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Streptomyces albidoflavus

Streptomyces albidoflavus es una especie de bacteria del género Streptomyces que ha sido aislada del suelo de Polonia . [1] [3] [4] [5] Streptomyces albidoflavus produce ftalato de dibutilo y estreptotricinas. [6] [7]

ARN pequeño no codificante

Los pequeños ARN bacterianos participan en la regulación postranscripcional. Mediante secuenciación profunda se analizó el transcriptoma de S. albidoflavus al final del crecimiento exponencial. Se identificaron 63 ARN pequeños. La expresión de 11 de ellos fue confirmada mediante transferencia Northern. Se demostró que los ARNs solo estaban presentes en especies de Streptomyces . [8]

El ARNs scr4677 ( SRNA 4677 de Streptomyces coelicolor ) se encuentra en la región intergénica entre el gen SCO4677 del factor anti-sigma y un supuesto gen de proteína reguladora SCO4676 . La expresión de scr4677 requiere la actividad de SCO4677 y el propio ARNs de scr4677 parece afectar los niveles de las transcripciones asociadas a SCO4676 . [9]

Se han identificado objetivos de dos de los ARN no codificantes de S. albidoflavus . Se demostró que el ARN no codificante de la glutamina sintetasa I modula la producción de antibióticos. [10] El pequeño ARN scr5239 ( ARNs de Streptomyces coelicolor aguas arriba de SCO5239) tiene dos objetivos. Inhibe la expresión de agarasa DagA mediante emparejamiento directo de bases con la región codificante de dagA y reprime la traducción de la metionina sintasa metE (SCO0985) en el extremo 5' de su marco de lectura abierto. [11] [12]

Síntesis de ácidos grasos

Está disponible una estructura cristalina de S. albidoflavus [proteína portadora de acilo] S -maloniltransferasa . La ACP S -MT de S. albidoflavus participa tanto en la síntesis de ácidos grasos II como en la policétido sintasa y es estructuralmente similar al análogo de Escherichia coli . [13]

Uso en biotecnología

Las cepas de S. albidoflavus producen varios antibióticos , entre ellos actinorhodina , metilenomicina , undecilprodigiosina , [14] y perimicina . [15] [16] Ciertas cepas de S. albidoflavus se pueden utilizar para la expresión de proteínas heterólogas . [17]

reparación de ADN

El homólogo de Ku es SCF55.25c. Contiene un dominio similar a la fosfatasa alcalina de camarón (similar a SAP) en el extremo C-terminal . S. albidoflavus produce una proteína (supuestamente) de dominio único SC9H11.09c que es homóloga a la LigD NucDom, que es común a muchas LigD bacterianas. ( Las LigD son una subfamilia de ADN ligasas . En las bacterias, muchas, pero no todas, las LigD tienen dominios de nucleasa adicionales ramificados desde el dominio de ligasa central universalmente presente . Si está presente, como en este caso, el dominio de nucleasa es una extensión del extremo N. ) [ 18]

Genética

El genoma consta de una única molécula lineal y, aunque se esperaría que Ku realizara el mantenimiento final, hasta ahora no se ha observado nada. [18]

