stringtranslate.com

Proteína Rop

Rop (también conocido como represor de cebador , o como modulador de ARN uno ( ROM )) es una pequeña proteína dimérica responsable de mantener bajo el número de copias de la familia ColE1 y plásmidos bacterianos relacionados en E. coli al aumentar la velocidad de apareamiento entre el ARN precebador, ARN II, y su ARN antisentido , ARN I. [1] Estructuralmente, Rop es una proteína de haz de cuatro hélices homodímera formada por la interacción antiparalela de dos monómeros hélice-giro-hélice . La estructura de la proteína Rop se ha resuelto con alta resolución. [2] Debido a su pequeño tamaño y estructura conocida, Rop se ha utilizado en el trabajo de diseño de proteínas para reorganizar su topología helicoidal y rediseñar sus regiones de bucle. [3] En general, el haz de cuatro hélices se ha utilizado ampliamente en el trabajo de diseño de proteínas de novo como un modelo simple para comprender la relación entre la secuencia de aminoácidos y la estructura.

Control de replicación de ColE1
Control de replicación de ColE1

Enlaces externos

Referencias

  1. ^ del Solar G, Espinosa M (agosto de 2000). "Control del número de copias de plásmidos: una historia en constante crecimiento". Microbiología molecular . 37 (3): 492–500. doi : 10.1046/j.1365-2958.2000.02005.x . PMID  10931343.
  2. ^ Banner, David W.; Kokkinidis, Michael; Tsernoglou, Demetrius (agosto de 1987). "Estructura de la proteína Rop ColE1 con una resolución de 1,7 Å". Journal of Molecular Biology . 196 (3): 657–675. doi :10.1016/0022-2836(87)90039-8. PMID  3681971.
  3. ^ Kresse, HP; Czubayko, M.; Nyakatura, G.; Vriend, G.; Sander, C.; Bloecker, H. (1 de noviembre de 2001). "Topología de haz de cuatro hélices rediseñada: variantes monoméricas de la proteína Rop con diferentes disposiciones de bucles". Diseño e ingeniería de proteínas . 14 (11): 897–901. doi :10.1093/protein/14.11.897. PMID  11742109.