Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
La lectina tipo Ig 12 que se une al ácido siálico , o Siglec-XII , es una proteína que en los humanos está codificada por el gen SIGLEC12 . [3] [4] [5]
Las lectinas similares a inmunoglobulinas que se unen al ácido siálico ( SIGLEC ) son una familia de proteínas de la superficie celular que pertenecen a la superfamilia de las inmunoglobulinas . Median las interacciones proteína-carbohidrato uniéndose selectivamente a diferentes fracciones de ácido siálico presentes en los glicolípidos y las glicoproteínas . Este gen codifica un miembro de la subfamilia de SIGLEC similares a SIGLEC3. Los miembros de esta subfamilia se caracterizan por un dominio similar a inmunoglobulina de conjunto V extracelular seguido de dos dominios similares a inmunoglobulina de conjunto C2 y los motivos citoplasmáticos basados en tirosina, ITIM y similares a SLAM.
Se ha demostrado que la proteína codificada, tras la fosforilación de la tirosina, recluta a las fosfatasas de tirosina-proteína SHP1 y SHP2 que contienen el dominio de homología Src 2. Se ha sugerido que la proteína está involucrada en la regulación negativa de la señalización de los macrófagos al funcionar como un receptor inhibidor . Este gen se encuentra en un grupo con otros genes similares a SIGLEC3 en 19q13.4.
Se han descrito variantes de transcripción empalmadas alternativamente que codifican isoformas distintas para este gen. [5]
La proteína Siglec-XII ha sido identificada como un posible promotor de la progresión del carcinoma humano en una investigación realizada por Ajit Varki y Nissi Varki en la Facultad de Medicina de la Universidad de California en San Diego. [6] Aproximadamente el setenta por ciento de los humanos tienen una mutación que inactiva la proteína, pero aquellos que no tienen la mutación pueden sufrir una cantidad desmesurada de carcinomas en comparación con otros primates. [7] La investigación se está llevando a cabo para determinar si la inactivación del gen podría disuadir su efecto promotor sobre la progresión del carcinoma humano.
Referencias
- ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000254521 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Foussias G, Taylor SM, Yousef GM, Tropak MB, Ordon MH, Diamandis EP (junio de 2001). "Clonación y caracterización molecular de dos variantes de empalme de un nuevo miembro putativo del subgrupo de Siglecs similar a Siglec-3". Biochem Biophys Res Commun . 284 (4): 887–99. doi :10.1006/bbrc.2001.5052. PMID 11409877.
- ^ Yu Z, Lai CM, Maoui M, Banville D, Shen SH (junio de 2001). "Identificación y caracterización de S2V, un nuevo siglec putativo que contiene dos dominios similares a Ig del conjunto V y recluta SHP de fosfatasas de proteína-tirosina". J Biol Chem . 276 (26): 23816–24. doi : 10.1074/jbc.M102394200 . PMID 11328818.
- ^ ab "Entrez Gene: SIGLEC12 se une al ácido siálico y se convierte en lectina tipo Ig 12".
- ^ SS Siddiqui et al., La pseudogenización polimórfica específica para humanos de SIGLEC12 protege contra la progresión avanzada del cáncer , FASEB BioAdvances, 3:69–82, 2021
- ^ Jones, Asher, La proteína “rebelde” podría contribuir a las altas tasas de cáncer en humanos , The Scientist, 1 de abril de 2021
Lectura adicional
- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5'". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Angata T, Varki NM, Varki A (2001). "Una segunda mutación exclusivamente humana que afecta la biología del ácido siálico". J. Biol. Chem . 276 (43): 40282–7. doi : 10.1074/jbc.M105926200 . PMID: 11546777.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
- Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). "La Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), un esfuerzo a gran escala para identificar nuevas proteínas humanas secretadas y transmembrana: una evaluación bioinformática". Genome Res . 13 (10): 2265–70. doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697 . PMID 12975309.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa". Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID: 14702039.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa del NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)". Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928 . PMID 15489334.