Ver también

Referencias

  1. ^ ab LPSN bacterio.net
  2. ^ Información sobre la cepa de Streptomyces albidoflavus
  3. ^ ab UniProt
  4. ^ ab Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen [1]
  5. ^ Swiontek Brzezinska, M.; Jankiewicz, U.; Burkowska, A. (2013). "Purificación y caracterización de componentes antifúngicos de Streptomyces albidoflavus". Bioquímica y Microbiología Aplicadas . 49 (5): 451. doi :10.1134/S0003683813050025. S2CID  17097515.
  6. ^ Roy, enfermera registrada; Laskar, S.; Sen, SK (2006). "Ftalato de dibutilo, el compuesto bioactivo producido por Streptomyces albidoflavus 321.2". Investigación Microbiológica . 161 (2): 121–6. doi : 10.1016/j.micres.2005.06.007 . PMID  16427514.
  7. ^ Estuardo Shapiro (1989). Regulación del metabolismo secundario en actinomicetos . Prensa CRC. ISBN 0-8493-6927-4.
  8. ^ Vockenhuber MP, Sharma CM, Statt MG, Schmidt D, Xu Z, Dietrich S, et al. (mayo de 2011). "Identificación basada en secuenciación profunda de pequeños ARN no codificantes en Streptomyces coelicolor". Biología del ARN . 8 (3): 468–77. doi :10.4161/rna.8.3.14421. PMC 3218513 . PMID  21521948. 
  9. ^ Moody MJ, Jones SE, Elliot MA (1 de enero de 2014). "Dinámica intraoperónica compleja mediada por un pequeño ARN en Streptomyces coelicolor". MÁS UNO . 9 (1): e85856. Código Bib : 2014PLoSO...985856H. doi : 10.1371/journal.pone.0085856 . PMC 3896431 . PMID  24465751. 
  10. ^ D'Alia D, Nieselt K, Steigele S, Müller J, Verburg I, Takano E (febrero de 2010). "El ARN no codificante de la glutamina sintetasa I modula la producción de antibióticos en Streptomyces coelicolor A3 (2)". Revista de Bacteriología . 192 (4): 1160–4. doi :10.1128/JB.01374-09. PMC 2812974 . PMID  19966003. 
  11. ^ Vockenhuber MP, Suess B (febrero de 2012). " El ARNs scr5239 de Streptomyces coelicolor inhibe la expresión de agarasa mediante emparejamiento directo de bases con la región codificante de dagA ". Microbiología . 158 (Parte 2): 424–435. doi :10.1099/mic.0.054205-0. PMID  22075028.
  12. ^ Vockenhuber MP, Heueis N, Suess B (1 de enero de 2015). "Identificación de metE como segunda diana del sRNA scr5239 en Streptomyces coelicolor". MÁS UNO . 10 (3): e0120147. Código Bib : 2015PLoSO..1020147V. doi : 10.1371/journal.pone.0120147 . PMC 4365011 . PMID  25785836. 
  13. ^ Blanco, Stephen W.; Zheng, Jie; Zhang, Yong-Mei; Roca, Charles O. (2005). "La biología estructural de la biosíntesis de ácidos grasos tipo II". Revista Anual de Bioquímica . Revisiones anuales . 74 (1): 791–831. doi : 10.1146/annurev.biochem.74.082803.133524. ISSN  0066-4154. PMID  15952903.
  14. ^ Brian P, Riggle PJ, Santos RA, Champness WC (junio de 1996). "Regulación negativa global de la síntesis de antibióticos de Streptomyces coelicolor mediada por un supuesto sistema de transducción de señales codificado por absA". Revista de Bacteriología . 178 (11): 3221–31. doi :10.1128/jb.178.11.3221-3231.1996. PMC 178074 . PMID  8655502. 
  15. ^ Liu CM, McDaniel LE, Schaffner CP (marzo de 1972). "Fungimicina, biogénesis de su fracción aromática". La revista de antibióticos . 25 (3): 187–8. doi : 10.7164/antibióticos.25.187 . PMID  5034814.
  16. ^ Lee CH, Schaffner CP (mayo de 1969). "Perimicina. La estructura de algunos productos de degradación". Tetraedro . 25 (10): 2229–32. doi :10.1016/S0040-4020(01)82770-8. PMID  5788396.
  17. ^ "Streptomyces coelicolor". Centro John Innes. Archivado desde el original el 19 de octubre de 2005 . Consultado el 25 de enero de 2010 .
  18. ^ ab Lanzador, Robert S.; Brissett, Nigel C.; Doherty, Aidan J. (2007). "Unión de extremos no homólogos en bacterias: una perspectiva microbiana". Revista Anual de Microbiología . Revisiones anuales . 61 (1): 259–282. doi : 10.1146/annurev.micro.61.080706.093354. ISSN  0066-4227. PMID  17506672.

Otras lecturas

enlaces externos


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