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ARN SgrS

SgrS ( ARN relacionado con el transporte de azúcar , anteriormente llamado ryaA ) [ 1] es un ARN pequeño de 227 nucleótidos que es activado por SgrR en Escherichia coli durante el estrés de glucosa -fosfato. La naturaleza del estrés de glucosa-fosfato no se entiende completamente, pero está correlacionada con la acumulación intracelular de glucosa-6-fosfato . [2] SgrS ayuda a las células a recuperarse del estrés de glucosa-fosfato mediante el apareamiento de bases con el ARNm ptsG (que codifica el transportador de glucosa) y causando su degradación de una manera dependiente de la ARNasa E. [3] [4] El apareamiento de bases entre SgrS y el ARNm ptsG también requiere Hfq , una chaperona de ARN requerida con frecuencia por los ARN pequeños que afectan sus objetivos a través del apareamiento de bases. [5] La incapacidad de las células que expresan sgrS para crear nuevos transportadores de glucosa conduce a una menor captación de glucosa y niveles reducidos de glucosa-6-fosfato . El SgrS es un ARN pequeño inusual, ya que también codifica un polipéptido funcional de 43 aminoácidos , el SgrT, que ayuda a las células a recuperarse del estrés de glucosa-fosfato al impedir la captación de glucosa. La actividad del SgrT no afecta los niveles de ARNm ptsG de la proteína PtsG. [2] Se ha propuesto que el SgrT ejerce sus efectos a través de la regulación del transportador de glucosa, PtsG. [6] [7]

SgrS se descubrió originalmente en E. coli, pero desde entonces se han identificado homólogos en otras Gammaproteobacteria, como Salmonella enterica y miembros del género Citrobacter . [8] Se ha desarrollado un enfoque de predicción de objetivos basado en genómica comparativa que emplea estos homólogos y se utilizó para predecir el objetivo de SgrS, ptsI (b2416), que posteriormente se verificó experimentalmente. [9]

Referencias

  1. ^ Vanderpool CK, Gottesman S (noviembre de 2004). "Participación de un nuevo activador transcripcional y un ARN pequeño en la regulación postranscripcional del sistema de la glucosa fosfoenolpiruvato fosfotransferasa". Microbiología molecular . 54 (4): 1076–89. doi : 10.1111/j.1365-2958.2004.04348.x . PMID  15522088. S2CID  24804508.
  2. ^ ab Wadler CS, Vanderpool CK (diciembre de 2007). "Una función dual para un ARN pequeño bacteriano: SgrS realiza una regulación dependiente del apareamiento de bases y codifica un polipéptido funcional". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (51): 20454–9. doi : 10.1073/pnas.0708102104 . PMC 2154452 . PMID  18042713. 
  3. ^ Vanderpool CK, Gottesman S (marzo de 2007). "El nuevo factor de transcripción SgrR coordina la respuesta al estrés de glucosa-fosfato". Journal of Bacteriology . 189 (6): 2238–48. doi :10.1128/JB.01689-06. PMC 1899371 . PMID  17209026. 
  4. ^ Rice JB, Vanderpool CK (mayo de 2011). "El ARN pequeño SgrS controla la acumulación de azúcar-fosfato regulando múltiples genes PTS". Investigación de ácidos nucleicos . 39 (9): 3806–19. doi :10.1093/nar/gkq1219. PMC 3089445 . PMID  21245045. 
  5. ^ Kawamoto H, Koide Y, Morita T, Aiba H (agosto de 2006). "Requisitos de apareamiento de bases para el silenciamiento de ARN por un ARN pequeño bacteriano y aceleración de la formación de dúplex por Hfq". Microbiología molecular . 61 (4): 1013–22. doi : 10.1111/j.1365-2958.2006.05288.x . PMID  16859494. S2CID  35533720.
  6. ^ Maki K, Morita T, Otaka H, ​​Aiba H (mayo de 2010). "Una región mínima de apareamiento de bases de un ARN pequeño bacteriano SgrS necesaria para la represión traduccional del ARNm de ptsG". Microbiología molecular . 76 (3): 782–92. doi :10.1111/j.1365-2958.2010.07141.x. PMID  20345651. S2CID  39687800.
  7. ^ Kawamoto H, Morita T, Shimizu A, Inada T, Aiba H (febrero de 2005). "Implicación de la localización de la membrana del ARNm diana en la acción de un ARN pequeño: mecanismo de regulación postranscripcional del transportador de glucosa en Escherichia coli". Genes & Development . 19 (3): 328–38. doi :10.1101/gad.1270605. PMC 546511 . PMID  15650111. 
  8. ^ Horler RS, Vanderpool CK (septiembre de 2009). "Los homólogos del ARN pequeño SgrS están ampliamente distribuidos en bacterias entéricas, pero han divergido en tamaño y secuencia". Nucleic Acids Research . 37 (16): 5465–76. doi :10.1093/nar/gkp501. PMC 2760817 . PMID  19531735. 
  9. ^ Wright PR, Richter AS, Papenfort K, Mann M, Vogel J, Hess WR, Backofen R, Georg J (septiembre de 2013). "La genómica comparativa potencia la predicción de dianas para ARN pequeños bacterianos". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 110 (37): E3487-96. Bibcode :2013PNAS..110E3487W. doi : 10.1073/pnas.1303248110 . PMC 3773804 . PMID  23980183. 

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