 mM y EDTA 1 mM.

2 M = 2000 mM entonces 2000 mM /50 = 40 mM para 1×.
1M = 1000 mM entonces 1000 mM /50 = 20 mM para 1×.
50 mM/50 = 1 mM para 1×.

En primer lugar, estos ingredientes se deben disolver en 500 ml y luego completar hasta 1000 ml.
Nota: El EDTA tardará más en disolverse, por lo que mientras se disuelve el EDTA utilice un agitador magnético (pocas cantidades de EDTA en 3 o 4 veces).

Una receta paso a paso del método de preparación del tampón TAE 50× está disponible en protocols.io. [6]

Ver también

Referencias

  1. ^ Ogden, RC y Adams, DA, (1987) Electroforesis en geles de agarosa y acrilamida. Métodos Enzymol ., 152 :, 61-87.
  2. ^ Brody, JR, Kern, SE (2004) Historia y principios de los medios conductores para la electroforesis de ADN estándar. Bioquímica anal. 333(1):1-13. doi :10.1016/j.ab.2004.05.054 PMID  15351274 PDF
  3. ^ Sambrook, Fritsch y Maniatis (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual , 2ª ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, Nueva York, volumen 3, apéndices B.11 y B.23 ISBN 0-87969- 309-6 
  4. ^ Hayes, VM et al., (1999) Mejoras en la composición del gel y las condiciones electroforéticas para el análisis de mutaciones de amplio rango mediante electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante. Ácidos nucleicos Res ., 27 (20): e29. PMID  10497279
  5. ^ Stellwagen, E. y Stellwagen, NC (2002) La movilidad de la solución libre de ADN en tampones Tris-acetato-EDTA de diferentes concentraciones, con y sin NaCl añadido. Electroforesis , 23 (12): 1935-1941. PMID  12116139
  6. ^ Behle, Anna; Pawlowski, Alice (6 de abril de 2018). "Receta para búfer TAE 50x". doi : 10.17504/protocols.io.gtvbwn6. {{cite journal}}: Citar diario requiere |journal=( ayuda )